长读长测序技术
深入探察复杂的基因组区域
长读长测序有助于揭示复杂的基因组区域
长读长测序是什么？
长读长测序是一种DNA测序技术，与传统的短读长测序方法相比，它可以对更长的DNA片段进行测序。尽管短读长测序能够捕获多数遗传变异，但长读长测序能够检测短读长难以检测的复杂结构变异，包括，大片段的倒位、缺失，或易位，其中某些结构变异与遗传疾病等领域相关。
长读长技术可以通过测序数千个碱基，来帮助解析复杂的基因组区域：
- 解析以往难以绘制的基因或基因组区域，例如，包含高度可变或高度重复元件的基因或基因组区域
- 进行定相测序，以鉴定共遗传等位基因、单倍型信息和定相新发突变
- 为从头组装和构建基因组完成图的应用生成长读长
Illumina Complete Long Read测序技术简介
- 生成N50为5-7 kb的连续长读长序列，其中某些读长＞10 kb
- 提供可靠、经济高效的一体化工作流程，兼容所有NovaSeq系统，帮助您在一台仪器上获取长读长和短读长数据
- 借助BaseSpace Sequence Hub app，充分发挥DRAGEN分析的准确性和速度
Illumina Complete Long Read技术的工作原理
使用酶切法片段化获得均一的长片段。对长片段进行“界标标记”以捕获单个分子、长读长信息，并扩增长片段。标记的片段进一步酶切生成标准文库，以供测序。组合来自标准短读长基因组中标记的与未标记的数据，生成高度准确的长读长。
长读长与短读长测序
结合长读长数据与互补的短读长信息能发挥优势。多数长读长解决方案的工作流程复杂且结果高度差异化1-4。而短读长（特别是50-600 bp）能够以低成本提供优质数据和理想的测序深度。通过先进的数据分析，短读长测序能够以出色的准确性进行全基因组变异检出。此外，一小部分基因区域可以受益于长读长信息，以提高最难绘制的基因的分辨率。
参考文献
- Pacific Biosciences. Preparing DNA for PacBio HiFi sequencing—Extraction and quality control. pacb.com/wp-content/uploads/Technical-Note-Preparing-DNA-for-PacBio-HiFi-Sequencing-Extraction-and-Quality-Control.pdf.
- Pacific Biosciences. Preparing whole genome and metagenome libraries using SMRTbell prep kit 3.0. pacb.com/wp-content/uploads/Procedure-checklist-Preparing-whole-genome-and-metagenome-libraries-using-SMRTbell-prep-kit-3.0.pdf.
- Oxford Nanopore Technologies. Ligation Sequencing Kit. store.nanoporetech.com/us/ligation-sequencing-kit110.html.
- Pacific Biosciences. Low Yield Troubleshooting Guide. pacb.com/wp-content/uploads/Guide-Low-Yield-Troubleshooting.pdf.