人类微生物组分析
了解NGS如何推动针对整个微生物群落基因组的研究，包括那些无法培养的生物体的基因组。
鸟枪法宏基因组测序技术帮助研究人员对给定的复杂样本中存在的所有生物体的所有基因进行全面采样1,2。微生物学家可以利用这种新一代测序（NGS）方法评估细菌多样性，并检测各种环境中微生物的丰度。鸟枪法宏基因组学还可以用来研究不可培养的微生物，其他方法很难或无法分析这些微生物3。
鸟枪法宏基因组测序
使用NGS同时对数千种生物体进行测序
什么是鸟枪法宏基因组测序？
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为什么测序深度对鸟枪法宏基因组学很重要
测序深度是指与基因组参考区域比对的测序读数的数量。这一点很重要，因为更高的测序深度提供了更有力的证据来证明结果的正确性。尽管鸟枪法宏基因组测序很全面，但与16S测序相比，这种方法分析成本昂贵且复杂。低深度鸟枪法测序是弥补两种方法缺点的有效替代方法，与全面的鸟枪法测序相比，读数深度更低，同时与16S测序相比，能够获得更高的鉴别能力和可重现的结果4。
鸟枪法宏基因组测序的应用
推荐的鸟枪法宏基因组学工作流程
文库制备
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鸟枪法宏基因组测序指南
阅读本指南，了解如何对重要疾病的复杂微生物样本进行测序，或深入了解群落水平的微生物多样性和功能。
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参考文献
- Quince, C., Walker, A., Simpson, J. et al. Shotgun metagenomics, from sampling to analysis. Nat Biotechnol. 2017; 35, 833–844. doi: 10.1038/nbt.3935
- Deng, X., Achari, A., Federman, S. et al. Metagenomic sequencing with spiked primer enrichment for viral diagnostics and genomic surveillance. Nat Microbiol. 2020; 5, 443–454. doi: 10.1038/s41564-019-0637-9
- Sharpton TJ. An introduction to the analysis of shotgun metagenomic data. Front Plant Sci. 2014; Jun 16;5:209. doi: 10.3389/fpls.2014.00209
- La Reau, A.J., Strom, N.B., Filvaroff, E. et al. Shallow shotgun sequencing reduces technical variation in microbiome analysis. Sci Rep 2023; 13(1). doi: 10.1038/s41598-023-33489-1