传染病是全球人类发病和死亡的主要原因1。高通量、无培养的方法，例如新一代测序（NGS），正在引领科学家开展传染病研究，并监测由病毒、细菌、真菌和寄生虫引起的流行病和疫情2。与以前的技术相比，NGS在识别病原体、检测遗传变化、发现新机制和基因等方面提供了速度、深度和准确性3。因美纳开发了单基因组、多病原体和发现测序法等NGS策略，以及推进传染病研究的前沿解决方案。
利用新一代测序的强大功能革新传染病研究
以高通量、快速且准确的方式推动传染病发现
使用NGS进行传染病研究
用于传染病研究的NGS工作流程
传染病研究的测序过程可能很复杂。幸运的是，各种基于NGS的方法可优化您的工作流程和结果获取的效率。根据您的样本需求，单基因组、多病原体和发现测序工作流程可为微生物学和传染病研究应用提供全套解决方案。
单基因组测序
当对单一病原体或已知靶标进行测序时，单基因组测序是理想之选。这种方法可帮助您获得有关病原体的种类、菌株和基因型的基因组学宝贵见解，以及有关病原体如何对抗菌剂产生反应的预测性见解。单基因组测序可通过培养分离株的全基因组测序或靶向扩增子测序来完成。阅读更多内容，了解如何根据应用使用每种方法。
多病原体测序
当怀疑存在某些病原体时，杂交捕获富集是一种理想的解决方案。它们能够对多种生物体进行靶向或全基因组测序，而无需对未富集文库进行鸟枪法测序时所需的高读数深度。请参阅以下使用杂交捕获富集的具体示例。
杂交捕获富集可提供急性上呼吸道感染的全面但临床相关的微生物学特征。了解研究人员如何利用因美纳的Explify平台通过杂交捕获技术快速鉴定和表征上呼吸道微生物。深入了解靶向微生物测序
精准宏基因组学为建立有效检测方法研究复杂尿路感染（UTI）的病原体提供了潜力。在本文中，研究人员利用Illumina Urinary Pathogen ID/AMR Panel，通过NGS方法鉴定泌尿道病原体。
发现测序
发现测序工作流程非常适用于原始样本的真正无偏分析。16S rRNA测序或鸟枪法DNA/RNA测序可使用原始样本（例如，痰液和下呼吸道抽吸物）分析复杂微生物群落中存在的遗传物质。阅读实际报告，了解如何利用发现测序来表征病原体。
了解16S rRNA测序如何以更高准确度识别病原体，从而减少培养阴性感染的抗生素使用量。
科学家们证实，与传统的桑格16S测序相比，鸟枪法宏基因组测序可能显示出更好的细菌检测能力。在本报告中，了解鸟枪法宏基因组技术在肝脓肿病原学诊断中的微生物学分析价值。
NGS工作流程查找工具
消除后续工作流程中的猜测。NGS工作流程查找器提供个性化的解决方案建议和资源，以便您可以放心地进行测序。
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下载此电子书，了解精准宏基因组学如何通过新一代测序的强大功能提供快速检测和表征病原体的创新解决方案。
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参考文献
- World Health Organization. Mortality and global health estimates. who.int/data/gho/data/themes/mortality-and-global-health-estimates. Accessed September 13, 2024.
- Gwinn M, MacCannell D, Armstrong GL. Next-Generation Sequencing of Infectious Pathogens. JAMA. 2019;321(9):893–894. doi:10.1001/jama.2018.21669
- Liu, J., Zhang, Q., Dong, YQ. et al. Diagnostic accuracy of metagenomic next-generation sequencing in diagnosing infectious diseases: a meta-analysis. Sci Rep 2022; 12(1), doi: 10.1038/s41598-022-25314-y