Public Health Surveillance
什么是公共卫生监测？
公共卫生监测是了解人口健康状况和为公共卫生决策提供信息的重要工具。它涉及对健康相关数据的系统收集和分析，可用于确定趋势和模式，评估干预措施的有效性，以及规划和评估公共卫生计划。
公共卫生的中心目标之一是在我们的社区内实现公平。公共卫生监测专注于社区范围内的疾病预防和整体健康，不仅改善了我们的生活质量，为我们的社区节省了资金，还能够帮助儿童茁壮成长，减少人们的身心痛苦。
基因组学如何在公共卫生监测中发挥作用？
基因组学可以通过检测和表征新的、新兴的和正在传播的病原体来维护公共卫生和福祉。 通过追踪和监测社区内的病原体传播和疾病传播，我们可以更好地了解病原体特性（传染性和致病性），并绘制变异的进化图。这最终将有助于诊断的发展以及治疗性疫苗和疗法的设计。
Advancing public health surveillance with NGS
The discriminatory power of next-generation sequencing (NGS) is advancing public health surveillance with greater speed, accuracy, and confidence than ever before. Learn more about topics within public health efforts along with diverse solutions offered from Illumina.
废水监测
废水监测可用于社区范围内的新发传染病监测、变异追踪和变异趋势追踪。
结核病监测
NGS检测可以提供有关不同抗结核病药物耐药性的关键监测数据，这对指导结核病控制策略至关重要。
冠状病毒测序
了解高度灵敏的NGS方法，以识别新型冠状病毒突变、追踪传播、研究病毒遗传学等。
医疗相关感染监测
医疗相关感染（HAI）是指在医疗环境中发生的感染，通常由耐多药生物引起。这些感染可导致较高的发病率和死亡率、医疗成本增加和监管不合规。
抗菌药物耐药性检测
微生物可以通过改变基因组来适应抗菌化合物，从而产生耐药性。进一步了解NGS如何以更高的通量来检测低频变异和基因组重排。
用于食品安全监测的NGS方法
了解NGS如何在及早发现、疫情应对和临床研究领域通过灵敏的检测和高通量能力大幅改善食品安全。
利用基因组监测的强大力量做好流行病防范
了解如何利用基于NGS的公共卫生监测来支持传染病大流行防范工作的三个关键方面：及早发现、疫情应对和临床研究。
及早发现
利用NGS获得的基因组信息可通过以下方式及早发现传染病：
- 鉴定新出现的病原体
- 检测人群中的病原体
- 监测环境中潜在的病原体库
疫情应对
应对传染病爆发需要一个广泛的公共卫生专业人员网络。来自NGS的基因组数据可快速表征病原体，以便：
- 追踪本地和全国范围内的传播情况
- 监测值得关注的新变异
- 了解聚集性疫情，为公共卫生优先事项和干预措施提供信息
临床研究
临床研究通过以下方式在识别和表征传染病方面发挥着重要作用：
- 阐释传染病的分子机制
- 诊断和治疗干预措施的设计
- 有效疫苗的开发
Genomic surveillance methods to aid the next pandemic prevention
Up to 75% of new or emerging infectious diseases are estimated to have zoonotic origins.1,2 We now know that zoonotic reservoirs are significant in the spread of pathogens. With NGS, it is possible to screen reservoir animals such as bats to predict and prevent viral pathogen outbreaks.
Infectious disease surveillance with NGS-methods can help us understand interspecies transmission, how zoonotic diseases emerge, spread and become resistant to common therapies, and enable us to better contain, treat and prevent disease outbreaks.
Hybrid capture sequencing can be scaled up to monitor zoonotic pathogens, while genomic surveillance with metagenomics allows for unbiased, culture-free detection and identification of a broad number of pathogens. Metagenomics also helps us understand the relationship between our microbiome and pathogen interactions, which is important when designing measures to control infectious diseases.
Learn more about:
Genomic Surveillance Methods
基于扩增子的文库制备解决方案，用于基因组监测和研究
了解两种新的文库制备解决方案如何帮助公共卫生专业人员利用COVIDSeq工作流程中经过验证的化学方法保障我们的安全。观看视频，了解因美纳微生物扩增子文库制备和llumina Microbial Amplicon Prep—Influenza A/B如何帮助建立、扩展和改进全球基因组监测工作。
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公共卫生监测手册
本手册可供下载，其中概述了基因组学如何在公共卫生监测中发挥作用，以及用于各种监测方法的工具。
参考文献
- Woolhouse ME, Gowtage-Sequeria S. Host range and emerging and reemerging pathogens. Emerg Infect Dis. 2005;11:1842–7. 10.3201/eid1112.050997
- Jones KE, Patel NG, Levy MA, Storeygard A, Balk D, Gittleman JL, et al. Global trends in emerging infectious diseases. Nature. 2008;451:990–3.