TruSight Oncology 500临床研究解决方案

深入探索癌症,助力精准诊疗

支持临床研究组织或液体活检样本的全景变异分析

Profile image of a female scientist using a single pipette into a tube, two boxes of TruSight Oncology ctDNA v2 Enrichment library prep boxes on the lab bench with other NovaSeq X consumables; two scientists and a NovaSeq X instrument are blurry in the background.

三种检测方法助力精准肿瘤学研究

TruSight Oncology 500产品线提供泛癌种新一代测序分析方法,可在内部实现全景变异分析(CGP)。通过一次整合检测从关键指南和临床试验中识别相关的生物标志物,比反复检测使用更少的样本获得更多的结果。

TruSight Oncology 500产品

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌种panel实现CGP。

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

使用能够检测血浆中ctDNA的关键IO基因特征(TMB、MSI)以及所有主要变异类别的泛癌panel进行CGP分析。

主要特点和优势

全面

在单次多重检测中评估500多种泛癌生物标志物,包括TMB、MSI和HRD*等广泛的基因组特征,无需连续检测即可更好地识别相关突变。

灵活性

FFPE样本或取自液体活检的微创循环肿瘤DNA(ctDNA)可作为组织研究的补充,也可用于无法随时获得足够组织的情况。

可靠性

利用稳定的杂交捕获化学技术、成熟的SBS测序技术和先进的生物信息学分析,实现整个产品组合的一致质量。

内部

为您的实验室提供精准的肿瘤学分析,尽可能减少样本损失、控制周转时间、监测质量,并保留数据以便在获得新发现时进行再分析。

及时

通过本地或云端集成的文库制备、测序和生物信息学选项,可在5天内获得结果。

可扩展

自动化选项可缩短手动操作时间并大幅减少错误。TruSight Oncology和TruSight Oncology High-Throughput每次运行可测序8-192个样本,TruSight Oncology 500 ctDNA每次测序8-48个样本。

关键生物标志物

以上为覆盖多种癌症类型的基因组肿瘤分析生物标志物节选a

泛癌种: BRAF NTRK1 NTRK2 NTRK3 RET MSI TMB

有意义的生物标志物基因b 具有潜在意义的生物标志物基因c
  乳腺癌 BRCA1 BRCA2 ERBB2 ESR1 PALB2 PIK3CA 180
  结直肠癌 ERBB2 KRAS NRAS       166
  骨癌 EGFR ERG ETV1 ETV4 EWSR1 FEV 140
FLI1 FUS H3F3A HEY1 IGH1 MDM2
ERBB2 NCOA2 SMARCB1      
  肺癌 ALK EGFR ERBB2 KRAS MET NUTM1 223
ROS1          
  黑色素瘤 KIT NRAS ROS1       172
  卵巢癌 BRCA1 BRCA2 FOXL2       149
  CNSd APC ATRX CDKN2A CDKN2B EGFR H3F3A 140
HIST1H3B HIST1H3C IDH1 IDH2 MYCN PTCH1
RELA TERT TP53      
  前列腺癌 AR ATM BARD1 BRCA1 BRCA2 BRIP1 151
CDK12 CHEK1 CHEK2 FANCL FGFR2 FGFR3
PALB2 RAD51B RAD51C RAD51D RAD54L  
  甲状腺癌 HRAS KRAS NRAS RET TERT   165
  子宫和宫颈癌 BRCA2 EPC1 ERBB2 ESR1 FOXO1 GREB1 138
JAZF1 NCOA2 NCOA3 NUTM2A NUTM2B PAX3
PAX7 PHF1 POLE SMARCA4 SUZ12 TP53
YWHAE          
  其他实体瘤 ALK APC ARID1A ASPSCR1 ATF1 ATIC 152
BAP1 BCOR BRCA1 BRCA2 CAMTA1 CARS
CCNB2 CDK4 CDKN2A CIC CITED2 CLTC
COL1A1 COL6A3 CREB1 CREB3L1 CREB3L2 CSF1
CTNNB1 DDIT3 DDX3X DNAJB1 DUX4 EED
EGFR ERBB2 ERG ETV1 ETV4 ETV6
EWSR1 FEV FGFR2 FGFR3 FLI1 FOXL2
FOXO1 FOXO4 FUS GLI1 HEY1 HGF
HMGA2 IDH1 KRAS LEUTX MAML3 MDM2
MYB MYOD1 NAB2 NCOA2 NF1 NFATC2
NFIB NR4A3 NRAS NUTMI NUTM2A NUTM2B
PALB2 PATZ1 PAX3 PAX7 PDGFB PDGFRA
PRKACA PRKD1 RANBP2 ROS1 SDHA SDHB
SDHC SDHD SMARCB1 SS18 SSX1 SSX2
SSX4 STAT6 SUZ12 TAF15 TCF12 TERT
TFE3 TFEB TFG TP53 TPM3 TPM4
TRAF7 TSPAN31 VGLL2 WT1 WWTR1 YAP1
YWHAE ZC3H7B        

表中列出的基因和生物标志物只是panel所含基因的一部分。如需查看完整的基因列表,请参阅相应产品页面“产品资料”部分中的产品数据表。

  1. 包括关键指南生物标志物、新兴生物标志物和泛癌生物标志物。内容分析由Velsera提供,基于软件知识库v8.5(2023年2月)。
  2. 与当前药物标签或指南相关的具有意义的生物标志物基因。
  3. 根据在临床试验中出现的情况,具有潜在意义的生物标志物基因。
  4. CNS:中枢神经系统。

产品比较

  TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案) TruSight Oncology 500 ctDNA v2
分析时间 4-5天完成从样本到结果的整个流程 4-5天完成从样本到结果的整个流程 从纯化核酸到变异报告仅需3-4天
自动化功能 自动化工作站 自动化工作站 自动化工作站
自动化详情 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法 探索可用的自动化方法
癌症类型 泛癌种、实体瘤 泛癌种、实体瘤 泛癌种、实体瘤
内容说明 对523个基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。可选的TruSight Oncology 500 HRD试剂盒(暂未在日本推出)内容包含约25K SNP的覆盖范围,可通过由Myriad Genetics提供支持的综合基因组不稳定性评分(LOH+TAI+LST)评估同源重组修复缺陷。 对523个目标基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。
靶向选择523个基因(完整编码序列),panel总共1.94 Mb。
  • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围:TMB和MSI
  • 指南覆盖范围:广泛覆盖多种实体瘤的重要指南
  • 指南覆盖范围:广泛覆盖多种实体瘤的重要指南
说明 该检测方法能够对于FFPE组织进行全景变异分析,并在NextSeq™ 550测序仪或NextSeq™ 550Dx仪器(研究模式)上运行,每次可以批量处理多达8个样本。 使用NextSeq™ 1000、NextSeq™ 2000、NovaSeq™ 6000、NovaSeq™ 6000Dx(研究模式)或NovaSeq™ X系列,通过一体化的工作流程进行高通量全面NGS检测,以识别指南和1000多项临床试验中的关键生物标志物。包括免疫肿瘤学生物标志物TMB和MSI的覆盖范围。 为液体活检样本(血浆ctDNA)的全景变异分析提供了一种非侵入性的研究方法。这种液体活检方法使用微创样本采集方法补充基于组织的CGP,从而提供了关于肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。
手动操作时间 自动化工作流程:约2.5 h
手动工作流程:约10.5 h
自动化工作流程:约2.5 h
手动工作流程:约10.5 h
自动化工作流程:约1.5 h
手动工作流程:约2.5 h
起始量 40 ng DNA和/或40 ng RNA 40 ng DNA和/或40-80 ng RNA 20 ng cfDNA(4 mL血浆)
仪器 NextSeq™ 550测序仪, NextSeq™ 550Dx(研究模式) NextSeq™ 2000测序仪, NextSeq™ 1000测序仪, NovaSeq™ X测序仪, NovaSeq™ X Plus测序仪, NovaSeq™ 6000Dx(研究模式), NovaSeq™ 6000测序仪 NovaSeq X测序仪NovaSeq™ X Plus测序仪, NovaSeq™ 6000测序仪, NovaSeq™ 6000Dx(研究模式)
方法 靶向富集, 靶向DNA测序, 靶向RNA测序 靶向富集, 靶向DNA测序, 靶向RNA测序 靶向富集, 靶向DNA测序
多重分析 多达8-plex

NextSeq™ 1000和2000:P2流动槽运行8个样本,P3流动槽24个样本,P4流动槽36个样本。
NovaSeq™ 6000/Dx:SP流动槽运行16个样本,S1流动槽32个样本,S2流动槽72个样本,S4流动槽192个样本。

NovaSeq™ X系列*:1.5B卡盒分析32个样本,10B卡盒192个样本,25B卡盒480个样本。

NovaSeq™ X系列:1.5B流动槽运行4个样本,10B流动槽24个样本,NovaSeq™ 6000测序仪:S2流动槽运行8个样本,S4流动槽24个样本,最多支持192个标签
核酸类别 RNA, DNA RNA, DNA DNA
样本通量 8个样本/运行 NextSeq™ 1000和2000:8-36个样本/运行,NovaSeq™ 6000/Dx:16-192个样本/运行,NovaSeq™ X:32-480个样本/运行,NovaSeq™ X Plus:32-960个样本/运行 4-48个样本/运行
特殊的样本类型 FFPE组织 FFPE组织 循环肿瘤DNA、血液
物种类别 人类 人类 人类
技术 测序 测序 测序
变异种类 基因融合、转录本变异、单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV)、杂合性缺失(LOH)、体细胞变异、新型转录本、单核苷酸多态性(SNP)、结构变异 基因融合、体细胞变异、新型转录本、结构变异、转录本变异、单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV) 单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV)

常见问题解答

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相关资源

缩略图

TruSight Oncology 500 HRD在Oncopole Toulouse的应用

同源重组修复缺陷(HRD)是卵巢癌的重要生物标志物。聆听法国Oncopole Toulouse实验室的Guillaume Bataillon博士介绍TSO 500 HRD检测方法的性能。

与专家对话

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*HRD is available through an accessory kit to assess the Genomic Instability Score (GIS). HRD is only available with the addition of the TruSight Oncology 500 HRD kit to TruSight Oncology 500. Not available in Japan. 
8 samples/run for TruSight Oncology 500 and 8–16 samples/run for TruSight Oncology 500 HRD; 16–192 samples/run for TruSight Oncology 500 High-Throughput.

 

参考文献

  1. Content analysis provided by Pierian Knowledgebase v8.5, February 2023.
  2. O'Connor MJ. Targeting the DNA damage response in cancer. Mol Cell. 2015;60(4):547-560. doi:10.1016/j.molcel.2015.10.040 
  3. Yamamoto H, Hirasawa A. Homologous recombination deficiencies and hereditary tumors. Int J Mol Sci. 2021;23(1):348. doi:10.3390/ijms23010348