在进行新一代测序工作流程之前,先分离纯化核酸,随后进行文库制备。文库在Illumina测序仪上进行测序,该系统旨在支持广泛的应用场景和通量需求。生成的数据随后被分析,以获取有价值的见解。
NGS实验的整体工作流程从遗传物质的分离开始。核酸从诸如组织块、单个细胞或生物液体等样本中分离出来。提取后,大多数NGS工作流程需要进行质量控制(QC)步骤。我们建议使用紫外分光光度法进行纯度评估,以及荧光法进行核酸定量。
在Illumina测序仪上,核苷酸以推荐的读长(在测序仪上读取的DNA片段的长度)和深度(每个样本获得的“读数”的数量)进行读取,这取决于特定的使用场景。
Illumina采用经过验证的边合成边测序(SBS)化学技术,通过检测单个碱基在生长中的DNA链中的结合来实现测序。有多种测序平台可供选择,以支持广泛的通量和应用场景,因此无论您的研究问题是什么,它们都能帮助您通过简单的按键操作流程更快地获得答案。
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了解Illumina新一代测序技术,该技术能够实现大规模并行测序。
NextSeq 1000和NextSeq 2000测序仪采用XLEAP-SBS化学技术——这是迄今为止因美纳最快的、质量最高的、最稳健的边合成边测序(SBS)化学技术。
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生物信息学工具用于解读Illumina测序仪产生的由A、T、G、C组成的序列,也就是所谓的读取序列。
如今,NGS分析已经非常易于获取。一些仪器配备了内置的即用型机载数据分析功能,这使得没有生物信息学背景或预算聘请额外的实验室人员的新用户也能轻松上手。Illumina Connected Software portfolio提供了多功能、可集成且易于获取的数据分析解决方案,以推动高影响力的研究。
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本电子书概述了NGS分析工作流程,并介绍了用于分析基因表达和调控数据的Illumina Connected Software解决方案。
根据您的样本类型,有多种第三方RNA分离试剂盒可供选择。
适用于小 panel:靶向重测序、宏基因组学、小基因组测序、靶向基因表达分析等。
适用于大 panel:靶向测序、RNA测序、单细胞方法、外显子测序等。