废水监测
废水监测是一种检测、识别和表征废水中病原体的方法。该方法提供的数据有助于在社区层面监测疫情和其他威胁。
在复杂样本中，靶向微生物测序是一种有效分离微生物DNA/RNA序列与非微生物DNA/RNA序列的方法，同时可以让研究人员有效地识别和表征目标微生物。扩增子测序和杂交捕获富集等技术借助新一代测序（NGS）的强大功能，可以有效降低测序成本并简化数据分析。
高效测序关键微生物靶标
使用靶向NGS降低成本并加速分析
什么是靶向微生物测序？
NGS工作流程查找工具
消除后续工作流程中的猜测。NGS工作流程查找器提供个性化的解决方案建议和资源，以便您可以放心地进行测序。
扩增子vs杂交捕获富集
扩增子测序和杂交捕获是进行靶向测序的常用方法。根据研究目标，每种方法都有不同的注意事项。扩增子测序是一种高度靶向方法，用于分析特定基因组区域的遗传变异。该方法使用专门设计的寡核苷酸引物来靶向和扩增小型基因组或特定目标区域，然后再进行NGS。杂交捕获方法使用针对目标基因组区域的生物素化探针。探针结合后，这些杂交的基因组片段可被链霉亲和素捕获，用于扩增和测序。
| 扩增子测序 | 杂交捕获 | |
|---|---|---|
| 靶标 | 少量靶标 |
大量靶标 |
| 使用案例示例 | 单一病毒变异体追踪 |
广泛的病原体监测 |
| 工作流程 | 更简单、更快速的周转时间 |
更加复杂且耗时 |
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精准宏基因组学（PMG）的时代已经到来。查看此电子书，了解为什么通过杂交捕获富集方法实现精准宏基因组学研究是检测和表征复杂样本中病原体的创新解决方案。了解PMG如何改进公共卫生、工作流程和应用。
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靶向微生物测序的应用
靶向微生物测序工作流程
文库制备
一种低通量至中通量的NGS检测，能够识别并追踪新型SARS-CoV-2变异的出现和流行情况。
Illumina Microbial Amplicon Prep–Influenza A/B
一体化的全基因组NGS文库制备试剂盒，适用于针对甲型和乙型流感病毒的高影响力研究和公共卫生监测。
Illumina Microbial Amplicon Prep (IMAP)
一款灵活、一体化的NGS文库制备试剂盒，适用于多种公共卫生监测和微生物研究应用。
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
基于NGS的靶向检测，用于测序分枝杆菌、结核分枝杆菌复合群（MTBC）菌株和抗菌药物耐药性标志物。
测序
简单易用的桌面式测序，适用于靶向测序应用。
功能强大且小巧的系统，非常适合快速、经济高效的微生物测序应用。
将成熟的NGS技术与可调节的输出相结合，支持各种应用中的测序和芯片功能。
通过贯穿始终的全面工作流程助力探索。
分析
该应用程序旨在分析由因美纳杂交捕获（富集）panel或平铺扩增子panel（即COVIDseq）生成的测序文库。
将Deeplex Myc-TB靶向扩增子试剂盒生成的结果进行交互式可视化并轻松解读。
Prep
Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit
A streamlined workflow offering highly sensitive detection and characterization of common respiratory viruses, including SARS-CoV-2 strains.
Whole-genome sequencing of over 200 RNA and DNA viruses and subtypes identified as high-risk to public health.
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
Library prep and enrichment kit that delivers highly sensitive, comprehensive respiratory pathogen identification and antimicrobial resistance insights.
Urinary Pathogen ID/AMR Enrichment Kit
A library prep and enrichment kit that enables sensitive, culture-free detection and analysis of common and underrecognized uropathogens and AMR genes.
Sequence
Combine proven NGS technology with tunable output to enable sequencing and array capabilities across a range of applications.
Empower discoveries with a comprehensive workflow from start to finish.
Advanced chemistry, optics, and informatics combine to deliver exceptional speed and data quality, outstanding throughput, and scalability.
Analyze
DRAGEN Microbial Enrichment Plus
This app is designed to analyze sequencing libraries generated from Illumina microbiology enrichment based (hybrid-capture) panels, including the Viral Surveillance Panel v2 and Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit.
更多资源
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下载此电子书，了解NGS如何推动耐药结核病（DR-TB）研究的未来发展。了解DR-TB的全球影响、如何使用NGS推进WHO消灭结核病的目标，以及因美纳靶向和全基因组测序工作流程。
本应用说明详细介绍了使用Illumina COVIDSeq Assay and Respiratory Virus Enrichment Kit在废水样本中检测SARS-CoV-2变异和其他呼吸道病毒的方法。
本次网络研讨会介绍了如何使用NGS驱动的工具来评估慢性感染，例如尿路感染（UTI）和伤口感染，这些感染会因抗菌药物耐药性病原体而持续影响日常生活。
参阅本应用说明，深入了解用于高度灵敏检测和表征COVID-19毒株等常见呼吸道病毒的全面、快速的靶向富集测序工作流程。
视频资源
IMAP Workflow Series | Illumina Microbial Amplicon Prep Protocol
使用IMAP快速、灵活地制备文库
在本视频中，因美纳科学家Jeff Koble概述了Illumina Microbial Amplicon Prep Assay，并详细介绍了有助于确保成功制备文库的注意事项和技巧。
IMAP Workflow Series | DTMA (Dragen Targeted Microbial App) Workflow demo
使用DRAGEN Targeted Microbial App进行简单高效的IMAP分析
因美纳生物信息学科学家Soo Bin Kwon演示了DRAGEN Target Microbial如何全面分析使用IMAP测序的微生物靶标。
Primer design considerations for the IMAP protocol with PrimalScheme3
使用PrimalScheme3为IMAP实验方案设计引物
伯明翰大学的Christopher Kent介绍了PrimalScheme3，并讨论了引物设计的最佳实践，以帮助优化IMAP实验。
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