微生物基因组学

利用新一代测序的强大功能革新传染病研究

以高通量、快速且准确的方式推动传染病发现

使用NGS进行传染病研究

传染病是全球人类发病和死亡的主要原因1。高通量、无培养的方法，例如新一代测序（NGS），正在引领科学家开展传染病研究，并监测由病毒、细菌、真菌和寄生虫引起的流行病和疫情2。与以前的技术相比，NGS在识别病原体、检测遗传变化、发现新机制和基因等方面提供了速度、深度和准确性3。因美纳开发了单基因组、多病原体和发现测序法等NGS策略，以及推进传染病研究的前沿解决方案。  

Pipetting into 8 lane plate in wet lab, close-up

用于传染病研究的NGS工作流程

传染病研究的测序过程可能很复杂。幸运的是，各种基于NGS的方法可优化您的工作流程和结果获取的效率。根据您的样本需求，单基因组、多病原体和发现测序工作流程可为微生物学和传染病研究应用提供全套解决方案。

单基因组测序

当对单一病原体或已知靶标进行测序时，单基因组测序是理想之选。这种方法可帮助您获得有关病原体的种类、菌株和基因型的基因组学宝贵见解，以及有关病原体如何对抗菌剂产生反应的预测性见解。单基因组测序可通过培养分离株的全基因组测序或靶向扩增子测序来完成。阅读更多内容，了解如何根据应用使用每种方法。

对季节性循环流感病毒进行测序

了解 MiSeq i100 系列如何与富集流程相结合，实现快速可靠的目标测序，用于流感检测与全基因组表征，克服常见扩增难题，支持灵活高效的 NGS 工作流程。

阅读应用说明： 使用 MiSeq i100 系列对季节性流感病毒进行测序

利用全基因组测序鉴定细菌

阅读案例：对培养分离株进行全基因组测序（WGS），可绘制基因组图谱以表征或鉴定物种、完成已知菌株的完整组装，甚至比较不同样本间的基因组差异。

阅读文献：实施基于WGS的细菌鉴定

了解更多 细菌WGS信息

利用新一代测序技术解析耐药性结核病的特征

了解科研人员如何借助靶向扩增子测序，在特定基因组区域内分析遗传变异，同时区分微生物与非微生物基因组。该方法流程简洁、准确富集，可高效鉴定并刻画重要目标微生物（如耐药结核杆菌）。

阅读文献：靶向NGS在耐药结核研究中的应用价值

了解更多：结核测序 与 扩增子测序信息

 

 

多病原体测序

当怀疑存在某些病原体时，杂交捕获富集是一种理想的解决方案。它们能够对多种生物体进行靶向或全基因组测序，而无需对未富集文库进行鸟枪法测序时所需的高读数深度。请参阅以下使用杂交捕获富集的具体示例。

急性上呼吸道感染的特征分析

杂交捕获富集可一次性提供既全面又具临床意义的上呼吸道微生物谱。阅读研究者如何借此快速鉴定并表征上呼吸道微生物。

阅读文献：破译急性上呼吸道感染微生物群

了解更多：靶向微生物测序信息

解析泌尿微生物组

精准宏基因组学有望打造高效检测方法，解析复杂尿路感染（UTI）中的病原体。阅读研究者如何利用 Illumina 尿路病原体鉴定/耐药基因检测板，通过 NGS 方法鉴定尿路病原体。

阅读文章：宏基因组学在尿路病原体研究中的优势

查看尿路病原体ID/AMR Panel

探索性测序

当需要对原始样本进行真正无偏分析时，探索性测序流程尤为适用。16S rRNA 测序或鸟枪法 DNA/RNA 测序可直接利用原始样本（如痰液和下呼吸道抽吸物）解析复杂微生物群落中的遗传物质。阅读真实案例，了解探索性测序如何被用于病原体特征分析。

利用16S rRNA测序鉴定病原体

了解在培养阴性的感染中，16S rRNA测序最能锁定病原体，从而显著减少抗生素用量。

阅读文献：16S rRNA测序用于儿童感染研究

了解更多 16S rRNA测序信息

 

比较鸟枪法宏基因组与Sanger 16S测序

研究表明，相比传统Sanger 16S测序，鸟枪法宏基因组测序在细菌检测方面表现更佳。本文献介绍了鸟枪法宏基因组在肝脓肿微生物学鉴定中的应用价值。

阅读文献：鸟枪法宏基因组 vs Sanger 16S测序的阳性结果对比研究

了解更多 鸟枪法宏基因组测序信息

NGS工作流程查找工具

消除后续工作流程中的猜测。NGS工作流程查找器提供个性化的解决方案建议和资源，以便您可以放心地进行测序。

立即查找您的NGS工作流程

传染病电子书

了解NGS如何助力耐药结核病（DR-TB）研究。这本内容丰富的电子书概述了DR-TB的全球影响，详细介绍了如何利用NGS推动实现世界卫生组织终结结核病的目标，并概述了可应用于结核病基因组调查和研究的因美纳靶向和全基因组测序工作流程。

下载此电子书，了解精准宏基因组学如何通过新一代测序的强大功能提供快速检测和表征病原体的创新解决方案。

探索微生物测序解决方案

因美纳提供技术和支持，推进您的微生物学和传染病研究。在本手册中，根据您感兴趣的微生物、样本类型以及您希望通过优化的端到端解决方案解答的问题，了解NGS工作流程和解决方案。

特色产品

Sequencing reagents & flow cells

MiSeq i100系列试剂盒

MiSeq i100 系列试剂采用即用型卡盒设计，并提供多种流动槽配置，带来灵活的测序选择。

Instruments

MiSeq i100系列

简化的操作流程、先进的化学技术和机载信息学提供了易于使用、快速灵活的仪器，支持广泛的应用领域。

Library preparation kits

Nextera XT DNA Library Preparation Kit

提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。

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参考文献

  1. World Health Organization. Mortality and global health estimates. who.int/data/gho/data/themes/mortality-and-global-health-estimates. Accessed September 13, 2024.
  2.  Gwinn M, MacCannell D, Armstrong GL. Next-Generation Sequencing of Infectious Pathogens. JAMA. 2019;321(9):893–894. doi:10.1001/jama.2018.21669
  3. Liu, J., Zhang, Q., Dong, YQ. et al. Diagnostic accuracy of metagenomic next-generation sequencing in diagnosing infectious diseases: a meta-analysis. Sci Rep 2022; 12(1), doi: 10.1038/s41598-022-25314-y