NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂盒
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂盒，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep通过简单、可扩展的无微流控工作流程，让更多实验室能够使用单细胞RNA-Seq（scRNA-Seq）。研究人员能够开展更大规模、更多样的多组学研究，而不受其他单细胞方法的预算或技术限制。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
易于使用且高度可扩展的单细胞RNA-Seq解决方案，可实现mRNA捕获、条码编制和文库制备，无需复杂的工作流程或微流控技术
从细胞捕获到文库制备大约需要15小时
分析时间
10分钟用于细胞捕获
手动操作时间
100 至 200,000 个细胞
起始量
概述
可扩展且灵活的解决方案
Illumina Single Cell 3' RNA Prep可以轻松地扩展处理规模，支持从数百到数十万个细胞。更高的细胞通量得以揭示稀有细胞类型。该分析方法也非常灵活，可以在进行样本多重分析的同时并行运行1个样本或多达96个样本。
高质量性能
Illumina Single Cell 3' RNA Prep可提供高转录本和基因灵敏度，生成您期望从因美纳获取的高质量数据。这种温和的分离技术有助于检测其他方法经常漏检的脆弱细胞。该分析方法可兼容定制的单细胞测量，适用于扩展的多组学应用。
便捷的工作流程
Illumina Single Cell 3' RNA Prep不需要昂贵的微流控设备或劳动密集型方案。您可以使用简单、具有灵活停止点的手动工作流程在工作台上进行单细胞研究。
简单且可扩展的工作流程
样本制备
使用涡旋混合器创建模板化乳液，从而捕获单细胞 mRNA 并对其进行条形码编码。
文库制备
生成cDNA并准备单细胞文库以用于测序。
测序
在NGS测序仪上进行测序，以匹配您研究的规模。
分析
使用DRAGEN和Partek软件分析和可视化单细胞数据。
规格
| Assay time | 从细胞捕获到文库制备大约需要15小时 |
|---|---|
| Content specifications | 捕获编码转录组 |
| Description | 单细胞mRNA捕获、条形码化和文库制备采用简单手动工作流程，具有高转录本灵敏度和成本效益的可扩展性。 |
| Hands-on time | 10分钟用于细胞捕获 |
| Input quantity | 100 至 200,000 个细胞 |
| 系统 | NextSeq 550系统, NextSeq 2000系统, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, 研究模式下的NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000系统, NovaSeq X Plus基因测序仪 |
| Mechanism of action | PIPseq技术 |
| 方法 | mRNA测序 |
| 多重分析 | 多达96重 |
| 核酸类型 | RNA |
| 特殊的样本类型 | 血液, 不兼容FFPE, 低起始量样本, 骨髓, 单细胞 |
| 物种 | 任意, 小鼠, 酵母, 斑马鱼, 人 |
| 链特异性 | 非链 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 转录本变异 |
需要的产品
Illumina Single Cell 3' RNA Prep包括细胞捕获和文库制备试剂。根据您想要检测的细胞数量选择合适规格的试剂盒。此外，也可以分别购买 Illumina Single Cell 3' RNA Capture 和 Illumina Single Cell Library Prep。
如果需要在每次运行中多重标记超过 8 个样本，请使用Illumina Single Cell Unique Dual Indexes。如果需要输入单个细胞核，请使用 Illumina Single Cell Nuclei Isolation Kit。如果需要富集自定义 RNA 标签序列，请使用 Illumina Single Cell Supplemental Enrichment和扩增试剂盒。
新用户应订购 Illumina Single Cell Prep入门设备，以获取所需的辅助设备。
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结果
应用
单细胞RNA-Seq用于神经科学研究
神经组织是包含多种细胞类型的复杂组织，这些细胞在生物体的整个生命周期中不断重组和重塑。scRNA-Seq是一种宝贵的工具，可利用转录敏感性对神经元细胞群的真实多样性进行分类，从而深入了解神经元组织：
- 神经发育和神经退行性疾病
- 特定神经元群以前未知的作用
- 神经免疫细胞对疾病和发育的影响
单细胞RNA-Seq用于癌症研究
癌症是一种涉及复杂细胞群动态和多样性的疾病。了解驱动癌症的细胞类型和突变需要复杂的方法。scRNA-Seq已成为一种重要工具，可用于：
- 详细了解肿瘤微环境的异质性
- 识别新型癌症生物标志物
- 了解免疫疗法和耐药性的机制
单细胞RNA-Seq用于免疫学
免疫系统由不同细胞类型的复杂层次结构组成，这些细胞协同工作以识别、标记和消除病原体。scRNA-Seq可帮助研究人员：
- 了解免疫细胞群的发育和分化途径
- 评估免疫细胞群的作用和功能
- 研究对病原体的免疫反应
工作流程示例
制备
Illumina Single Cell 3' RNA Prep
计划推荐
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 2000系统 |
|
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000系统 | 每次运行的样本数 (双流动槽)： |
2 × 100 bp |
| NovaSeq X Plus基因测序仪 |
|
2 × 100 bp |
相关应用和方法
通过单细胞RNA测序，您可以研究通常被批量采样隐藏的细胞差异。探索高通量和低通量的单细胞测序方法。
单细胞测序使研究人员能够从单个细胞内的DNA、RNA、表观遗传和蛋白质水平了解癌症的驱动因素。
使用多组学分析来提升发现能力，更好地将基因型与表型相关联。
数据图
利用PIPseq化学技术捕获单细胞mRNA并进行条码编制
使用涡旋混合器制备模板化乳液，来捕获单细胞mRNA并对其进行条码编制。生成cDNA并制备用于测序的单细胞文库。在NGS测序仪上测序，以匹配您的研究规模。使用DRAGEN和Partek软件分析scRNA-Seq数据。
数千个细胞规模的高分辨率scRNA-Seq
条码等级图（左）和Barnyard散点图（右）显示了NIH3T3（小鼠）和HEK 293（人）细胞系混合培养物的有效分离。使用Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T2试剂盒捕获4106个细胞，多重率小于5%。
数万个细胞规模的高分辨率scRNA-Seq
单细胞RNA-Seq用于分析冷冻保存的人外周血单核细胞（PBMC）。针对使用Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T20试剂盒捕获的31,613个细胞进行UMAP分析，可分离出多种免疫细胞群。
数十万个细胞规模的高分辨率scRNA-Seq
单细胞RNA-Seq用于分析冷冻组织中的小鼠大脑细胞核。针对使用Illumina Single Cell 3ʹ RNA Prep T100试剂盒捕获的155,000个细胞核进行UMAP分析，可分离出多种脑细胞群。
相关资源
Watch: The Illumina 3' Single Cell RNA Prep Workflow
Illumina 3' Single Cell RNA Prep工作流程
了解Illumina 3' Single Cell RNA Prep工作流程如何使单细胞测序变得简单、经济且无需微流控技术。凭借适用于各种细胞类型、经过验证的性能和可靠、高质量的数据，该方法能以单细胞分辨率更轻松地解码研究，为您的下一个突破提供动力。
Complete prep workflow products (4)
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T2 (8个样本, 2000个细胞/样本)
20135689
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T2（8个样本），包含Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达2000个细胞的cDNA合成的试剂。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T10 (8个样本, 10,000个细胞/样本)
20135691
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T10（8个样本），包含Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达10,000个细胞的cDNA合成的试剂。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T20 (4个样本, 20,000个细胞/样本)
20135692
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T20（4个样本），包含Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达20,000个细胞的cDNA合成的试剂。
Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T100 (2个样本, 100,000个细胞/样本)
20135693
Illumina Single Cell 3' RNA Prep，T100（2个样本），包含 Illumina单细胞文库制备试剂以及用于单细胞mRNA捕获、条形码标记以及每个样本多达10万个细胞的cDNA合成的试剂。
Prep component products (5)
Illumina Single Cell Library Prep (8 reactions)
20132789
Illumina Single Cell Library Prep (8 reactions), used following Illumina Single Cell 3' RNA Capture.
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 samples, 2000 cells/sample)
20132790
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 2000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 samples, 10,000 cells/sample)
20132791
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 10,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4 samples, 20,000 cells/sample)
20132792
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 20,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2 samples, 100,000 cells/sample)
20132793
Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 100,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.
配套产品 (3)
Illumina Nuclei Isolation Kit (4 samples)
20132795
Illumina Nuclei Isolation Kit (4 samples), optional reagents for nuclei isolation, washing, and resuspension for input into Illumina Single Cell 3' RNA Prep.
Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification Kit
20132794
Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification (SEA) Kit, optional reagents for use with Illumina Single Cell 3' RNA Capture and Illumina Single Cell Library Prep for custom single-cell applications.
Illumina Single Cell Prep Starter Equipment
20132796
Illumina Single Cell Prep Starter Equipment, one-time purchase accessory equipment required to prepare Illumina Single Cell 3' RNA kits and Illumina Single Cell Library Prep kits.
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常见问题解答
Illumina Single Cell 3' RNA Prep采用PIPseq技术和粒子模板即时分区（PIPs）技术。PIPs可以将复杂的细胞混合物分隔成多个小液滴，这些小液滴中包含带条码的模板颗粒，这使单细胞应用的处理变得更加简单，例如单细胞RNA测序（scRNA-Seq）。
是的，我们的涡旋混合器和干浴设备是获取可靠结果的必需设备。涡旋混合器专为实现一致的乳化而设计。干浴设备可确保精确的温度曲线；常规的干浴设备无法实现我们裂解方案中所述的快速温度变化。
可以，可以使用已经过证明的Fluent DSP/甲醇固定方案来处理细胞或细胞核。目前不兼容多聚甲醛（PFA）固定方法。
不能，目前只能进行3’ mRNA捕获。
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结果
NovaSeq X系列试剂盒
NovaSeq X系列试剂盒包含试剂卡盒、缓冲液卡盒、流动槽、冻干插件、预装缓冲液和文库联管。
NovaSeq 6000试剂盒
用于NovaSeq 6000基因测序仪的试剂盒，由即用型预装试剂卡盒和流动槽组成。
Illumina DRAGEN™ V4 Server
通过DRAGEN二级分析获得更多基因组见解，了解最新更新信息，阅读常见问题解答并寻找产品支持。
Illumina Stranded mRNA Prep
快速、经济高效的工作流程，通过精确测量链信息准确、无偏差地检测蛋白质编码转录组。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Illumina RNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，针对各种样本类型和RNA起始量生成富集并标记的测序文库。
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