样本准确性与测序工作流程的文库制备步骤有关。该阶段会将DNA片段化并进行文库构建。文库中的每个片段最终都将与一个测序read对应,因此片段大小的高度一致性和文库多样性是均匀覆盖整个基因组的关键。
文库制备阶段出现的错误,例如非多样性文库导致的片段丢失,会使测序仪无法识别。基因组中未进入文库的部分无法进行测序,导致数据集存在缺口。
此外,质量分值无法反映此步骤引入的错误,原因是测序信号清晰、无误。大部分测序平台所能达到的最佳准确性均受样本准确性的影响。
因此,使用高质量的文库制备解决方案(例如TruSeq和其他Illumina技术)极为重要。
我们的接头连接文库制备技术,又称TruSeq技术,长期以来一直以覆盖度均一性高、链信息精确和可靠而著称。 如今该技术进一步得到完善。 最近的技术创新使纯化、样本转移和移液的步骤更少,工作流程效率得以提高。
了解更多TruSeq试剂盒提供了一种简单、方便的文库制备方法以及值得信赖的文库制备结果。预混试剂和简单、支持自动化的工作流程可最大限度地减少手动操作时间并减少人为错误。热门TruSeq文库制备产品包括:
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检测准确性与测序工作流程的第二阶段有关,包括簇生成、DNA测序和初步数据分析。质量分值一般会反映该阶段出现的任何错误,
检测错误与样本错误不同,可通过成熟的碱基质量分值体系进行追踪。
检测错误可通过重新测序、单端read修正或编码方案得到改善。
了解有关质量分值的更多信息算法准确性与工作流程的二级数据分析阶段有关,通常涉及比对和变异检出。比对方法的准确性至关重要。
无论测序仪器提供的数据如何优质,次佳的比对都会导致最终数据集欠佳,还可能存在错误匹配、覆盖不均匀以及大量缺口。反过来将可能导致假阳性和假阴性率偏高。同样,变异检出方法本身也需要较高的准确性。
Illumina提供了用户友好的生物信息学工具,使研究人员能够进行准确比对和变异检出。
探索生物信息学工具可靠的、扩展自如的全转录组分析(RNA-Seq)解决方案适用于各种物种与样本类型,包括人类、小鼠与福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本。
用有限的DNA制备全基因组测序文库,并高效分析样本。
这些试剂盒提供简单的高性价比解决方案,可直接从总RNA生成miRNA和小RNA测序文库,几乎适用于任何物种。