基因组和甲基化组测序

利用因美纳5 碱基基因组解决方案对单个样本的DNA中的遗传和表观遗传碱基进行同时测序

abstract sequencing genome and methylome

甲基化分析的优势

表观遗传修饰(如DNA甲基化)可直接调控基因,而不改变潜在的DNA序列。甲基化组分析可以揭示整个基因组的甲基化模式。这些关于基因调控的见解有助于了解基因突变的影响,并可作为基因表达研究的补充。

5-base DNA methylation diagram

基因组和甲基化组同时测序

结合遗传测序和表观遗传测序的多组学方法,有助于阐明发育和疾病的复杂通路。因美纳5‑碱基基因组解决方案实现了遗传变异和甲基化模式的同时检测。这种新一代测序(NGS)方法通过易用的单次检测,实现了准确的基因组和甲基化组测序。支持因美纳5‑碱基解决方案的专有创新包括:新型转化化学技术,以及用于双DNA和甲基化注释与可视化的高级算法。

缩略图

使用5-碱基基因组进行基因组和甲基化组分析的优势

因美纳5-碱基解决方案为希望了解基因调控的研究人员提供了几大优势。

5-碱基见解: 在单次检测中准确检测遗传变异和甲基化

简便性: 一步转化,在一天内完成文库制备*

灵活性: 兼容不同的样本类型以及全基因组或富集方法

经济性: 提供甲基化组和基因组信息的高效测序

来自单一供应商的无缝解决方案: 因美纳提供从文库制备到分析的解决方案和支持

* 单日文库制备可由试剂盒的全基因组测序版本实现。

因美纳5-碱基解决方案的
工作原理是什么?

传统的甲基化转化技术将未甲基化的胞嘧啶转化为胸腺嘧啶,而因美纳专有的转化化学技术可以选择性地将甲基化的胞嘧啶转化为胸腺嘧啶。由于健康人类基因组中的大多数胞嘧啶都是未甲基化的,因此对甲基化胞嘧啶进行选择性转化可生成更加复杂的文库,当与新型信息学工具相结合时,可提供全面、经济高效的5-碱基见解。

5-碱基检测可取代遗传和表观遗传两项独立检测,以少量增量测序即可获得甲基化信息,能够节省时间和预算。

Novel chemistry allows direct conversion of 5mC to T

新型化学技术可以将5mC直接转化为T。 上排代表起始DNA,下排代表转化的DNA。

常见问题解答

检测DNA甲基化的常用方法,是使用亚硫酸氢盐或酶将未甲基化的C转化为T。这会减少核苷酸多样性,使读数更难比对。亚硫酸氢盐处理还可能造成DNA损伤,导致数据缺失。因美纳5碱基测序化学技术只需简单一步即可直接将5mC转化为T,不仅不会造成DNA损伤,还能保留文库复杂度。

全基因组测序可覆盖整个基因组,而靶向富集测序则专注于选定基因组区域。两种策略都能以单碱基分辨率检测DNA甲基化。

该检测方法兼容多种样本类型,包括游离DNA以及从血液、细胞系或新鲜冷冻组织中提取的DNA。

因美纳5碱基解决方案可检测5-甲基胞嘧啶(5mC)以及未修饰的碱基,包括腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)。DNA甲基化是调控基因表达的关键表观遗传修饰。

5-碱基生物信息学解决方案不需要高级专业知识。它可提供高度准确的变异和甲基化检测。这是一种简单、强大且易于使用的多组学分析解决方案。来自Illumina Connected Multiomics的见解由DRAGEN分析提供支持。

/ 结果

更多资源

5-碱基解决方案海报

该海报展示了利用简洁且的集成式多组学文库制备同时检测基因组和甲基化特征。

缩略图

因美纳5-碱基解决方案应用前景

Cande Rogert博士探索使用因美纳5-碱基基因组解决方案结合DRAGEN分析,进行甲基化图谱分析和变异检测。

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因美纳5-碱基解决方案概述

本篇关于因美纳5-碱基技术的概述,介绍如何更快速、更轻松地解锁双组学见解。

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