RNA外显子组捕获测序

RNA外显子组捕获测序简介

实现对困难样本的高效、准确、灵敏的RNA外显子组分析,而不影响基因融合的检出能力。许多RNA外显子组测序方法只关注确定数量的已知转录本或需要昂贵的深度测序。RNA外显子组捕获测序通过结合RNA-Seq和外显子组富集技术克服了这些挑战。

这种方法只捕获转录组的编码区域,与非外显子组捕获方法相比,具有更高的通量和更低的测序深度。RNA外显子组的序列特异性捕获并不依赖于poly-A尾的存在。这使得RNA外显子组捕获测序成为一种理想的RNA-Seq方案,适用于低质量的样本或起始量有限的材料。

RNA外显子组捕获测序的优势

只需中度的总RNA测序read深度,即可分离转录组编码区域,使信息获取能力最大化。

  • 样本通量高,价格低
  • 专注于以低成本获得高价值内容
  • 从降解样本中获得高质量的数据,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织
  • 起始量需求低(低至10 ng总RNA),同时保持高灵敏度
用NGS进行转录组分析

Illumina杰出的科学家Gary Schroth博士介绍了RNA-Seq技术的最新进展。了解最新的RNA文库制备方法如何让研究人员从具有挑战性的样本(例如单细胞或FFPE组织)中进行转录组分析。

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RNA外显子组捕获测序工作流程

Illumina边合成边测序(SBS)技术是采用最广泛的NGS技术,产生了全世界90%以上的测序数据。*

除了业界领先的数据质量,Illumina还提供集成的RNA外显子组捕获工作流程,简化了从文库制备到数据分析和生物学解读的整个过程。

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*根据Illumina公司2015年存档数据计算