Infinium Global Screening Array-24 Kit
基因分型芯片为群体遗传学、药物基因组学研究和精准医疗研究提供了一种可扩展且经济的解决方案。
开启创新探索
基于芯片的解决方案为检测遗传和表观遗传变异提供了独一无二的基因组获取和准确性
Infinium芯片产品线可为基因组研究提供经济高效的解决方案,包括基因分型和甲基化分析,从而在一个平台上实现多种应用的发现。
成熟的因美纳Infinium化学技术每周可处理数十万个样本,用于表观基因组学、农业基因组学、细胞遗传学等领域。
可扩展的工作流程和自动化支持选项为向大规模群体研究过渡提供了一种简单的方法。有了Infinium芯片,您可以灵活地开展广泛且大规模的基因组项目。
Infinium检测方法包括扩增、片段化、沉淀和重悬、杂交、延伸、染色和成像。每一步骤均旨在简化样本制备,同时支持无限的多重分析。
Infinium检测方法包括扩增、片段化、沉淀和重悬、杂交、延伸、染色和成像。每一步骤均旨在简化样本制备,同时支持无限的多重分析。
来自Van Andel研究所的Peter Laird讨论了小鼠DNA甲基化芯片的开发,该芯片包含296,070个代表小鼠DNA甲基化生物学多样性的探针。了解探针的设计以及评估芯片准确性、可重现性和稳定性的验证研究。
Infinium检测工作流程从起始DNA到自动化基因型报告,总周转时间为3天。
试验起始材料为基因组DNA(200 ng)。在第1天进行过夜扩增。
步骤1: 步骤1:
第2天,扩增产物进行酶切法片段化。经过乙醇沉淀和DNA重悬后,将样本上样到BeadChip芯片中进行过夜杂交,DNA会通过此过程与互补探针退火结合。
步骤2: 扩增DNA片段化
步骤3: 沉淀重悬
步骤4: 准备BeadChip芯片
步骤5: 在BeadChip上杂交样本
第3天,通过酶促碱基延伸赋予等位基因特异性,然后进行荧光染色和成像。
步骤6: 在BeadChip上扩展/染色样本
步骤7: BeadChip成像
步骤8: 自动检出基因型并生成报告
因美纳提供各种BeadChip规格的定制和半定制基因分型panel。研究人员可以使用在线DesignStudio Microarray Assay Designer软件设计专属的内容panel。该在线工具兼容Infinium iSelect高分辨率(HD)、iSelect高通量筛查(HTS)和XT iSelect Custom BeadChip,可靶向任何物种的单核苷酸多态性(SNP)和插入/缺失(indel)。
扩增后步骤可在LIMS-ready Tecan Freedom EVO 150液体处理系统上进行。BeadChip扫描在iScan芯片扫描仪上进行,该仪器具有免手动操作的AutoLoader可选功能,能提高效率。
样本类型可能因使用的芯片而异,但大多数支持唾液、血液、实体瘤、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本和口腔拭子。
每个芯片具有不同的格式,因此样本数量因购买的芯片而异。
Infinium I检测方法中,每个基因位点使用两个探针来确定任何给定基因位点的两个潜在靶标等位基因的相对强度比(即两种磁珠类型,每个等位基因一种);而Infinium II检测方法中,每个基因位点需要一个探针(即两个等位基因使用一种磁珠类型)。因此,两种检测方法的优势互补,增强了芯片的覆盖广度。
与因美纳的专家交流,深入了解Infinium芯片。
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