随着生物信息学领域的成熟,RNA测序(RNA-Seq)数据分析比以往更容易。Illumina提供了具有直观用户界面的按键式RNA-Seq软件工具,该工具专为生物学家设计。
这些用户友好型工具支持从基因表达分析到总RNA表达谱分析等多种新一代测序(NGS)研究。
可以在Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub(Illumina多组学云端计算平台)中快速安全地传输、存储和分析RNA-Seq数据。两个平台均提供对DRAGEN Bio-IT平台的云内访问,以便对RNA-Seq和其他NGS数据进行准确、超快速的二次分析。
DRAGEN 采用无损基因组数据压缩技术,最多可将数据存储量缩小 5 倍,同时保留数据完整性。Partek Flow 软件提供用户友好的 RNA-Seq 以及多组学数据的分析和可视化,并兼容来自 DRAGEN 二级分析或任何第三方平台的输入文件,以实现最大程度的灵活性。了解更多信息:
我们的BaseSpace RNA-Seq应用程序:
英属哥伦比亚大学的BRC-Seq核心测序实验室使用了BaseSpace Sequence Hub来分析和共享数据。他们的研究经常涉及对mRNA测序数据的分析,以评估不同实验处理对转录组的影响。BaseSpace工作流程可帮助BRC-Seq追踪样本并为客户提供高质量的测序数据。
阅读访谈录数据分析结束后,结果可以方便地传送至BaseSpace Correlation Engine进行功能注释,以了解基因表达变化引起的生物学效应。这个多组学研究数据库和工具集包含了来自数以千计的公开研究的数据组,能够为生物学解析提供依据。这些信息经过整理和标准化,赋予了数据额外的力量,帮助研究人员按组织、疾病、化合物和/或基因扰动来定义关联。
查看BaseSpace Correlation Engine
查看我们的基因组学云计算环境BaseSpace Sequence Hub中多种方法的样本数据组,或者试用BaseSpace App并交互评估结果。
注意,客户需要登录才能访问BaseSpace Sequence Hub和查看特定数据集。
了解如何执行每个数据分析步骤,从序列读取比对到质量控制(QC)、读取定量、差异基因表达的解读等。
无损基因组数据压缩技术最多可将数据存储量减少五倍,并降低数据存储和传输成本。
这些台式测序系统支持广泛的应用,包括从 mRNA-Seq 到单细胞 RNA-Seq、靶向富集等。