NextSeq 550Dx试剂
这些测序试剂盒为NextSeq550 Dx仪器上的体外诊断测试提供了简化的工作流程和高数据质量。
TruSeq Custom Amplicon Kit Dx是一款经FDA批准的扩增子测序试剂盒，能让临床实验室自行开发可在MiSeqDx和NextSeq 550Dx仪器（经FDA批准）上使用的新一代测序（NGS）分析方法。
TruSeq Custom Amplicon Kit Dx
经验证的、FDA批准的试剂盒让临床实验室得以自行设计可在MiSeqDx和NextSeq 550Dx基因测序仪上使用的新一代测序实验分析方法。
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概述
灵活的实验分析设计
借助TruSeq Custom Amplicon Kit Dx，分子诊断实验室可开发出使用它们自己的寡核苷酸探针设计的实验分析方法。该试剂盒针对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本和全血进行了优化。这种灵活性让实验室能够增加它们能提供的应用数量，更好的满足客户的需求。
经验证的试剂盒
TruSeq Custom Amplicon Kit Dx经过验证，能保证不同批次的性能一致，可用于长期的分析并使变更管理更加容易。
实验分析方法可重现性高
正如一项精准研究所证明的那样，使用TruSeq Custom Amplicon Kit Dx产生的数据具有高度可重现性。* TruSeq Custom Amplicon Kit Dx与MiSeqDx或NextSeq 550Dx一起，提供了将NGS功能引入临床实验室所需的准确性和可靠性。
*请参阅以下支持数据
预期用途
TruSeq Custom Amplicon Kit Dx
Illumina TruSeq Custom Amplicon Kit Dx是试剂盒，用于从由外周全血和福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中提取的DNA制备样本文库。制备靶向特异性目标基因组区域的文库需要用户提供的分析物特异性试剂。产生的样本文库适于在因美纳的高通量DNA测序分析仪上使用。
TruSeq Custom Amplicon Dx – FFPE QC Kit
Illumina TruSeq Custom Amplicon Dx–FFPE QC Kit试剂盒，用于确定从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本中提取的基因组DNA（gDNA）的扩增潜力。
MiSeqDx Reagent Kit v3
Illumina MiSeqDx Reagent Kit v3是一组用于在经验证的检测中对样本文库进行测序的试剂和耗材。Illumina MiSeqDx Reagent Kit v3用于配合MiSeqDx仪器和分析软件使用。
MiSeqDx仪器
MiSeqDx仪器用于在进行体外诊断（IVD）检测时，对从外周全血或福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织提取的人基因组DNA的DNA文库进行靶向测序。MiSeqDx仪器不适用于全基因组或从头测序。MiSeqDx仪器应配合经注册、备案、批准或经承认的IVD试剂和分析软件使用。
NextSeq 550Dx仪器（美国）
NextSeq 550Dx仪器用于对从外周全血或福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中提取的人类基因组DNA的DNA文库进行靶向测序，用于对仪器进行 体外 诊断（IVD）检测。NextSeq 550Dx仪器不适用于全基因组或从头测序。NextSeq 550Dx仪器应配合经注册、备案、批准或经承认的IVD试剂和分析软件使用。
NextSeq 550Dx仪器（欧盟）
NextSeq 550Dx仪器适用于在仪器上进行 体外 诊断（IVD）检测时对DNA文库进行测序。NextSeq 550Dx仪器应配合经过特定的注册、认证或批准的IVD试剂和分析软件使用。
NextSeq 550Dx High-Output Reagent Kit v2（300循环）
Illumina NextSeq 550Dx High-Output Reagent Kit v2（300循环）是一组用于在经验证的检测中对样本文库进行测序的试剂和耗材。该试剂盒适合与NextSeq 550Dx仪器和分析软件搭配使用。
NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit v2.5（300循环）
Illumina NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit v2.5（300个循环）是一组用于在经验证的检测中对样本文库进行测序的试剂和耗材。该试剂盒适合与NextSeq 550Dx仪器和分析软件搭配使用。
规格
| 系统 | MiSeqDx, NextSeq 550Dx Instrument |
|---|---|
| 方法 | Custom sequencing, Amplicon sequencing |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
需要的产品
所需材料
针对TruSeq Custom Amplicon Kit Dx，使用下列板固定装置试剂盒中的一个，有助于正确加入PCR扩增的标签引物。
- TruSeq Index Plate Fixture Kit（FC-130-1005）
- TruSeq Index Plate Fixture & Collar Kit（FC-130-1007）
/
结果
图
简化的定制分析流程
TruSeq Custom Amplicon Kit Dx能让临床实验室自行开发在MiSeqDx或NextSeq 550Dx仪器上使用的NGS实验分析方法。
文库制备原理
TruSeq Custom Amplicon Kit Dx使用客户自定义的探针对特异性靶点进行捕获和测序。
TruSeq Custom Amplicon Kit Dx的检测能力
目标规格允许对RefSeq基因中＞90%的外显子进行测序，具体取决于检测设计。
| 参数 | 生殖系 | 体细胞 |
|---|---|---|
| 基因组内容 | ||
| GC含量 | 19%–78% | 19%–73%* |
| PolyA长度 | ≤ 8 | ≤ 8 |
| PolyT长度 | ≤ 10 | ≤ 10 |
| PolyG长度 | ≤ 7 | ≤ 6 |
| PolyC长度 | ≤ 6 | ≤ 6 |
| 二核苷酸重复长度 | ≤ 11× | ≤ 4× |
| 三核苷酸重复长度 | ≤ 5× | ≤ 5× |
| 变异 | ||
| 单核苷酸多态性 | 是 | 可检测，检测限5% |
| 插入长度 | ≤ 24 bp | ≤ 24 bp |
| 缺失长度 | ≤ 25 bp | ≤ 25 bp |
使用MiSeqDx Reagent Kit v3进行测序运行。
* 使用NextSeq 550Dx仪器时高达78%。
实验分析方法可重现性高
用代表性的分析方法进行实验室内精密度研究，以证明由TruSeq Custom Amplicon Kit Dx产生的数据可重复性高。在该研究的8个运行中，操作人员、仪器和批次都有变化。
| 分析 | 指标 | 变异类型 | MiSeqDx（8次运行） | NextSeq 550Dx（9次运行） |
|---|---|---|---|---|
| 生殖系 | PPA | SNV | 99.8% | > 99.9% |
| PPA | 插入 | 99.1% | 98.9% | |
| PPA | 缺失 | 99.8% | 100% | |
| NPA | – | 100% | 100% | |
| 体细胞 | PPA | SNV | 100% | 99.9% |
| PPA | 插入 | 100% | 99.9% | |
| PPA | 缺失 | 100% | 99.9% | |
| NPA | – | > 99.9% | > 99.9% |
百分比代表运行的最小值。缩写： PPA = 阳性符合率， NPA = 阴性符合率， SNV = 单核苷酸变异。
TruSeq® Custom Amplicon Kit Dx
20005718
包含用于从外周全血和福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中提取的DNA中制备多达96个文库的试剂和耗材。制备靶向特异性目标基因组区域的文库需要用户提供的分析物特异性试剂。单独购买标签板固定装置试剂盒。
List Price:
Discounts:
TruSeq® Custom Amplicon Dx – FFPE QC
20006259
包括用于确定从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）中提取的多达48个基因组DNA（gDNA）样本的扩增潜力的试剂。该试剂盒支持四种用途，每次使用12个样本。配合TruSeq Custom Amplicon Kit Dx或其他文库制备试剂盒使用。
List Price:
Discounts:
TruSeq Index Plate Fixture Kit (2 fixtures)
FC-130-1005
包含两个TruSeq标签板固定装置，支持正确布置标签引物进行PCR扩增。
List Price:
Discounts:
TruSeq Index Plate Fixture & Collar Kit (2 each)
FC-130-1007
有助于正确地加入PCR扩增步骤的标签引物。内含两（2）个TruSeq Index Plate Fixture和两（2）个Plate Collar。
List Price:
Discounts:
MiSeq Dx Reagent Kit v3
20037124
包含一个流动槽和一个预装卡盒，其中包含簇生成试剂和测序试剂，可在MiSeqDx系统上支持一次样本文库运行。
List Price:
Discounts:
NextSeq550Dx Reagent Kit v2(300 cyc) IVD
20019554
NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit v2（300个循环）是一组用于在经验证的检测中对样本文库进行测序的试剂和耗材。该试剂盒适合与NextSeq 550Dx仪器和分析软件搭配使用。
List Price:
Discounts:
NextSeq 550Dx High Output Reagent Kit v2.5 (300 cycles) IVD
20028871
包含一个高通量流动槽、一个缓冲液夹盒和一个包含簇生成试剂和测序试剂的试剂夹盒，以支持在NextSeq 550Dx系统上进行300个循环的运行。所有注册用于体外诊断测序的产品。
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VeriSeq NIPT Solution v2
全面的实验室NIPT IVD解决方案，包括试剂、仪器和软件，可在26小时内获得准确的非整倍体筛查结果。
Illumina DNA Prep with Enrichment Dx
用于体外诊断（IVD）靶向测序应用的文库制备和富集解决方案。
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
优化的靶向定制RNA研究panel，可测序多达1200个感兴趣的基因组靶点。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容测序进行优化的靶向定制研究panel。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep with Enrichment Dx
用于体外诊断（IVD）靶向测序应用的文库制备和富集解决方案。
TruSight Cystic Fibrosis
FDA批准、CE认证的体外诊断（IVD）新一代测序检测可在一种产品中方便地进行两次囊性纤维化检测。
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