NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
这些试剂降低了测序数据中的背景噪声，能够检测低频变异，例如游离DNA（cfDNA）中的变异。
TruSight Oncology UMI Reagent
使用唯一分子标记（UMI）对新一代测序文库进行误差修正。
1.5天
分析时间
5小时
手动操作时间
30 ng游离DNA
起始量
概述
降低错误率
循环肿瘤DNA（ctDNA）可能代表cfDNA的极小部分，接近新一代测序（NGS）的检测限。TruSight Oncology UMI Reagent通过UMI和错误校正软件解决了这一挑战，将错误率降低至＜0.007%，并能够检测低频变异。较低的错误率增加了分析特异性，导致NGS数据的置信度更高。
工作流程集成
TruSight Oncology UMI Reagent包括UMI接头和标签，以及DNA文库制备和富集试剂。这些试剂还可以与TruSight Tumor 170 DNA寡核苷酸配对。集成UMI不会在文库制备工作流程中创建任何额外步骤。
用于纠错的直观软件
UMI Error Correction App进行比对read，然后使用UMI排除假阳性，减少变异检出错误。UMI Error Correction App在基于云的BaseSpace Sequence Hub中可用，也可用于本地安装。
规格
| 分析时间 | 1.5天 |
|---|---|
| 癌症类型 | 泛癌种 |
| 手动操作时间 | 5小时 |
| 起始量 | 30 ng游离DNA |
| 系统 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪 |
| 方法 | 靶向DNA测序 |
| 核酸类型 | DNA |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE, 游离DNA |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
需要的产品
TruSight Oncology UMI Reagent不含任何富集探针。如果您想使用TruSight Tumor 170 DNA探针组，请单独购买TruSight Tumor 170 Content Set。
为方便起见，TruSight cfDNA 仪器套装包含生成文库和在所选仪器上以推荐的测序深度对 48 个样本进行测序所需的所有试剂。
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结果
应用
工作流程示例
制备
TruSight Oncology UMI Reagent
分析
Local UMI Error Correction App
请联系您当地的因美纳支持团队以访问Local UMI Error Correction App。
*NovaSeq 6000系统的性能已得到证明，但未经过广泛测试。
相关应用和方法
我们的临床癌症研究解决方案能提供准确的基因组信息，让实验室能够在单次检测中分析多个基因。
通过定向重测序，可以将一个基因子集或基因组区域分离出来并进行测序，从而节省实验室资源。
与单基因和基于阵列的方法相比，基于 NGS 的癌症测序方法可在更短的时间内提供更多信息。
文档
产品资料
图
背景减少有助于准确检出变异
为了准确检测罕见变异，将UMI与误差修正软件集成，能够将真正的突变与背景噪声区分开来。下图说明了通过消除导致假阳性的固有错误来降低错误率，如何可以将真正的突变（红点）与背景噪声（灰点）更好地区分开来。
使用UMI降低错误率
使用TruSight Oncology UMI Reagent与TruSight Tumor 170 DNA检测的DNA内容配对进行文库制备。在HiSeq 4000系统上，在四次独立测序运行中分配了31个样本。显示了使用UMI Error Correction App时未拆分和拆分read的平均错误率。
| 测序运行 | 平均错误率（未拆分的read） | 平均错误率（拆分的read） |
|---|---|---|
| 1 | 0.038% | 0.0023% |
| 2 | 0.043% | 0.0024% |
| 3 | 0.035% | 0.0024% |
| 4 | 0.084% | 0.0019% |
TruSight Oncology UMI Reagents (16 indexes, 48 samples)
20024586
包含TruSight Oncology DNA文库制备和富集试剂以及TruSight UMI工具包。提供足够的试剂，用于生成48个含UMI的文库，包含16个唯一标签对。用于生成错误率较低的文库，能够检测低频变异。不含富集探针——TST170内容可单独购买。
TruSight® Tumor 170 Content Set
20010188
TST170试剂盒中170个基因的DNA和RNA探针。
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MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
TruSight Tumor 170
全面的新一代测序（NGS）检测，靶向170个实体瘤相关基因。
BaseSpace Sequence Hub | 运行管理和简化的生物信息学
易于使用的云端基因组运行管理和生物信息学计算和存储环境，可实现安全、高性能的测序操作。
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