低质量/FFPE RNA-Seq解决方案
实现FFPE样本的RNA-Seq分析
FFPE及其他低质量样本的RNA测序（RNA-Seq）分析可为疾病研究提供宝贵线索。过去，这些有价值的数据大多无法获取。Illumina最新的FFPE RNA-Seq解决方案现可帮助研究人员获取关键数据，并从降解的样本中生成高质量结果。
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了解如何克服FFPE RNA测序的难题。
用于FFPE和低质量样本的mRNA-Seq
mRNA sequencingmRNA测序（mRNA-Seq）是一种准确分析编码转录组的经济有效的方法。将测序预算集中用于信使RNA的检测可提高样本通量并降低每个样本的成本，有助于发现选择性剪接、融合转录本和编码变异等新特征。1,2
RNA外显子组捕获测序突破了传统poly-A法在捕获编码转录组方面的局限；这种传统方法不能用于FFPE RNA-Seq分析。这种方法采用序列特异性捕获技术，与多聚腺苷酸化转录本的存在无关，因此是检测FFPE、降解样本以及低起始量样本的理想mRNA-Seq方法。
用于FFPE和低质量样本的总RNA-Seq
总RNA测序（总RNA-Seq）能够最完整地呈现转录组，从而可在单次实验中同时分析编码RNA和多种形式的非编码RNA。
总RNA-Seq可提供高度准确的转录本丰度信息，并能够检测基因融合、转录本亚型、cSNP和等位基因特异性表达等新特征。
FFPE RNA-Seq的质量控制建议
FFPE组织的提取方法通常会产生高度降解的RNA。查看我们的FFPE质量控制建议，确定您的FFPE样本是否适合作为Illumina文库制备试剂盒的起始材料。
查看要点
References
- Wang Z, Gerstein M, Snyder M. RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics. Nat Rev Genet. 2009;10:57–63.
- Wilhelm BT, Landry JR. RNA-Seq—quantitative measurement of expression through massively parallel RNA sequencing. Methods. 2009;48:249–57.