信息学基础架构和流程设置

合适的设施使发现成为可能

简化生物信息学和数据分析流程,让您专注于重要的工作

生物信息学基础架构和流程考虑因素

如果下一个重大突破与基因组学无关,但却改变了分析基因组数据的生物信息学流程怎么办?在Illumina,我们相信,您设置的生物信息学基础架构——从测序仪到分析工具都对成功极为重要。

无论现在还是未来,生物信息学和基因组学数据分析的跨学科属性要求建立一个有助于合作,并能最有效可靠地处理和分析基因组数据的生物信息学流程。设置一个全新的新一代测序(NGS)系统或简单地向已有系统添加内容需要仔细考虑和计划。

自建还是购买信息学工具?

实验室通常需要权衡:是从信誉良好的供应商处采购生物信息学工具,还是采用内部定制方案。自主开发工具的成本往往高于采购成本,而以用户为中心设计的商业软件通常更便于工作人员使用。

许多实验室认为,若能找到满足大部分需求、具备定制灵活性且拥有完善技术支持的工具,采购将是更合理的资源配置方式。了解近期决定采购LIMS的几家实验室的经验。

阅读文章:采购LIMS的四大理由

实验室自动化的益处

引入自动化可解决高通量基因组学实验室面临的一些常见挑战,例如确保一致性和重现性。LIMS提供:

  • 样本追踪和标准化报告功能
  • 自动化的文库制备
  • 将仪器和液体处理机器人整合到工作流程中
  • 样本、测试和结果的端到端管理
深入了解LIMS

实现信息学工作流落地

通过测序系统集成、可扩展的通量以及直观的界面来选择和定制数据分析工作流,转变您的生物信息学运营方式。使用 Illumina Connected Analytics,数据可通过即用型 DRAGEN 二级分析流程或自定义流程实现自动分析,具体取决于指定的工作流。了解更多:

Illumina Connected Analytics
DRAGEN 二级分析
生物信息学流程升级

了解杰克逊实验室数据分析流程的升级如何加速该实验室的工作,提升其快速理解大型复杂基因组和外显子组数据集的能力。

阅读文章

测序实验室自动化

探索专为生产级测序实验室设计的解决方案,涵盖自动化文库制备、高通量测序仪器、大规模数据分析与管理、多重测序等。聆听已成功建立高通量测序实验室的科学家经验分享。了解更多:

高通量测序
文库制备自动化

芯片实验室自动化

我们为开展基于芯片的基因分型和甲基化研究的实验室提供液体处理机器人、芯片上样仪及其他自动化方案。这些方案有助于简化检测流程,整合样本制备与芯片扫描。了解更多:

高通量基因分型
芯片自动化方案
专为基因组学实验室设计的LIMS

BaseSpace Clarity LIMS是我们的实验室信息管理系统。本系统专为基因组学实验室设计,并针对NGS进行了优化。BaseSpace Clarity LIMS可与仪器整合,帮助实验室追踪和管理样本,并简化实验室的整体操作。与复杂的自建系统相比,BaseSpace Clarity LIMS在设计时充分考虑了终端用户的感受,便于实验室人员更迅速地掌握操作方法。

查看产品

数据共享与合作

准备发表数据

测序数据传统上对非生物信息学专家而言较难理解。Illumina 解决方案提供专为生物学家设计的直观报告格式,且可直接用于发表。

研究人员只需点击按钮即可启动工作流,输出用户友好的报告,便于与 collaborators 或公共数据库共享。

合作

共享大量数据一直以来都不理想,其中涉及复杂的FTP协议、硬盘限制和设备接口不兼容等问题。

Illumina Connected Analytics和BaseSpace Sequence Hub使与信任的合作者共享数据变得极其简单。用户只需点击按钮,即可分享单次测序运行或整个项目。数据可随时随进行共享和访问。

共享解决方案

用于基因组分析的应用程序

BaseSpace Sequence Hub App为四种最常见的生物学应用简化了基因组数据。

阅读数据表
BaseSpace Sequencing Hub

用于NGS数据管理和分析的Illumina云端基因组学计算环境。该平台通过简化的数据共享促进合作和创新。

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BaseSpace Clarity LIMS

LIMS能帮助实验室追踪样本,并优化工作流程。实验室管理员可以从移动设备访问实时数据并及时告知利益相关者或合作者。

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样本管理

轻松管理样本和设置实验

高通量基因组学实验室通常会面临管理/跟踪样本和设计定制检测的难题。我们提供的用户友好型工具可助您更好地启动和管理测序和芯片项目。

该信息学工具可帮助您导入生物学样本信息、设计和合并文库、准备测试运行、创建定制靶向测序panel以及生成样本表。

高通量实验室的样本管理

现代基因组学研究所生成的数据量非常惊人。随着数据量和样本通量的不断增加,实验室需要一种更为现代化的方式,以简化实验室操作并降低成本。

实验室信息管理系统(LIMS)是一款协助您高效管理样本和相关数据的软件。通过这款软件,实验室可实现工作流程自动化和仪器整合,实验室效率大大提高。

深入了解LIMS

简单的测序实验设置

使用Illumina测序系统专业软件可轻松设置和运行测序实验,用户可根据所使用的Illumina测序仪选择合适的软件工具。

了解有关实验设置的更多信息

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标准品和质量控制的重要性

随着NGS技术的快速发展,对所生成的海量数据进行质量控制是很关键的一步。Illumina提供了在测序实验中使用对照DNA标准品的指南,帮助研究人员获得可靠的数据和实验结果。

了解更多

测序文件格式

从FASTQ和BCL文件格式到原始测序文件转换,我们的工具可提供成功的二级或三级分析所需的NGS数据格式。

测序实验设置

BaseSpace Sequence Hub、Illumina Experiment Manager和BaseSpace Clarity LIMS的“准备”选项卡使设置和运行测序实验比以往更轻松。

实验室信息管理系统(LIMS)

了解什么是LIMS,它如何帮助基因组学实验室进行样本追踪、工作流程自动化及下游数据分析。