TruSight Cancer

这些专家定义的测序研究panel靶向与多种癌症易感性相关的94个基因和284个SNP。

1.5天

分析时间

5小时

手动操作时间

50 ng DNA

起始量

详情请参见规格表

概述

这些预设计的即用型寡核苷酸是与癌症基因组学专家共同开发的,能让研究人员对与癌症易感性相关的各种基因和单核苷酸多态性(SNP)进行测序。

  • 靶向与癌症易感性相关的94个基因和284个SNP

TruSight Cancer包括与常见(如乳腺癌、直肠癌)和罕见癌症相关的基因。此外,该试剂盒还包括通过全基因组关联研究(GWAS)发现的与癌症相关的284个SNP。其内容根据业内专家对科学文献及其他高质量资源的筛选整理而选定。

TruSight Cancer测序panel提供靶向经过鉴定的目标区域的定制寡核苷酸。提供了足以进行四次富集反应的产品。TruSight Cancer与 TruSight Rapid Capture兼容。

TruSight Cancer样本数据集

使用TruSight Cancer测序panel制备了6个人类参考样本。将这些文库在MiniSeq系统上以2x100 bp读长、带双端标签的配置,使用高通量试剂盒进行测序。总产量为5.2 Gb,95.8%的碱基处于或高于Q30。

该产品是Illumina Advantage(TG)产品。Illumina Advantage大规模测序产品分批配送和测试,其保质期更长,且如有变动会预先通知,提高实验室的效率。


规格


需要的产品

所需配件

您还需要以下一种或多种富集产品。

/ 结果

应用

工作流程示例

1
制备

TruSight Cancer

3
分析

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
MiniSeq System

Samples per run: mid output: 12, high output: 24 (based on > 20x coverage per target)

长达2 × 150 bp

MiSeq System

Samples per run (by reagent kit version): v2: 12, v3: 24 (based on > 20x coverage per target)

长达2 × 150 bp

NextSeq 550 System

Samples per run: mid output: 96, high output: 96 (based on > 20x coverage per target)

长达2 × 150 bp


相关应用和方法

其他人如何使用该产品

MGZ医学遗传中心的研究人员采用Infinium CytoSNP-850K BeadChip芯片和TruSight Cancer Panel分析染色体异常。

比较

TruSight Cancer TruSight Hereditary Cancer Panel AmpliSeq for Illumina BRCA Panel
分析时间 1.5天 从DNA到数据约48小时 5小时(仅文库制备;不包括文库定量、归一化或混合时间)
Cancer type Pan-cancer Pan-cancer, Solid tumor Solid tumor
内容说明 固定的探针集富集了与常见和罕见癌症相关的94个基因和284个SNP。 靶向113种癌症风险相关基因 BRCA1BRCA2的外显子区域和侧翼内含子序列
说明 常见和罕见癌症的生殖系突变检测研究。 TruSight Hereditary Cancer Panel是一种靶向测序panel,旨在评估113个基因和125个单核苷酸多态性(SNP)的生殖系突变,用于鉴定和多基因风险评分。  BRCA BRCA1 BRCA2的生殖系和体细胞分析研究。
手动操作时间 5小时 约2小时 <1.5小时
起始量 50 ng DNA 50–1000 ng DNA  1–100 ng(建议每个混池10 ng)
系统 MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NextSeq 500 Desktop Sequencer MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System
方法 Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Target enrichment Targeted DNA sequencing, Amplicon sequencing
多重分析 多达96重 96个双标签序列组合
核酸类型 DNA DNA DNA
特殊的样本类型 Not FFPE-compatible, Not FFPE-compatible Blood, Saliva Blood, FFPE tissue
物种
技术 Illumina测序 Illumina测序 Illumina测序
变异类别 Germline variants Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels)

富集panel (12)

TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)

FC-121-0202

TruSight Cancer能靶向与多种癌症易感性相关的94个基因和284个SNP,与Nextera Flex for Enrichment联合使用时,为单一杂交的工作流程,足够进行8次富集反应,与TruSight Rapid Capture联合使用时足够进行4次富集反应。文库制备、富集和标签接头试剂需单独订购。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

包括用于制备和富集96个文库的试剂(8次12重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

包含用于制备和富集16个文库的试剂(16,1重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(96样本))一起订购。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(16样本))一起订购。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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TruSight Rapid Capture (1 index, 8 samples, 8 enrichments)

FC-140-1101

含进行八次1重富集、制备8个文库所需的试剂。包含1个唯一标签组合。

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TruSight Rapid Capture (2 indexes, 8 samples, 4 enrichments)

FC-140-1102

含进行四次2重富集、制备8个文库所需的试剂。包含2个唯一标签组合。

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TruSight Rapid Capture (4 indexes, 16 samples, 4 enrichments)

FC-140-1103

包含通过四重4重富集制备多达16个文库的试剂。包含4种唯一标签组合。

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 48 samples, 4 enrichments)

FC-140-1104

包含通过4次12重富集制备多达48个文库的试剂。包含24个唯一标签组合。

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TruSight Rapid Capture (24 indexes, 96 samples, 8 enrichments)

FC-140-1105

包含通过8次12重富集制备多达96个文库的试剂。包含24个唯一标签组合。

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TruSight Rapid Capture (96 indexes, 288 samples, 24 enrichments)

FC-140-1106

含进行二十四次12重富集、制备288个文库所需的试剂。包含96个唯一标签组合。

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Illumina Advantage产品 (1)

TG TruSight™ Cancer Sequencing Panel

TG-141-1002

包含用于癌基因的寡核苷酸;主要适用于癌症易感性和相关疾病的关联基因。所含的试剂量可供4次富集反应使用。

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将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

关于针对产品特定用途的生物标记专利及其他专利的说明:
某些基因组变异,包括某些核酸序列,当它们用于特定应用时可能得到专利保护。建议客户确定是否需要从拥有此类专利的第三方获得相应许可,以便在其特定应用中使用本产品。

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