RNA-Seq提供癌症基因表达的功能信息，并揭示驱动肿瘤进展的基因融合。
利用癌症RNA测序（RNA-Seq）监测基因表达和转录组变化有助于了解肿瘤的分类和进展。癌症积累了许多遗传变化，但通常只有少数变化会推动肿瘤进展。癌症RNA-Seq可帮助科学家：
充分利用批量RNA-seq的优势，其经过数千篇同行评审的科学文献验证的流程定义极为清晰。易于使用以及较低的实施成本使得RNA-seq成为那些初涉新一代测序（NGS）领域的人获取高质量转录组数据的理想方法。
尽管癌细胞中存在许多突变，但只有少数突变对癌症的发生和进展有贡献。研究人员可以利用批量RNA-Seq来检测基因组产生的全部RNA转录本。RNA-Seq实验数据可以揭示突变是否导致转录组的改变，这些改变可能驱动癌症的发生，也可能仅仅是乘客突变。
RNA-Seq可以揭示癌症中上调或下调的通路。这些功能信息对于确定精准治疗的分子靶点至关重要。例如，靶向上调通路是一种常见的抑制肿瘤生长的方法。
研究癌症样本与非癌组织之间的转录组差异已被证明有助于区分癌症亚型、评估突变的影响、识别生物标志物以及其他变量。
批量RNA-Seq可以识别与新型癌症治疗（如在模型系统中使用的免疫治疗或利用过去组织样本进行的回顾性研究）相关的基因和通路。
研究人员可以在单次分析中同时检测已知和新的特征，从而识别转录本亚型、基因融合、单核苷酸变异以及其他特征，而不受先验知识的限制。
了解更多关于单细胞RNA测序的信息，检测单个细胞的转录组，获得细胞间变异的高分辨率视图。
了解mRNA-Seq如何能够识别已知和新的转录本异构体、基因融合及其他特征，以及等位基因特异性表达，从而全面了解编码转录组。
了解总RNA-Seq如何能够准确测量基因和转录本的丰度，并识别已知和新的转录组特征。
探索这种方法的独特优势，它可以在单细胞读出中同时定量细胞表面蛋白和转录组数据。
探索这种方法如何能够提供基因表达模式的拓扑排列，将其映射到组织切片上，从而将结构与活性联系起来。
《癌症研究方法指南》是一本40多页的综合性资源手册，提供了简单而全面的流程，涵盖广泛的癌症研究应用。该指南包括单细胞测序、空间测序、甲基化分析、多组学、无细胞RNA测序等更多内容。
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