大规模动物测序加速畜牧业改良
1000 公牛基因组计划的测序数据正帮助发现有利与有害性状,使全球畜群受益。
研究发现助力保护、农业和进化研究
全球研究人员正利用植物和动物测序技术,研究各类物种的基因组。这些遗传图谱为发现提供了丰富基础,帮助我们理解生命与进化,并为濒危物种保护寻找新途径。
在农业中运用新一代测序(NGS),还将推动更高效、更可持续的实践发展,使我们共同应对不断变化的环境挑战,并满足日益增长人口的粮食需求。
| 方法 | 描述 | 用户 |
|---|---|---|
| 从头 测序 | 对植物或动物进行 从头 测序是理解其性状及与环境互作遗传基础的第一步。 | 确定图谱位置并汇总品种信息,以便后续重测序发现单核苷酸多态性(SNP)及其他遗传变异。 |
| 全基因组重测序 | 当物种已有参考基因组时,对整个基因组进行全面分析的方法。 | 可识别基因、SNP 和结构变异,同时确定基因型。 |
| 转录组测序 | RNA 测序为发育、疾病和胁迫条件下基因表达水平的变化提供新见解。 | 阐明基因与蛋白的功能及相互作用,鉴定组织特异性 RNA 转录本列表,并发掘新的 SNP。 |
| 表观遗传学 | 环境变化(如食物供应或干旱)可触发植物和动物的适应性反应,影响其生存和繁殖适合度。 | 通过测序鉴定 DNA 甲基化、染色质结构和小 RNA 表达的变化,了解表观遗传因素如何控制目标性状。 |
| 靶向重测序 | 对预先确定的变异区域在大量样本中进行测序的方法。 | 鉴定常见和稀有变异(如 SNP、CNV),为育种决策提供信息或表征疾病易感性。 |
| 基因分型测序 | 低成本遗传筛查方法,可同时发现新的动植物 SNP 并进行基因分型。 | 用于遗传图谱构建、回交系筛选、纯度检测、单体型图构建及植物基因组关联分析和基因组评估。 |
| 环境 DNA 测序 | 有效的生物监测工具,可表征水体、土壤等样本中的细菌和真核物种。 | 港口监测、生物多样性调查、压载水检测、土壤检测等。 |
| 基因组编辑 | CRISPR 基因组编辑在农业、食品科学、环境科学等领域潜力巨大。 | 确认基因敲除,分析靶向与非靶向效应,并评估基因编辑的功能影响。 |
1000 公牛基因组计划的测序数据正帮助发现有利与有害性状,使全球畜群受益。
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Illumina 新一代测序技术在农业研究中的应用指南。
新型测序方法降低成本,实现对数万条鱼的分析。
作者利用测序研究不同倍性水平的作物。
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