使用Agilent Fragment Analyzer系统进行核酸QC
Fragment Analyzer系统可准确评估分离核酸和制备文库的质量和数量,从而优化测序过程中的簇生成。
最大限度地减少错误,缩短手动操作时间,并通过Illumina文库制备产品的自动化选项实现更高的通量
自动化液体处理系统可帮助实验室在提高效率的同时实现并维持一致的结果。NGS文库制备自动化还能够快速扩展通量,同时缩短手动操作时间。
Illumina与领先的供应商合作,为Illumina文库制备试剂盒提供自动化实验方案,将合作伙伴的自动化知识与我们的文库制备和测序专业知识相结合,构建适合您的NGS解决方案。
本指南将向您介绍可用于NGS文库制备的各种自动化工具,并帮助您找到适合您的应用、通量和预算需求的解决方案。了解构建自动化文库制备方案的首要注意事项。
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这些方法由我们的自动化供应商开发,并结合了Illumina的建议。Illumina会审查这些方法产生的测序数据,以确保性能和数据质量。我们的供应商拥有、供应、安装并支持这些方法并为其液体处理系统提供维护和支持。
Illumina与我们的自动化供应商共同开发并测试这些方法。我们的供应商拥有、供应并安装这些方法。Illumina为这些方法提供一线现场和技术支持。* 我们的供应商为这些方法提供二级支持并为其液体处理系统提供维护和支持。
这些方法由我们的自动化供应商开发并测试。Illumina不审查这些方法产生的数据。我们的供应商拥有、安装并支持这些方法。我们的供应商为其液体处理系统提供维护和支持。
查看哪些文库制备试剂盒可在哪些液体处理平台上实现自动化,或查找特定平台的Illumina认证和/或合作伙伴开发的方法。
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Beckman Coulter | Eppendorf | Hamilton | Revvity | Tecan | |
AmpliSeq for Illumina** |
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NGS STAR NGS STARlet |
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AmpliSeq for Illumina Cancer HotSpot Panel v2** |
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Sciclone G3 NGSx | ||
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3** |
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AmpliSeq for Illumina Focus Panel** |
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Sciclone G3 NGSx | ||
COVIDSeq Assay (96样本) | Biomek i7 | epMotion 5075t | NGS STAR |
Zephyr G3 NGS |
Fluent DreamPrep |
COVIDSeq Test (RUO模式) | epMotion 5075t | NGS STAR |
Zephyr G3 NGS |
Fluent DreamPrep | |
Illumina Complete Long Read Prep, Human | epMotion 5075t |
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Illumina DNA PCR-Free Prep | Biomek i5
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Fontus NGS
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Illumina DNA Prep | Biomek i5
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Zephyr G3 NGS |
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Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment |
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DreamPrep |
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment |
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NGS STAR
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Illumina RNA Prep with Enrichment | Biomek i5
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NGS STAR |
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DreamPrep |
Illumina Stranded mRNA Prep |
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DreamPrep |
llumina Stranded Total RNA Prep |
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DreamPrep | |
Nextera XT DNA |
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Zephyr G3 NGS |
DreamPrep |
Pillar Biosciences oncoReveal Solid Tumor v2 Gene Panel Kit |
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TruSeq DNA Nano |
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Sciclone G3 NGSx |
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TruSeq DNA PCR-Free |
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NGS STAR |
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TruSeq Stranded mRNA |
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Zephyr G3 NGS |
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TruSeq Stranded Total RNA |
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Zephyr G3 NGS |
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TruSight Oncology 500 | Biomek i5
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epMotion 5075t |
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DreamPrep |
TruSight Oncology 500 ctDNA v2 |
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TruSight Oncology 500 (DNA Only) | Biomek i5 Biomek i7
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TruSight Oncology 500 High-Throughput |
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DreamPrep | ||
TruSight RNA Pan-Cancer Panel |
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epMotion 5075t | |||
TruSight Tumor 15 |
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TruSight Tumor 170 |
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从2022年1月开始,Hamilton将把 TruSight Oncology 文库制备的 NGS STAR 配置称为 SBS STAR LSA。所有现有的Illumina合格方法都是向后兼容的,这个更改只是名称上的变化,并且这些方法将继续在该系统上运行。
** 为了适应自动化平台所需的更高废液量要求以及原始试剂制造商过量填充体积的变化,当制备每个试剂盒的最大文库数时,可能需要使用多个AmpliSeq for Illumina试剂盒。
使用预设的实验室信息管理系统(LIMS)方案追踪样本、管理运行并投入生产。利用兼容的机器人液体处理程序制备文库,实现快速的高通量测序和数据分析。
实验室信息管理系统,旨在追踪样本和管理工作流程,实现优化高效的实验室。
高性能、快速且集成的无PCR工作流程,适用于人类全基因组测序或肿瘤-正常测序等敏感应用。
Beckman Coulter Biomek i5或Biomek i7、Hamilton NGS Star或其他兼容的机器人液体处理程序。
测序仪可提供高达16 Tb的产出,可在单次运行中以30倍的覆盖度对128个人类基因组进行测序。
无论何种基因组、何种测序方法和项目规模都有可扩展的通量,灵活简便。
对新一代测序数据进行准确、全面、高效的二级分析。
支持三级分析临床研究工作流程的综合研究软件平台。
Fragment Analyzer系统可准确评估分离核酸和制备文库的质量和数量,从而优化测序过程中的簇生成。
这种简化的自动化工作流程可生成高度均一的文库,并为物种鉴定、宏基因组分析和从头基因组组装提供出色的数据。
COVIDSeq检测和COVIDSeq检测工作流程与一系列自动化解决方案兼容,可针对8–96个样本的批量进行配置。
联系我们,了解有关自动化合作伙伴和Illumina认证方法的更多信息。
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