致病变异发现
致病变异发现简介
高通量基因组学技术可快速筛查大量样本并找出与疾病相关的致病变异。许多单核苷酸多态性（SNP）和拷贝数变异（CNV）均与疾病相关。
致病变异鉴定有助于进一步研究靶标基因，从而发现疾病机制。
通过基因组数据了解功能
Tuuli Lappalainen博士通过整合基因组和转录组测序数据介绍了人类基因组的功能性变异。
鉴定致病变异的SNP基因分型
通过芯片或新一代测序（NGS）技术可进行基因组的大规模研究。通过这些研究结果可获得具有统计学意义的疾病相关性，并确定可进一步研究的潜在目标致病变异。
使用芯片技术鉴定SNP
使用芯片技术进行大规模基因组相关性研究（GWAS），能够一次性检测成千上万个样本。GWAS对于鉴定与疾病相关的常见变异非常有效，有助于发现用于进一步研究的多个基因。
使用NGS鉴定SNP
虽然芯片技术对于研究常见变异非常有效，但其对罕见变异的检测并不理想。全外显子组及全基因组测序是用于检测罕见或复杂疾病中致病变异的常用方法。个体或家系测序是及其灵敏且无偏好的变异检测方法，相比芯片方法，可检出更多潜在变异。
用于致病变异发现的CNV检测
CNV是一种可导致一个或多个基因拷贝数异常的基因组改变现象，通常由结构重排引起。像SNP一样，某些拷贝数变异与疾病易感性有关。
使用芯片技术进行CNV检测
基于芯片的方法对于新发CNV（父母基因中不存在或不是遗传自父母）的检测十分有效，可提供可靠的大规模分析。通过该方法，您可以分析扩增、缺失、重排以及拷贝中性的杂合性丢失等遗传性变异。
Illumina提供用于CNV检测的多种芯片解决方案，以促进致病变异发现研究:
- CytoSNP-850K BeadChip芯片可全面覆盖与高疾病风险相关的细胞遗传学相关基因。
- 使用Human genotyping arrays可以经济有效地进行大规模全基因组及全表型组研究。
使用NGS进行CNV检测
基因分型芯片虽然对于大规模的CNV检测非常有效，但其在检测小片段CNV（＜5万碱基对）时灵敏度欠佳。NGS可提供碱基对级别的分辨率，能够检测芯片技术无法检出的小CNV片段。该优势可用于复杂疾病的遗传性缺失研究。测序技术的高分辨率与芯片技术的高通量互补，从而可进行更为全面的基因组研究。
相关链接
靶向富集
采用强大的基于杂交的富集工作流程对外显子组或大量基因（例如超过50个基因）进行可靠地测序。
药物遗传学与心血管疾病
了解研究人员如何利用Illumina芯片鉴定失败的胆固醇药物试验中的应答基因型。
全基因组关联研究
全基因组关联研究（GWAS）让研究人员可快速扫描大量受试者的全基因组，找到疾病相关变异。