癌症全基因组测序

研究超出蛋白质编码区域的遗传事件

癌症与匹配的正常DNA的全基因组比较分析(基于WGS)

使用新一代测序(NGS)的癌症全基因组测序(WGS)可提供癌症组织的特有突变的碱基视图。它使发现新的癌症相关变异成为可能,包括单核苷酸位点变异(SNV)、拷贝数变化、插入/缺失(indel)和结构变异。癌症全基因组测序已发现了许多癌症相关变异。WGS还能够提供癌症DNA样本相对于正常DNA样本的基因组变化的全面分析。

癌症基因组含有的点突变、融合和其他异常的数量通常是不可预测的。这些变异中可能有许多是新变异,也可能不在编码区域内,而癌症WGS能够更全面地鉴定这些变异。相比之下,外显子组测序等靶向方法有可能会漏掉特定变异,例如编码区域外的变异。

Close up, side view of a female scientist interacting with the touch screen monitor on a NovaSeq 6000, selecting from the sequencing screen; green status bar; blurry image in the foreground

WGS在癌症研究中优于靶向分子panel的优势

  • 评估生物体或组织的全基因组骨架,进行无偏倚分析,并有可能发现新型癌症相关基因
  • 检测可能尚未与癌症表型关联的基因组特征
  • 发现可能影响癌症进展的基因组非编码区域
  • 揭示致癌病毒的全基因组整合位点

癌症全基因组测序工作流程

因美纳为癌症全基因组测序和肿瘤-正常比较提供了文库制备、测序和数据分析选项。一体化的文库制备工作流程和灵活的试剂盒配置适合多种研究设计。

1
文库制备
2
测序
3
数据分析

肿瘤-正常配对样本测序

通过肿瘤-正常全基因组测序,研究人员可以对肿瘤突变和相匹配的正常样本进行比较。肿瘤-正常的比较对于鉴定在癌症进展中起驱动突变作用的体细胞变异非常重要。

因美纳提供有以下按键式分析工具,助力肿瘤-正常WGS数据的分析。

DRAGEN二级分析

能对WGS数据和其他NGS数据进行准确、快速的分析,可在本地或云端使用,具有体细胞、生殖系和其他应用程序选项。

DRAGEN体细胞检测流程

全面多样的流程包括仅肿瘤模式和肿瘤-正常模式,可用于检测肿瘤样本中的体细胞变异。两种模式都不做倍性假设,能够检测低频等位基因。

特色癌症WGS研究结果

了解一项评估WGS在识别急性骨髓性白血病(AML)特异性体细胞小变异、结构变异(SV)和拷贝数改变(CNA)方面的分析性能的研究。研究结果展示了WGS如何提供血癌样本的全面基因组特征。

了解WGS如何检测在髓系和淋巴系肿瘤中可能被传统方法(如细胞遗传学与荧光原位杂交[FISH])遗漏的染色体改变、结构变异和隐匿性突变。

相关癌症研究资源

癌症研究指南

《癌症研究指南》是一份40多页的综合资源,涵盖测序和芯片方法、解决方案等。

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