公共卫生监测
什么是公共卫生监测？
公共卫生监测是了解人群健康状况并为公共卫生决策提供依据的重要工具。
它涉及对健康相关数据的系统性收集和分析，这些数据可用于识别趋势和模式、评估干预措施的效果以及规划和评估公共卫生项目。
公共卫生的一个核心目标是在我们的社区内实现公平。通过专注于社区范围内的预防和整体健康，公共卫生改善了我们的生活质量，为我们的社区节省了资金，帮助儿童茁壮成长，并减少了人类的痛苦。
基因组学如何在公共卫生监测中发挥作用？
基因组学可以通过检测和表征新的、新兴的和正在传播的病原体来维护公共卫生和福祉。 通过追踪和监测社区内的病原体传播和疾病传播，我们可以更好地了解病原体特性（传染性和致病性），并绘制变异的进化图。这最终将有助于诊断的发展以及治疗性疫苗和疗法的设计。
借助NGS推进公共卫生监测
新一代测序（NGS）的鉴别能力正在以比以往更快的速度、准确性和信心推动公共卫生监测。了解有关公共卫生工作主题的更多信息以及Illumina提供的各种解决方案。
废水监测
污水监测使研究人员能够通过检测、识别和表征污水中的病原体来监测疫情和其他威胁。这种方法可以提供重要的见解，例如在社区内多种病原体的疾病传播情况。
结核病监测
结核病（TB）监测是应对传染病死亡第二大原因的重要步骤。了解基因组学如何通过检测、表征、追踪和监测来支持公共卫生抗击结核病的努力。
冠状病毒测序
了解NGS测序方法如何能够以高灵敏度识别新型冠状病毒突变、追踪传播、研究病毒遗传学等。
医疗相关感染监测
医疗保健相关感染（HAIs）是在医疗保健环境中发生的感染，通常由多重耐药微生物引起。这些感染可能导致显著的发病率和死亡率、增加医疗保健成本以及违反监管要求。
抗菌药物耐药性检测
微生物可以通过基因组变化适应并对抗微生物化合物产生耐药性。进一步了解下一代测序（NGS）如何凭借其前所未有的高通量能力检测低频率变异和基因组排列。
用于食品安全监测的NGS方法
探索NGS如何凭借其灵敏的检测能力和高通量特性，在食品安全的早期检测、疫情应对和临床研究等领域带来显著改进。
利用基因组监测的强大力量做好流行病防范
了解如何利用基于NGS的公共卫生监测来支持传染病大流行防范工作的三个关键方面：及早发现、疫情应对和临床研究。
及早发现
利用NGS获得的基因组信息可通过以下方式及早发现传染病：
- 鉴定新出现的病原体
- 检测人群中的病原体
- 监测环境中潜在的病原体库
疫情应对
应对传染病爆发需要一个广泛的公共卫生专业人员网络。来自NGS的基因组数据可快速表征病原体，以便：
- 追踪本地和全国范围内的传播情况
- 监测值得关注的新变异
- 了解聚集性疫情，为公共卫生优先事项和干预措施提供信息
临床研究
临床研究通过以下方式在识别和表征传染病方面发挥着重要作用：
- 阐释传染病的分子机制
- 诊断和治疗干预措施的设计
- 有效疫苗的开发
基因组监测方法助力预防下一次大流行
据估计，多达75%的新型或新出现的传染性疾病具有人畜共患疾病传染源1,2。我们现在知道，人畜共患疾病宿主在病原体传播中起着重要作用。有了NGS，人们能够筛查蝙蝠等宿主动物，从而预测和预防病毒病原体的爆发。
利用基于NGS的方法进行传染性疾病监测可帮助我们了解跨物种传播、人畜共患传染性疾病出现方式、传播和对常见疗法产生耐受性，并使我们能够更好地控制、治疗和预防疾病爆发。
杂交捕获测序可放大至监测人畜共患疾病病原体，而宏基因组学基因组监测支持对多种病原体进行无偏差、无培养的检测和鉴定。宏基因组学还能帮助我们了解微生物组和病原体相互作用之间的关系，这对于控制传染性疾病措施的制定十分重要。
了解更多：
基因组监测方法
基于扩增子的文库制备解决方案，用于基因组监测和研究
了解两种新的文库制备解决方案如何帮助公共卫生专业人员利用COVIDSeq工作流程中经过验证的化学方法保障我们的安全。观看视频，了解因美纳微生物扩增子文库制备和llumina Microbial Amplicon Prep—Influenza A/B如何帮助建立、扩展和改进全球基因组监测工作。
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参考文献
- Woolhouse ME, Gowtage-Sequeria S. Host range and emerging and reemerging pathogens. Emerg Infect Dis. 2005;11:1842–7. 10.3201/eid1112.050997
- Jones KE, Patel NG, Levy MA, Storeygard A, Balk D, Gittleman JL, et al. Global trends in emerging infectious diseases. Nature. 2008;451:990–3.