Infinium Global Diversity Array-8 Kit

BeadChip结合了出色的临床研究变异覆盖度和优化的多种族全基因组内容,适用于基因型筛查。

每周约1728个样本

样本通量

每个芯片8个样本

样本数量

1,825,277个固定标记。定制标记物扩展容量:高达175K

标志物数量

详情请参见规格表

我们建议使用Infinium Global Diversity Array-8 Kit替代已停产的Infinium Multi-Ethnic Global、Multi-Ethnic AMR/AFR和Multi-Ethnic EUR/EAS/SAS Kit。Global Diversity Array是Multi-Ethnic Kit的更新版本。

概述

Infinium Global Diversity Array 8-Kit(GDA)BeadChip是一款功能强大、经济高效的芯片,具有优化的多种族全基因组内容。

主要特点

  • 最新内容广泛覆盖临床研究变异,可用于一系列应用

  • 优化的内容可实现研究多样性

  • 高通量、可扩展的工作流使用户能够快速收集和报告数据

All of Us计划选择

GDA是该NIH精准医疗计划所信任的芯片的商业版本,该计划将收集超过100万人的数据,以改善健康结果。

大幅提高变异覆盖范围

用于基因组跨群体填补覆盖的高密度SNP全局骨架能够在不同群体中进行多基因风险评分开发和遗传结构表征。

 

多种族内容

通过与非洲裔美国人哮喘联盟(CAAPA)和基因组学和流行病学人口结构(PAGE)合作,该强大的全基因组支架旨在标记全球群体中的常见变异和低频变异。内容包括来自非洲血统和整个美洲地区人群的1,000多个全基因组序列。


规格


需要的产品

将您选择的试剂盒大小与每次运行的样本数量相匹配。每个试剂盒均按单批次处理,不可用于多个实验。如果要处理多个低通量批次,请订购多个小型试剂盒。

您可以选择使用DesignStudio自定义您的内容,也可以从作为联盟助推器的可选附加内容列表中选择。Booster附加内容可用于:

  • 神经退行性疾病(约75K SNP)

  • 肿瘤学(约9万个SNP) 

  • 携带者筛查(与Igentify合作进行解读)

请咨询您的销售代表,确认可用性和定价。

/ 结果

应用

Infinium Global Diversity Array-8 Kit是一款功能强大、经济高效的BeadChip芯片,具有经过优化的多种族全基因组内容,适用于群体规模的遗传研究、变异筛查和精准医疗研究。  

工作流程示例

1
选择内容

Infinium Global Diversity Array

3
追踪、分析和报告

相关应用和方法

比较

Infinium Global Diversity Array-8 Kit Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 v2.0 Kit Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8
Assay type Infinium LCG Infinium LCG Infinium HTS Infinium LCG
自动化功能 Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader Liquid handling robots, Automated array loader
说明 8样本的Infinium Diversity Array为整个基因组的4800多个关键基因提供了目标区域覆盖度。BeadChip中包含约180万个标记物,可高度覆盖疾病相关区域的外显子,提供高度准确的拷贝数变异检出,平均分辨率为1.5 Mb。 Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx基于8样本BeadChip芯片构建,包含>190万个标记。它是最全面的基因分型芯片,可用于药物基因组学(PGx)研究,还支持疾病和多样性研究以及其他应用。   Infinium Global Screening Array-24 Kit是用于群体规模遗传学、转化研究、变异筛查研究和精准医学研究的经济型基因分型芯片,结合了优化的多种族全基因组内容、精选的临床研究变异和QC标记。 Infinium Global Diversity Array with Carrier Screening Content-8 BeadChip扩展了携带者筛查研究,在全球多样性芯片骨架上具有超过45K00个高影响力标记。Igentify Analyze软件简化了分析,可对关键疾病实现高检出率。 8样本Infinium Global Diversity Array with Cytogenetics-8可广泛靶向覆盖整个基因组中的4800多个关键基因。BeadChip中包含约180万个标记物,可高度覆盖疾病相关区域的外显子,提供高度准确的拷贝数变异检出,平均分辨率为1.5 Mb。
起始量 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA 200 ng DNA
系统 iScan iScan iScan iScan iScan
方法 Genome-wide genotyping array Genome-wide genotyping array High-throughput genotyping array, Genome-wide genotyping array Genome-wide genotyping array Cytogenomic array, Genome-wide genotyping array
核酸类型 DNA DNA DNA DNA DNA
标志物数量 1,825,277个固定标记。定制标记物扩展容量:高达175K 总计1,933,117个标志物;定制扩展容量175,000个 654,027个固定标记。自定义标记附加功能: 高达100K 
样本数量 每个芯片8个样本 每个芯片8个样本 每张芯片24个样本 每个芯片8个样本 每个芯片8个样本
样本通量 每周约1728个样本 每周约1728个样本 每周约5760个样本
特殊的样本类型 Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva Blood Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva Blood Blood, FFPE tissue, Buccal swabs, Saliva
物种
技术 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片
变异类别 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Chromosomal abnormalities, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Structural variants, Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Chromosomal abnormalities, Copy number variants (CNVs)

选择工具:

Infinium Global Diversity Array内容

内部饼图显示了选择用于全基因组覆盖、临床研究和质量控制(QC)的芯片的比例。外环显示1kGP中存在的唯一变异的加权参考全局等位基因频率。2未标记1kGP中的变异。计数代表唯一变异。

Global Diversity Array上的临床研究内容

临床研究内容是由专家从科学界公认的数据库中挑选的,用于为临床研究应用创建一款信息量大的芯片。变异数量可能会有变化。

Global Diversity Array上广泛的药物基因组学标记

根据CPIC指南和PharmGKB数据库选择。3PGx公共数据库变异,在PharmGKB、PharmVar、CPIC中注释的变异;全基因组PGx覆盖度,包括位于扩展ADME基因或CPIC A级基因中的标记,包括靶向填补标签SNP和CPIC A级CNV标签。

广泛覆盖全球多样性芯片上的疾病类别

(A) 根据ClinVar美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)注释,按病理学分类范围对变异进行分类。(B) ClinVar数据库中按类别划分的全球多样性芯片临床研究内容。变异数量可能会有变化。

Global Diversity Array上的QC标记

芯片上的QC变异支持各种样本追踪功能,例如性别确定、大陆血统、人类鉴定等。

相关资源

Illumina多基因风险评分解决方案是一套全面、易于实施且通用的基因组分析工具,适用于转化研究人员。

固定内容 (4)

Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (16 samples)

20031669

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含两个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测16个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (48 Samples)

20031810

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us. U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可切割的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含6个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测48个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (96 samples)

20031811

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含12个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测96个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8 v1.0 Kit (384 Samples)

20031812

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含48个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测384个DNA样本的试剂。

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附加内容 (4)

Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (16 Samples)

20031813

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含两个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测16个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (48 Samples)

20031814

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含6个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测48个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (96 Samples)

20031815

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含12个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测96个DNA样本的试剂。

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Infinium Global Diversity Array-8+ v1.0 Kit (384 Samples)

20031816

Global Diversity Array(GDA)是与All of Us U.S. Precision Medicine Initiative合作构建的高密度、可定制的基因分型工具。GDA提供无与伦比的数据质量、强大的多种族覆盖,并广泛覆盖临床相关变异和药物基因组学标志物。每个试剂盒包含48个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测384个DNA样本的试剂。

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服务 (1)

Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site

20015273

在客户现场提供为期三天的实践指导,帮助用户熟悉Infinium实验方案的基本步骤。本课程提供了有关样本和BeadChip制备、使用iScan系统进行样本扫描以及使用芯片分析软件进行原始数据评估和分析的实践培训。

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常见问题解答

Infinium GDA在Illumina人类芯片产品系列中提供了最具成本效益的每种变异覆盖度,是旨在最大限度地提高基因分型投资回报率的精准医疗项目的理想选择。与所有市售芯片相比,Infinium GDA with Enhanced PGx Content是可用于PGx研究的最全面的芯片。1查看 Infinium GDA with Enhanced PGx Content产品页面的更多差异。

多基因风险评分(PRS)代表个体具有的遗传变异总数,会增加其患上某种复杂疾病的风险。Global Diversity Array 8-Kit让研究人员能够在不同的群体中进行PRS评估。深入了解多基因风险评分

/ 结果
参考文献
  1. 根据存档数据计算。Illumina公司 2021 年 3 月。

  2. 千人基因组计划。 1000 genomes.org。 2021 年 8 月 24 日查阅。

  3. PharmGKB,药物基因组学知识库。 www.pharmgkb.org。2021年8月4日查阅。

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