使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌种panel实现CGP。
TruSight Oncology 500产品线提供泛癌种新一代测序分析方法,可在内部实现全景变异分析(CGP)。通过一次整合检测从关键指南和临床试验中识别相关的生物标志物,比反复检测使用更少的样本获得更多的结果。
深入探索癌症,助力精准诊疗
支持临床研究组织或液体活检样本的全景变异分析
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TruSight Oncology 500产品线提供泛癌种新一代测序分析方法,可在内部实现全景变异分析(CGP)。通过一次整合检测从关键指南和临床试验中识别相关的生物标志物,比反复检测使用更少的样本获得更多的结果。
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌种panel实现CGP。
TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI)的大型泛癌panel实现CGP,具有更高的可扩展性。
TruSight Oncology 500 ctDNA v2
使用能够检测血浆中ctDNA的关键IO基因特征(TMB、MSI)以及所有主要变异类别的泛癌panel进行CGP分析。
以上为覆盖多种癌症类型的基因组肿瘤分析生物标志物节选a
泛癌种: BRAF NTRK1 NTRK2 NTRK3 RET MSI TMB
有意义的生物标志物基因b | 具有潜在意义的生物标志物基因c | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
BRCA1 | BRCA2 | ERBB2 | ESR1 | PALB2 | PIK3CA | 180 | |||
ERBB2 | KRAS | NRAS | 166 | ||||||
EGFR | ERG | ETV1 | ETV4 | EWSR1 | FEV | 140 | |||
FLI1 | FUS | H3F3A | HEY1 | IGH1 | MDM2 | ||||
ERBB2 | NCOA2 | SMARCB1 | |||||||
ALK | EGFR | ERBB2 | KRAS | MET | NUTM1 | 223 | |||
ROS1 | |||||||||
KIT | NRAS | ROS1 | 172 | ||||||
BRCA1 | BRCA2 | FOXL2 | 149 | ||||||
APC | ATRX | CDKN2A | CDKN2B | EGFR | H3F3A | 140 | |||
HIST1H3B | HIST1H3C | IDH1 | IDH2 | MYCN | PTCH1 | ||||
RELA | TERT | TP53 | |||||||
AR | ATM | BARD1 | BRCA1 | BRCA2 | BRIP1 | 151 | |||
CDK12 | CHEK1 | CHEK2 | FANCL | FGFR2 | FGFR3 | ||||
PALB2 | RAD51B | RAD51C | RAD51D | RAD54L | |||||
HRAS | KRAS | NRAS | RET | TERT | 165 | ||||
BRCA2 | EPC1 | ERBB2 | ESR1 | FOXO1 | GREB1 | 138 | |||
JAZF1 | NCOA2 | NCOA3 | NUTM2A | NUTM2B | PAX3 | ||||
PAX7 | PHF1 | POLE | SMARCA4 | SUZ12 | TP53 | ||||
YWHAE | |||||||||
ALK | APC | ARID1A | ASPSCR1 | ATF1 | ATIC | 152 | |||
BAP1 | BCOR | BRCA1 | BRCA2 | CAMTA1 | CARS | ||||
CCNB2 | CDK4 | CDKN2A | CIC | CITED2 | CLTC | ||||
COL1A1 | COL6A3 | CREB1 | CREB3L1 | CREB3L2 | CSF1 | ||||
CTNNB1 | DDIT3 | DDX3X | DNAJB1 | DUX4 | EED | ||||
EGFR | ERBB2 | ERG | ETV1 | ETV4 | ETV6 | ||||
EWSR1 | FEV | FGFR2 | FGFR3 | FLI1 | FOXL2 | ||||
FOXO1 | FOXO4 | FUS | GLI1 | HEY1 | HGF | ||||
HMGA2 | IDH1 | KRAS | LEUTX | MAML3 | MDM2 | ||||
MYB | MYOD1 | NAB2 | NCOA2 | NF1 | NFATC2 | ||||
NFIB | NR4A3 | NRAS | NUTMI | NUTM2A | NUTM2B | ||||
PALB2 | PATZ1 | PAX3 | PAX7 | PDGFB | PDGFRA | ||||
PRKACA | PRKD1 | RANBP2 | ROS1 | SDHA | SDHB | ||||
SDHC | SDHD | SMARCB1 | SS18 | SSX1 | SSX2 | ||||
SSX4 | STAT6 | SUZ12 | TAF15 | TCF12 | TERT | ||||
TFE3 | TFEB | TFG | TP53 | TPM3 | TPM4 | ||||
TRAF7 | TSPAN31 | VGLL2 | WT1 | WWTR1 | YAP1 | ||||
YWHAE | ZC3H7B |
表中列出的基因和生物标志物只是panel所含基因的一部分。如需查看完整的基因列表,请参阅相应产品页面“产品资料”部分中的产品数据表。
TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案) | TruSight Oncology 500 ctDNA v2 | |
---|---|---|---|
分析时间 | 4-5天完成从样本到结果的整个流程 | 4-5天完成从样本到结果的整个流程 | 从纯化核酸到变异报告仅需3-4天 |
自动化功能 | 自动化工作站 | 自动化工作站 | 自动化工作站 |
自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 |
癌症类型 | 泛癌种、实体瘤 | 泛癌种、实体瘤 | 泛癌种、实体瘤 |
内容说明 | 对523个基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。可选的TruSight Oncology 500 HRD试剂盒(暂未在日本推出)内容包含约25K SNP的覆盖范围,可通过由Myriad Genetics提供支持的综合基因组不稳定性评分(LOH+TAI+LST)评估同源重组修复缺陷。 | 对523个目标基因的DNA和55个基因的RNA进行靶向测序,panel总共1.94 Mb。包括MSI和TMB测量。 | 靶向选择523个基因(完整编码序列),panel总共1.94 Mb。
|
说明 | 该检测方法能够对于FFPE组织进行全景变异分析,并在NextSeq™ 550测序仪或NextSeq™ 550Dx仪器(研究模式)上运行,每次可以批量处理多达8个样本。 | 使用NextSeq™ 1000、NextSeq™ 2000、NovaSeq™ 6000、NovaSeq™ 6000Dx(研究模式)或NovaSeq™ X系列,通过一体化的工作流程进行高通量全面NGS检测,以识别指南和1000多项临床试验中的关键生物标志物。包括免疫肿瘤学生物标志物TMB和MSI的覆盖范围。 | 为液体活检样本(血浆ctDNA)的全景变异分析提供了一种非侵入性的研究方法。这种液体活检方法使用微创样本采集方法补充基于组织的CGP,从而提供了关于肿瘤内和肿瘤间异质性的见解。 |
手动操作时间 | 自动化工作流程:约2.5 h 手动工作流程:约10.5 h |
自动化工作流程:约2.5 h 手动工作流程:约10.5 h |
自动化工作流程:约1.5 h 手动工作流程:约2.5 h |
起始量 | 40 ng DNA和/或40 ng RNA | 40 ng DNA和/或40-80 ng RNA | 20 ng cfDNA(4 mL血浆) |
仪器 | NextSeq™ 550测序仪, NextSeq™ 550Dx(研究模式) | NextSeq™ 2000测序仪, NextSeq™ 1000测序仪, NovaSeq™ X测序仪, NovaSeq™ X Plus测序仪, NovaSeq™ 6000Dx(研究模式), NovaSeq™ 6000测序仪 | NovaSeq X测序仪, NovaSeq™ X Plus测序仪, NovaSeq™ 6000测序仪, NovaSeq™ 6000Dx(研究模式) |
方法 | 靶向富集, 靶向DNA测序, 靶向RNA测序 | 靶向富集, 靶向DNA测序, 靶向RNA测序 | 靶向富集, 靶向DNA测序 |
多重分析 | 多达8-plex | NextSeq™ 1000和2000:P2流动槽运行8个样本,P3流动槽24个样本,P4流动槽36个样本。 NovaSeq™ X系列*:1.5B卡盒分析32个样本,10B卡盒192个样本,25B卡盒480个样本。 |
NovaSeq™ X系列:1.5B流动槽运行4个样本,10B流动槽24个样本,NovaSeq™ 6000测序仪:S2流动槽运行8个样本,S4流动槽24个样本,最多支持192个标签 |
核酸类别 | RNA, DNA | RNA, DNA | DNA |
样本通量 | 8个样本/运行 | NextSeq™ 1000和2000:8-36个样本/运行,NovaSeq™ 6000/Dx:16-192个样本/运行,NovaSeq™ X:32-480个样本/运行,NovaSeq™ X Plus:32-960个样本/运行 | 4-48个样本/运行 |
特殊的样本类型 | FFPE组织 | FFPE组织 | 循环肿瘤DNA、血液 |
物种类别 | 人类 | 人类 | 人类 |
技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
变异种类 | 基因融合、转录本变异、单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV)、杂合性缺失(LOH)、体细胞变异、新型转录本、单核苷酸多态性(SNP)、结构变异 | 基因融合、体细胞变异、新型转录本、结构变异、转录本变异、单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV) | 单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV) |
联系因美纳代表,了解有关TruSight Oncology 500产品的更多信息,寻找满足您需求的检测方法。
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*HRD is available through an accessory kit to assess the Genomic Instability Score (GIS). HRD is only available with the addition of the TruSight Oncology 500 HRD kit to TruSight Oncology 500. Not available in Japan.
†8 samples/run for TruSight Oncology 500 and 8–16 samples/run for TruSight Oncology 500 HRD; 16–192 samples/run for TruSight Oncology 500 High-Throughput.
参考文献