NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit是一种全基因组甲基化筛选工具，靶向人类甲基化组生物学意义较大的区域中超过935,000个CpG位点。
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
可靠的甲基化分析芯片，广泛覆盖CpG岛、基因和增强子，用于全表观基因组关联研究。
3024 samples per week on a single iSCAN
样本通量
每个芯片8个样本
样本数量
~ 930k
标志物数量
概述
经济高效的筛查
每个样本的总成本相对较低，而且具有可扩展性，因此实验室可以高效地筛选大规模样本队列。
深受表观遗传学研究人员信赖
Illumina Methylation BeadChip支持突破性研究已有十余年，迄今为止大多数已发表的全表观基因组关联研究（EWAS）都是利用MethylationEPIC或其前代产品完成的。利用Gene Expression Omnibus（GEO）或癌症基因组图谱计划（TCGA）等数据库中的甲基化数据。
兼容多种样本类型
此检测方法与FFPE兼容，能够基于大型肿瘤生物样本库完成研究。此外，此检测方法同样兼容新鲜/冷冻组织、全血、口腔细胞、cfDNA、唾液和其他样本类型。
规格
| 实验分析方法类型 | Infinium HD Methylation |
|---|---|
| 自动化功能 | 自动化芯片装载器 |
| 说明 | Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip是一款全基因组甲基化筛查工具，具有专家精选的增强功能内容。该试剂盒在iScan或NextSeq 550系统上处理，遵循简单、用户友好的工作流程，无需样本混合和标签。 |
| 起始量 | 250 ng DNA |
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, 研究模式下的NextSeq 550Dx, iScan |
| 方法 | 甲基化 芯片 |
| 核酸类型 | DNA |
| Number of markers | ~ 930k |
| 样本数量 | 每个芯片8个样本 |
| Sample throughput | 3024 samples per week on a single iSCAN |
| 样本类型详情 | 还与口腔细胞和新鲜/冷冻组织兼容 |
| 特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织, 游离DNA, 唾液 |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina芯片 |
| 变异类别 | 差异甲基化胞嘧啶 |
需要的产品
需要购买与每次运行的样本数量相匹配的试剂盒。请注意，每个试剂盒均按单批次处理，不可用于多个实验。如果要处理多个低通量批次，请订购多个小型试剂盒。试剂盒包含进行甲基化筛查所需的所有试剂，但亚硫酸氢盐转化试剂盒除外，这些试剂盒是可单独购买的可选产品。
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结果
应用
Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip是一款强大的芯片，能够发现甲基化生物标志物，用于癌症、遗传病、衰老和分子流行病学的研究应用。
工作流程示例
选择内容
Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
相关应用和方法
其他人如何使用该产品
文档
产品资料
Support documentation
- Infinium HD Methylation Assay Manual Workflow Checklist
- Infinium HD Assay for Methylation Lab Tracking Form
- BeadArray Controls Reporter Software Guide
- Infinium Assay Lab Setup and Best Practices
- Infinium HD Methylation Assay Auto Workflow Checklist
- Infinium LiHa and Infinium RoMa Operating Manual
- Infinium Assay Consumables and Equipment List
- Infinium HD Methylation Assay Product Documentation
- Infinium MethylationEPIC v2 Kit支持
- 全部 Infinium MethylationEPIC v2 Kit Support
比较
| Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit | Infinium Custom Methylation Kit | Infinium Mouse Methylation BeadChip | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 实验分析方法类型 | Infinium HD Methylation | Infinium HD Methylation | |||
| 自动化功能 | 自动化芯片装载器 | 自动化芯片装载器 | 自动化芯片装载器 | ||
| 说明 | Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip是一款全基因组甲基化筛查工具，具有专家精选的增强功能内容。该试剂盒在iScan或NextSeq 550系统上处理，遵循简单、用户友好的工作流程，无需样本混合和标签。 | ||||
| 起始量 | 250 ng DNA | DNA＞250 ng | |||
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, 研究模式下的NextSeq 550Dx, iScan | iScan | iScan | ||
| 方法 | 甲基化 芯片 | 甲基化 芯片 | 甲基化 芯片 | ||
| 核酸类型 | DNA | DNA | DNA | ||
| Number of markers | ~ 930k | 固定标记：＞28.5万 | |||
| 样本数量 | 每个芯片8个样本 | 每个芯片12个样本 | |||
| Sample throughput | 3024 samples per week on a single iSCAN | 每周＞1000个样本（8个样本BeadChip的每个Tecan） | |||
| 样本类型详情 | 还与口腔细胞和新鲜/冷冻组织兼容 | 可用于新鲜/冷冻组织。分析包括DAC在内的外源化学物质诱导的DNA甲基化变化。 | |||
| 特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织, 游离DNA, 唾液 | 血液, 游离DNA, 唾液 | 血液, FFPE组织, 唾液 | ||
| 物种 | 人 | 小鼠, 人 | 小鼠 | ||
| 技术 | Illumina芯片 | Illumina芯片 | Illumina芯片 | ||
| 变异类别 | 差异甲基化胞嘧啶 | 差异甲基化胞嘧啶 | 差异甲基化胞嘧啶 |
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图
Infinium MethylationEPIC v2.0覆盖基因组区域
新的和增强的内容使未来的表观遗传学发现成为可能。
密集覆盖CpG岛
Infinium MethylationEPIC v1.0 BeadChip上覆盖不足的CpG岛和外显子被其他探针完全覆盖。
FFPE样本的可靠数据
FFPE组织样本在Infinium Methylation HD Assay的改良版本中表现出可靠的性能。为保证珍贵样本和最佳样本完整性，建议使用Infinium FFPE QC和DNA Restoration Kit。
与之前的BeadChip高度向后兼容
Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip以Infinium MethylationEPIC v1.0和HumanMethylation450 BeadChip的已有CpG骨架为基础创建。
EPIC v2.0试剂盒 (4)
Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (8 Spl)
20087706
包括一个8样本BeadChip芯片和用于扩增、片段化、杂交、标记和检测8个DNA样本的试剂。起始量需要250 ng DNA。每个试剂盒按一批处理。单独购买亚硫酸氢盐转化试剂盒。
Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (16 Spl)
20087707
包含两个8个样本的BeadChip芯片和用于扩增、片段化、杂交、标记和检测16个DNA样本的试剂。起始量需要250 ng DNA。每个试剂盒按一批处理。单独购买亚硫酸氢盐转化试剂盒。
Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (32 Spl)
20087708
包含4个8样本BeadChip芯片和用于扩增、片段化、杂交、标记和检测32个DNA样本的试剂。起始量需要250 ng DNA。每个试剂盒按单批次处理。单独购买亚硫酸氢盐转化试剂盒。
Inf MethylationEPIC V2.0 Kit (96 Spl)
20087709
包含12个8样本BeadChip芯片和用于扩增、片段化、杂交、标记和检测96个DNA样本的试剂。起始量需要250 ng DNA。每个试剂盒按一批处理。单独购买亚硫酸氢盐转化试剂盒。
EPIC v2.0半定制试剂盒 (3)
Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (16 Spl)
20097750
半定制EPIC v2，在EPIC v2上包含3，000-10，000个尝试的微珠类型。试剂盒包含2个微珠芯片，以及用于处理16个样本的试剂。
Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (32 Spl)
20097751
半定制EPIC v2，在EPIC v2上包含3，000-10，000个尝试的微珠类型。试剂盒包含4个微珠芯片，以及用于处理32个样本的试剂。
Inf MethylationEPIC-8+ v2.0 Kit (96 Spl)
20097752
半定制EPIC v2，在EPIC v2上包含3，000-10，000个尝试的微珠类型。试剂盒包含12个微珠芯片，以及用于处理96个样本的试剂。
服务 (1)
Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site
20015273
在客户现场提供为期三天的实践指导，帮助用户熟悉Infinium实验方案的基本步骤。本课程提供了有关样本和BeadChip制备、使用iScan系统进行样本扫描以及使用芯片分析软件进行原始数据评估和分析的实践培训。
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常见问题解答
Infinium Methylation EPIC v2.0 BeadChip Kit利用强大的Infinium化学技术，基于亚硫酸氢盐转化基因组DNA的高度多重基因分型，检测CpG岛上的胞嘧啶甲基化。深入了解基于定量芯片的甲基化测量。
该试剂盒使用Illumina Methylation Assay，这是一种芯片技术，可在单CpG位点水平上进行定量甲基化测量，为研究正常和患病细胞中DNA甲基化的生物学作用提供支持。深入了解 Illumina Methylation Assay。
Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit包含186K个新探针，靶向ATAC-Seq和ChIP-seq实验鉴定的与原发性肿瘤相关的已知增强子、超增强子、CTCF结合位点和染色质开放区域。了解Infinium MethylationEPIC v2.0数据表的其他改进。
GenomeStudio Methylation Module可提取β值，并为Infinium MethylationEPIC芯片数据提供簇生成和归一化。此外，Bioconductor中还有许多免费软件应用程序，例如chAMP和SeSAMe，它们提供了增强的归一化和可视化选项。Illumina不直接为这些免费软件解决方案提供技术支持。 查看更多甲基化芯片数据分析技巧。
Zymo EZ DNA Methylation Lightning Kit是Infinium工作流程推荐的亚硫酸氢盐转化试剂盒。第三方亚硫酸氢盐转化试剂盒必须单独购买。深入了解经验证的Infinium Methylation BeadChip亚硫酸氢盐转化试剂盒。
输出文件的 JPEG 文件平均约为 2.75 Gb，这是默认设置。
每个BeadChip芯片的扫描大约需要18–37分钟。
是的，Infinium MethylationEPIC v1.0和HumanMethylation450 BeadChip试剂盒已经停产。 Infinium MethylationEPIC v2.0试剂盒基于相同的可靠Infinium化学技术基础构建，提供专家精选的增强内容，是两种试剂盒的推荐替代品。
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结果
MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
Infinium Custom Methylation Kit
完全可定制的甲基化芯片，适用于大型靶向表观遗传学应用。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
在整个甲基化组中具有超过285,000个标记，用于对多种小鼠品系进行高分辨率表观遗传学分析。
Infinium® FFPE QC and DNA Restoration Kit
评估样本质量，并修复降解的FFPE DNA样本用于Infinium芯片分析。
Illumina DNA Prep with Enrichment
基于快速且集成的流程，兼容定制化和成品化的富集panel，为各种应用提供完整的靶向重测序解决方案。
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