Tuberculosis (TB) Surveillance

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结核病监测以应对世界卫生危机

结核病(TB)监测是根除结核病的重要手段之一,结核病是仅次于COVID-19的全球第二大传染病杀手1 ,由结核分枝杆菌复合群(MTBC)中的细菌引起,包括结核分枝杆菌(Mtb)。尽管结核病是一种可治疗的疾病,但耐多药结核病(MDR-TB)仍能引发公共卫生危机,是卫生安全威胁之一1 。基于基因组的TB监测可以在以下方面为公共卫生人员提供支持:

  • 检测Mtb和非TB菌种
  • 表征抗TB药物耐药性
  • 追踪传播路径
  • 监测分枝杆菌的进化,以及对现有和新疗法具有抗药性的新型突变

新一代测序的鉴别能力能够更快、更可靠地应对疫情。

app note Illumina genomics architecture

NGS:用于检测、表征和根除结核病的创新方法

NGS推动耐药结核病(DR-TB)研究走得更远。这本内容丰富的电子书概述了DR-TB的历史和全球影响,详细介绍了如何利用NGS推动实现世界卫生组织终结结核病的目标,并概述了可应用于结核病基因组调查和研究的因美纳工作流程。

立即下载电子书

基因组分析用于检测耐药结核病

耐药结核病(DR-TB)由结核分枝杆菌复合群(MTBC)引起,该复合群对一种或多种抗结核病药物具有耐药性,是限制病原体诊断、治疗和根除的主要挑战2。因此,检测和表征这些菌株是疾病监测的重要工作之一。

基于新一代测序(NGS)的解决方案,如靶向NGS(tNGS)和全基因组测序(WGS),在DR-TB检测方面具有关键优势,具体如下。

靶向新一代测序的优势
样本制备
  • 直接利用样本,无需及时培养
检测能力
  • 对Mtb进行基因分型和间隔区寡核苷酸分型
  • 靶向耐药性标志物,用于广泛的抗结核耐药性检测
  • 检测异源抗性亚群
重点检测
  • 检测Mtb和非TB分枝杆菌菌株
  • 准确表征核苷酸水平的遗传多态性
全基因组测序的优势
样本制备
  • 利用培养的分离株
检测能力
  • 用于变异检测和耐药性机制的全基因组序列数据,不受先验知识的限制
重点检测
  • 无偏差表征全基因组,用于高分辨率流行病学研究
  • 全基因组可满足任何分析需求

利用全基因组测序(WGS)和靶向扩增子测序)(tNGS)推动结核病防治工作

在2023年世界防治结核病日,三位杰出的结核病研究人员探讨了他们如何利用NGS来帮助实现终结结核病的目标。​​

  • Tim Rodwell教授介绍了NGS技术,并详细比较了WGS和tNGS方法。
  • Vitali Sintchenko教授讨论了他如何在实验室中使用WGS来应对结核病防治中面临的挑战。
  • Melanie Grobbelaar博士介绍了她和她的实验室如何使用tNGS与耐药结核病作斗争。
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特色产品

Featured product for Genoscreen Deeplex Myc-TB combo kit
Illumina and Genoscreen Deeplex Myc-TB Combo Kit

该试剂盒是一个tNGS panel,可鉴定MTBC菌株和分枝杆菌种类,同时为MTBC菌株的基因分型和耐药性突变预测提供解决方案。这是一种全面的、无需培养的结核病耐药性鉴定解决方案,可在48小时内快速得出结果。

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特色产品

Featured product for Genoscreen Deeplex Myc-TB combo kit
Illumina and Genoscreen Deeplex Myc-TB Combo Kit

一种全面、无需培养的解决方案,可在不到48小时内快速表征 TB 耐药性。

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世界防治结核病日是为了纪念Robert Koch博士于1882年3月24日宣布了导致结核病的病原菌。世界防治结核病日促使公众认识到结核病持续造成的破坏性影响,以及我们在控制和预防过程中面临的挑战。

参考文献

  1. who.int/news-room/fact-sheets/detail/tuberculosisWHO.com
  2. Castro RAD, Borrell S, Gagneux S. The within-host evolution of antimicrobial resistance in Mycobacterium tuberculosis. FEMS Microbiol Rev. 2021 Aug 17;45(4) doi: 10.1093/femsre/fuaa071