NGS的应用
NGS方法和应用
NGS的发现能力可以为生物现象、通路和系统提供全新见解，涵盖广泛的研究领域
NGS的用途是什么？
NGS用于对大量遗传物质进行测序，使研究人员能够在各种应用和生物系统中采取全面、无偏倚的方法进行科学研究。
您可以在一次实验中识别数千个区域中的变异，甚至达到单碱基分辨率，而不是对选定的标志物进行分析。NGS可扩大您的实验研究范围，帮助您找到极具挑战性的研究问题的答案。
NGS在重点研究领域的应用
NGS可以发挥重要作用，针对不同类型的样本，使用各种已发表方法，寻求各种生物学问题的答案。NGS能够对多个生物“组”（如蛋白质组、转录组、表观基因组和基因组）进行无偏倚的研究。利用NGS还可以实现同时检测多个组的组合方法，这种方法被称为多组学。
常见的NGS方法和应用包括：
微生物学和传染性疾病
NGS通过对细菌、病毒和其他微生物的基因组进行测序，有助于识别病原体、疫情追踪和抗菌药物耐药性研究。
微生物全基因组测序方法指南
同时对数百个生物体进行测序，生成准确的参考基因组并进行比较基因组学研究。
遗传病和罕见病
NGS能够对基因组或外显子组进行快速测序，以识别与罕见疾病相关的新型SNP。
各个领域的关键NGS应用
| 应用 | 目标领域/方向 | 推荐仪器 |
|---|---|---|
| 基因表达分析 研究基因组中编码区的基因表达。 |
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小型和中型桌面式仪器 |
| 微生物基因组学 发现新的微生物、监测疫情、分析食物来源等。 |
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小型和中型桌面式仪器 |
| 靶向基因测序 分析指定样本的特定变异时的有用工具。 |
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小型和中型桌面式仪器 |
| 小RNA测序 对microRNA等小RNA进行检测和测序的技术。 |
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小型和中型桌面式仪器 |
| 富集基因组 用于分析给定样本中的特定遗传变异。 |
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小型和中型桌面式仪器 |
| 转录组学 （整体、单细胞、空间） 对转录组进行全面分析，包括在各个细胞或组织内发现的所有RNA分子（整体批量分析或在空间分辨率下分析）。 |
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中型桌面式仪器 |
| 免疫组库 （整体和单细胞） 用于识别易患自身免疫性疾病和其他疾病的个体中的独特受体变异。 |
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中型桌面式仪器 |
特色工作流程
NGS工作流程易于获取，并可在多种测序方法和研究领域中实施。以下是一些非常流行的方法的工作流程示例。
特色工作流程：Illumina RNA Prep with Enrichment
本网络研讨会将带您了解从样本到文库的工作流程、Illumina RNA Prep with Enrichment的独特功能以及文库制备的实用技巧。
各类仪器的NGS应用和方法
关键应用
支持的应用
*小型靶向panel＜50个基因，大型靶向panel＞50个基因 |
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| 方法 |
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|---|---|---|---|---|
| 小型全基因组测序 （微生物、病毒） 对细菌、病毒或其他微生物的整个基因组进行测序。 |
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| 靶向DNA测序 在分析指定样本的特定突变时，靶向的基因测序panel是有用的工具。 |
小型靶向panel的关键应用* |
小型靶向panel的关键应用* |
小型靶向panel的关键应用* |
小型靶向panel的关键应用* |
| mRNA测序 使用Poly-A捕获法富集mRNA后，可灵敏、准确地测量基因表达。 |
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| 总RNA测序 分析编码RNA和多种形式的非编码RNA，获得完整的转录组视图。 |
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| 16s rRNA测序 该方法无需培养，用于鉴定和比较那些难于研究的，来自复杂微生物组或环境的细菌。 |
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| 外显子组测序 用于分析基因的编码区以确定基因变异的DNA技术。 |
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| 鸟枪法宏基因组学测序 同时对数千种生物体进行测序。鉴定不可培养或低丰度的微生物，或评估微生物多样性。 |
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| ATAC-Seq 染色质转座酶可及性测序分析（ATAC-Seq）是确定全基因组范围内的染色质可及性的常用方法。 |
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| 甲基化测序 DNA甲基化测序分析可提高覆盖密度与灵活性，从而增进表观遗传学研究的能力。 |
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| 靶向蛋白质组学 分析特定蛋白质，了解它们在生物系统中的功能和相互作用。 |
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| 单细胞测序 发现包含更大组织的独特细胞生态位。 |
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| 空间分析 获取组织切片内转录活动的综合图谱。 |
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| 液体活检研究 检查游离循环肿瘤DNA作为非侵入性癌症生物标志物。 |
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| 免疫组库测序 解码免疫细胞受体，了解免疫系统的多样性和响应。 |
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| 大型全基因组测序 （人类） 对整个基因组进行广泛测序，揭示用于研究的遗传信息。 |
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