癌症RNA测序
了解癌症转录组
利用癌症RNA测序（RNA-Seq）监测基因表达和转录组变化有助于了解肿瘤的分类和进展。癌症积累了许多遗传变化，但通常只有少数变化会推动肿瘤进展。癌症RNA-Seq可帮助科学家：
- 确定癌症样本中表达的变异
- 鉴定与各个肿瘤、单细胞和肿瘤类型相关的基因表达特征和突变谱
- 关注具有明确功能影响的体细胞突变，并鉴定关键的癌症驱动性突变
- 发现新的调控基因表达的小RNA
- 鉴定染色体易位引起的基因融合
癌症RNA测序的关键优势
- 在转录本水平上提供对基因表达的灵敏且准确的测量。
- 提供定性和定量数据。
- 以高特异性和准确性进行测序。
- 保留并追踪mRNA和总RNA工作流程中的链特异性信息。
- 对于福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本和组织等来源的降解RNA，表现出色。
RNA-seq在癌症研究中的潜在应用
充分利用批量RNA-seq的优势，其经过数千篇同行评审的科学文献验证的流程定义极为清晰。易于使用以及较低的实施成本使得RNA-seq成为那些初涉新一代测序（NGS）领域的人获取高质量转录组数据的理想方法。
了解更多关于NGS新手入门的内容RNA-Seq使您能够：
区分癌症中的驱动性突变和乘客突变
尽管癌细胞中存在许多突变，但只有少数突变对癌症的发生和进展有贡献。研究人员可以利用批量RNA-Seq来检测基因组产生的全部RNA转录本。RNA-Seq实验数据可以揭示突变是否导致转录组的改变，这些改变可能驱动癌症的发生，也可能仅仅是乘客突变。
确定潜在的成药通路
RNA-Seq可以揭示癌症中上调或下调的通路。这些功能信息对于确定精准治疗的分子靶点至关重要。例如，靶向上调通路是一种常见的抑制肿瘤生长的方法。
发现与疾病相关的通路
研究癌症样本与非癌组织之间的转录组差异已被证明有助于区分癌症亚型、评估突变的影响、识别生物标志物以及其他变量。
评估生物反应
批量RNA-Seq可以识别与新型癌症治疗（如在模型系统中使用的免疫治疗或利用过去组织样本进行的回顾性研究）相关的基因和通路。
特色癌症RNA-Seq方法
批量RNA-Seq
研究人员可以在单次分析中同时检测已知和新的特征，从而识别转录本亚型、基因融合、单核苷酸变异以及其他特征，而不受先验知识的限制。
单细胞RNA-Seq
了解更多关于单细胞RNA测序的信息，检测单个细胞的转录组，获得细胞间变异的高分辨率视图。
mRNA-Seq
了解mRNA-Seq如何能够识别已知和新的转录本异构体、基因融合及其他特征，以及等位基因特异性表达，从而全面了解编码转录组。
总RNA-Seq
了解总RNA-Seq如何能够准确测量基因和转录本的丰度，并识别已知和新的转录组特征。
CITE-Seq
探索这种方法的独特优势，它可以在单细胞读出中同时定量细胞表面蛋白和转录组数据。
空间转录组学
探索这种方法如何能够提供基因表达模式的拓扑排列，将其映射到组织切片上，从而将结构与活性联系起来。
癌症研究方法指南
《癌症研究方法指南》是一本40多页的综合性资源手册，提供了简单而全面的流程，涵盖广泛的癌症研究应用。该指南包括单细胞测序、空间测序、甲基化分析、多组学、无细胞RNA测序等更多内容。
免费下载指南癌症RNA测序工作流程
文库制备
Illumina Stranded mRNA Prep
一款高性能、快速且完整的全外显子测序试剂盒，包含文库制备和杂交试剂、全面的外显子探针组合、清洁/尺寸选择磁珠以及条形码标签。
Illumina Stranded Total RNA Prep w/ Ribo-Zero Plus
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus为编码RNA和多种非编码RNA的分析提供了卓越的性能。
Illumina RNA Prep for Enrichment
Illumina RNA Prep with Enrichment采用磁珠上的标签化技术，随后进行简化的单次杂交，为基于RNA的文库制备和富集提供了一个快速的工作流程。
测序或芯片
NextSeq 1000和2000基因测序仪
这些具有成本效益、用户友好、中等通量的台式测序仪提供了较高的灵活性，能够支持新的和不断涌现的应用。
NovaSeq X系列
NovaSeq X系列提供了广泛的应用范围，能够在生产规模上支持数据密集型方法。
数据分析
DRAGEN RNA 和 DRAGEN RNA Differential Expression Apps
对NGS数据进行准确、全面的分析，包括比对、定量、融合基因检测以及差异基因表达分析。
Correlation Engine (适用于mRNA)
相关性引擎是一个交互式的组学知识库，能够将私有组学数据与高度策划的公共数据相结合，为数据提供生物学背景。
继续探索
简化癌症研究中RNA融合事件的识别流程
了解癌症研究人员如何使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Trusight panels，以获得癌症相关基因表达和融合检测的针对性结果。
解析长非编码RNA在癌症中的作用
研究人员正在利用RNA-Seq揭示长非编码RNA（lncRNA）如何被用于癌症的识别、测量和治疗。
靶向RNA-Seq
靶向RNA测分析序特定癌症基因和感兴趣的转录本的表达情况。
基因组学和转录组学基础
下载信息图表，快速了解基因组测序和转录组测序的基础知识。
从同一样本中测序DNA和RNA
观看最新的实验室快速入门视频，学习如何为多组学测序准备高质量的DNA和RNA样本。
通过多组学推进癌症研究
了解如何通过多组学将复杂表型的成因和后果联系起来，从而实现以前不可能的发现。