订购NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment提供了一种经济高效、可靠的解决方案，用于人类全外显子组测序（WES）。本试剂盒提供：
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
6.5小时
分析时间
约2小时
手动操作时间
50-1,000 ng高质量基因组DNA（如果直接使用血液和唾液样本，请参阅参考指南）
起始量
概述
单一供应商提供的简化工作流程解决方案
该全外显子组测序试剂盒包括文库制备和杂交试剂、纯化/片段选择磁珠和标签。该试剂盒还包括Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel，该panel为公共数据库中报告的变异提供了更高的目标区域覆盖度。
规格
| 分析时间 | 6.5小时 |
|---|---|
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 |
| 内容说明 | 37.5 Mb编码内容（≥99%的RefSeq、CCDS、ClinVar和ACMG致病/可能致病变异，COSMIC癌症基因普查内容），OMIM |
| 说明 | 一种快速、易于使用的文库制备方法，具有富集工作流程，采用具有最新外显子组内容的聚焦富集探针panel，可实现经济高效、可靠的人类全外显子组测序。 |
| 手动操作时间 | 约2小时 |
| 起始量 | 50-1,000 ng高质量基因组DNA（如果直接使用血液和唾液样本，请参阅参考指南） |
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用机制 | 磁珠固化转座酶和杂交捕获化学技术 |
| 方法 | Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment |
| 多重分析 | 对多达12重预富集文库混合池进行测试。试剂盒配置支持多达192个样本的多重分析。最多支持384个样本。 |
| 核酸类型 | DNA |
| 在靶read | 根据内部检测的平均性能，约为90% |
| 特殊的样本类型 | Blood, Saliva |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 均一性 | 基于内部测试的平均性能，均一性为≥91%（5 Gb、20x下的覆盖度%） |
| 变异类别 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
需要的产品
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment试剂盒包括文库制备、富集、富集探针panel、纯化磁珠和标签接头试剂。如果愿意，请选择不同的标签集。
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel是可选的固定内容插入panel，可对线粒体DNA变异进行富集和测序。
对于直接血液输入，需要使用Flex Lysis Reagent Kit。
Infinium MIDI Heatblock Insert适用于SciGene HybEx Microheating系统，是富集步骤所必需的。
/
结果
应用
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment是一款快速、全面的端到端全外显子组测序解决方案，支持从样本到报告的全程分析。
工作流程示例
制备
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
分析
Illumina Connected Insights——体细胞
仅在部分国家/地区上市。Illumina Connected Insights通过对第三方知识库的API调用，支持用户自定义的三级分析。
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 2000 System | Samples per run (by flow cell type): P2: 19, P3: 57 (based on 50× mean target coverage, 42M reads, 4.2 Gb of data) |
2 × 101 bp |
| NovaSeq 6000 System | Samples per run by flow cell type: SP: 34, S1: 69, S2: 176, S4: 428 based on 50× mean target coverage, 42M reads, 4.2 Gb of data. Note: S4: 428 requires NovaSeq Xp workflow or additional indexes. |
2 × 101 bp |
相关应用和方法
其他人如何使用该产品
比较
| Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | |
|---|---|---|
| 分析时间 | 6.5小时 | 约6.5小时 |
| 自动化详情 | 探索可用的自动化方法 | 探索可用的自动化方法 |
| 内容说明 | 37.5 Mb编码内容（≥99%的RefSeq、CCDS、ClinVar和ACMG致病/可能致病变异，COSMIC癌症基因普查内容），OMIM |
外显子组：45 Mb外显子内容（≥ 98%的RefSeq、CCDS和Ensembl编码内容）。 定制：0.5-15 Mb目标基因组内容。 固定基因集panel：内容因panel而异。 |
| 说明 | 一种快速、易于使用的文库制备方法，具有富集工作流程，采用具有最新外显子组内容的聚焦富集探针panel，可实现经济高效、可靠的人类全外显子组测序。 | 在约6.5小时内，从低DNA起始量和各种样本类型中制备用于各种实验的测序文库，包括全外显子组、定制和固定panel靶向测序。 |
| 手动操作时间 | 约2小时 | 约2小时, 约2小时 |
| 起始量 | 50-1,000 ng高质量基因组DNA（如果直接使用血液和唾液样本，请参阅参考指南） | 10 -1000 ng高质量基因组DNA或50-1000 ng FFPE DNA。（对于血液和唾液样本，请参阅参考指南）。 |
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 作用机制 | 磁珠固化转座酶和杂交捕获化学技术 | 磁珠固化转座酶和杂交捕获化学技术 |
| 方法 | Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment | Custom sequencing, Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment |
| 多重分析 | 对多达12重预富集文库混合池进行测试。试剂盒配置支持多达192个样本的多重分析。最多支持384个样本。 | 多达384个可用的唯一双标签。对多达12重预富集文库混合池进行测试。 |
| 核酸类型 | DNA | DNA |
| 在靶read | 根据内部检测的平均性能，约为90% | 外显子组panel≥85%（来自示例数据集的结果；实际性能可能有所不同） |
| 特殊的样本类型 | Blood, Saliva | Blood, Low-input samples, FFPE tissue, Saliva |
| 物种 | 人 | Other, 人 |
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 |
| 均一性 | 基于内部测试的平均性能，均一性为≥91%（5 Gb、20x下的覆盖度%） | ≥90%（4 Gb、20x下的覆盖度%；对于外显子组panel） |
| 变异类别 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
选择工具：
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
图
Exome 2.5 Panel性能提升
使用Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment和随附的1.5小时或16小时杂交时间的Exome 2.5 Panel或1.5小时杂交时间的Illumina Exome Panel（IEP，20020183）构建文库并进行富集。在NovaSeq 6000系统上对富集文库进行测序，并使用DRAGEN Enrichment App进行分析。
在计算机环境中实现高数据库目标覆盖率
将Exome 2.5 Panel和Exome Panel的平台文件与列出的公共数据库进行比较，确定并报告重叠百分比。
在公共数据库中出色地覆盖疾病相关变异
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment使用1.5小时（橙色）或16小时（蓝色）的杂交时间，在公共数据库中≥20×的靶标上显示出较高的平均覆盖度百分比。
相关资源
外显子组试剂盒 (2)
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set B (96 Samples, 12-plex)
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包括Illumina DNA Prep with Enrichment文库制备和富集试剂、Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel、Illumina Purification Beads和IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B、用于96个文库全外显子组富集的酶切法片段化（8次12重富集反应）。
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Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set D (96 Samples, 12-plex)
20077596
包括Illumina DNA Prep with Enrichment文库制备和富集试剂、Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel、Illumina Purification Beads和IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set D、用于96个文库全外显子组富集的酶切法片段化（8次12重富集反应）。
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Panel (1)
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel
20093180
包括Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel，32 μL试剂，用于96个样本（8次杂交反应，每次反应12个样本）。该panel可与Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment Kit中的Exome 2.0 Plus Panel搭配使用，用于从全基因组文库中同时富集人类外显子组和线粒体DNA。Mitochondrial Panel作为Exome 2.0 Plus Panel产品的配件出售。
List Price:
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配套产品 (8)
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
包含使用Illumina DNA Prep和Illumina DNA Prep with Enrichment处理血液样本的试剂。单独购买文库制备、富集、富集探针panel和标签接头试剂。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
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Infinium MIDI Heatblock Insert
BD-60-601
Nextera Flex for Enrichment杂交步骤所需的SciGene Hybex微型加热系统的加热插块。
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Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
包含一个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
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Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
包含四个100 mL微珠容器，用于文库纯化和大小选择。单独购买文库制备和富集试剂、探针panel和标签。
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常见问题解答
是的，可以使用10-49 ng的gDNA起始量。但是，本实验方案不对最终的预富集文库产量进行均一化＜50 ng，因此需要在富集前后对文库进行定量和均一化。
本方案已通过EDTA采集管中采集的新鲜血液进行了验证。可以使用其他抗凝剂，但使用此试剂盒时无法保证。
本实验方案已使用唾液（仅针对使用Oragene DNA唾液采集管采集的唾液）进行了验证。
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel是可选的固定内容panel，用于覆盖线粒体基因组（chrM）的16，659个碱基对（bp）和37个基因，并允许线粒体DNA（mtDNA）变异的富集和测序。将此panel用作Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment实验方案中的插入panel，并将ChrM的覆盖度添加到您的实验中。
以前称为Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment的产品现在称为Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment（货 号20077595和20077596）。外显子组panel寡核苷酸没有变化，但包含的标签已更新为 Illumina DNA/RNA UD Indexes。
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结果
MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Illumina DNA Prep with Enrichment
快速、集成的工作流程，为各种靶向测序应用提供可直接用于测序的DNA文库。
TruSight Hereditary Cancer Panel
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
Illumina UD Indexes
唯一双（UD）标签能够制备可多重分析的高质量文库，从而提高通量并节省成本。
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