NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit兼具全面的专家精选内容和高样本通量。
Infinium Mouse Methylation BeadChip
在整个甲基化组中具有超过285,000个标记，用于对多种小鼠品系进行高分辨率表观遗传学分析。
每周＞1000个样本（8个样本BeadChip的每个Tecan）
样本通量
每个芯片12个样本
样本数量
固定标记：＞28.5万
标志物数量
概述
全面覆盖基因区域
Infinium Mouse Methylation BeadChip可均衡覆盖CpG岛、翻译起始位点、增强子、印迹位点和其他区域。Infinium HD化学技术能够进行内容选择，不受通常与甲基化DNA捕获方法相关的偏差限制的影响。
实验分析方法可重现性高
Infinium Mouse Methylation BeadChip在技术重复之间实现了> 98%的重现性，并且与全基因组亚硫酸氢盐测序数据之间具有高度相关性。
广泛的应用范围
支持表观基因组关联研究、异种移植实验、临床前研究等应用。
规格
需要的产品
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结果
应用
Infinium Mouse Methylation BeadChip支持广泛的小鼠表观遗传学分析研究，包括表观基因组关联研究、临床前研究、异种移植研究等。
工作流程示例
相关应用和方法
Genome-wide methylation profiling studies with microarray and NGS technologies can provide novel insights into the functional impact of methylation.
Illumina offers solutions for epigenetic analysis. Use our tools to study epigenetic modifications and their impact on gene regulation.
Learn how to profile gene expression changes for a deeper understanding of biology.
特色应用说明
文档
产品资料
支持文档
图表
使用Infinium I和Infinium II检测设计实现广泛的覆盖度
该芯片同时使用Infinium I和Infinium II检测。Infinium I检测设计每个CpG位点采用两种微珠类型，甲基化和非甲基化状态各1种。Infinium II设计采用1种微珠类型，在杂交后的单碱基延伸步骤中确定甲基化状态。
使用Illumina GenomeStudio软件进行集成数据分析
GenomeStudio软件支持在任何平台上进行DNA甲基化分析。数据以直观的图形显示，例如热图。
比较
| Infinium Mouse Methylation BeadChip | Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 实验分析方法类型 | Infinium HD Methylation | Infinium HD Methylation | |||
| 自动化功能 | 自动化芯片装载器 | 自动化芯片装载器 | |||
| 起始量 | DNA＞250 ng | 250 ng DNA | |||
| 系统 | iScan | NextSeq 550 Desktop Sequencer, 研究模式下的NextSeq 550Dx, iScan | |||
| 方法 | 甲基化 芯片 | 甲基化 芯片 | |||
| 核酸类型 | DNA | DNA | |||
| 标志物数量 | 固定标记：＞28.5万 | ~ 930k | |||
| 样本数量 | 每个芯片12个样本 | 每个芯片8个样本 | |||
| 样本通量 | 每周＞1000个样本（8个样本BeadChip的每个Tecan） | 3024 samples per week on a single iSCAN | |||
| 样本类型详情 | 可用于新鲜/冷冻组织。分析包括DAC在内的外源化学物质诱导的DNA甲基化变化。 | 还与口腔细胞和新鲜/冷冻组织兼容 | |||
| 特殊的样本类型 | 血液, FFPE组织, 唾液 | 血液, FFPE组织, 游离DNA, 唾液 | |||
| 物种 | 小鼠 | 人 | |||
| 技术 | Illumina芯片 | Illumina芯片 | |||
| 变异类别 | 差异甲基化胞嘧啶 | 差异甲基化胞嘧啶 |
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20041558
包含两个12个样本的BeadChip芯片和用于扩增、片段化、杂交、标记和检测24个DNA样本的试剂。起始量需要≥250 ng DNA。每个试剂盒按一批处理。
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (48 samples)
20041559
包含4个12样本BeadChip芯片和用于扩增、片段化、杂交、标记和检测48个DNA样本的试剂。起始量需要≥250 ng DNA。每个试剂盒按单批次处理。
Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (96 samples)
20041560
包含8个12样本的BeadChip芯片和用于扩增、片段化、杂交、标记和检测96个DNA样本的试剂。起始量需要≥250 ng DNA。每个试剂盒按一批处理。
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常见问题解答
使用标准的Infinium甲基化方案，GenomeStudio Methylation Module软件应检测芯片上≥96%的位点，假设每个样本的起始量至少为250 ng的高质量完整基因组DNA。
GenomeStudio Methylation Module可提取β值，并为Infinium Mouse Methylation BeadChip数据提供簇生成。目前不支持使用Mouse Methylation BeadChip进行GenomeStudio质控品均一化。此外，目前不支持BeadArray Controls Reporter软件工具。
Bioconductor中有许多免费软件应用程序，例如SeSAMe，它们提供了增强的归一化和可视化选项。Illumina不直接为这些免费软件解决方案提供支持。
BeadChip包含SNP，因此研究人员可以生成其样本的DNA指纹，作为额外的质量控制水平。具体而言，对于Mouse Methylation BeadChip芯片，包含SNP探针，有助于鉴定所分析DNA的菌株来源。请参阅Infinium HD Methylation Assay参考指南，了解更多信息。BeadChip上的SNP检测未在检测指南中提及，仅在GenomeStudio Methylation Module中简要描述。
因美纳尚未对芯片进行5-hMc验证。然而，文献使用了Infinium HumanMethylation450K和MethylationEPIC BeadChips进行5-hMc分析，该实验方案可能会在Infinium Mouse Methylation BeadChip上运行。
有关详细信息，请参阅Nazor KL、Boland MJ、Bibikova M等人。基于芯片的低成本技术——TAB芯片——在人类多能干细胞中以单碱基分辨率对5mC和5hmC进行定量和定位。Genomics. 2014；104（5）：358-367. doi： 10.1016/j.ygeno.2014.08.014
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结果
MiSeq Reagent Kit v3
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TruSight Oncology 500
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