数量性状基因位点(QTL)是与特定表型或性状相关的DNA区域,在不同人群中有所不同。通常情况下,QTL与连续型变化的性状(例如身高或肤色)有关,而与离散型变化的性状(例如头发或眼睛的颜色)无关。
QTL定位是一种统计分析,可识别哪些分子标记会导致特定性状的定量变化。由于单个基因位点可能包含许多变异,因此填充或全基因组测序是进行QTL定位并精确识别参与的分子标记的关键先决条件。QTL已进行了扩展,纳入了在基因型到表型的连续体中在不同水平起作用的变异。
QTL分析是一种注释疾病相关变异的有效方法。它可以了解变异的功能性影响,区分导致疾病的变异和与疾病有关的变异。研究人员可以利用不同的QTL分析,发现变异与受其影响的基因构成的分子相互作用网络,并指出哪些基因和通路真正引发了疾病。这样有助于将时间、资源和资金投入到最可能与疾病有关的靶点上。
表达数量性状基因位点(eQTL)是影响一个或多个基因表达的遗传变异。eQTL可以顺式(局部)或反式(有一定距离,例如在不同的染色体上)作用于其基因靶点。eQTL定位需要通过芯片或WGS对全基因组进行基因分型,并通过RNA-Seq对每个样本进行基因表达分析。
了解详情:
染色质可及性数量性状基因位点(caQTL)是影响核小体包装、定位和染色质可及性的遗传变异。caQTL定位需要通过芯片或WGS进行全基因组基因分型,并通过ATAC-Seq或Hi-C等方法进行染色质可及性分析。
了解详情:
在本次研讨会中,三位小组成员将介绍如何通过多组学方法了解变异的生理意义。您将了解到高通量实验分析、单细胞方法和计算分析的强大组合如何将变异与功能联系起来,进而将基因型与表型联系起来。
观看网络研讨会基于NGS的方法揭示了变异对基因表达的影响,从而更好地了解疾病机制。
因美纳提供支持数据集成的数据分析软件,例如用于eQTL分析的基因分型(包含基因表达)。
GenomeStudio软件可对因美纳芯片平台生成的数据进行可视化与分析。这款功能强大的解决方案支持芯片数据的基因分型分析。
了解为何这些研究领导者决定在研究中使用多组学方法。
全基因组测序可以提供全面视图,非常适合探索应用。更新的基因组测序仪能比以往任何时候都更快地进行WGS。
了解如何揭示疾病的复杂性,发现未来的治疗靶点。