NTRK融合
癌症NTRK融合筛查
无论是何种癌症组织谱系，在15%的转移性癌症中均能检测到基因融合。激酶融合占已知融合的35%¹ ，已成为多种新疗法的靶标，包括针对神经营养性酪氨酸激酶基因融合 (NTRK1、NTRK2和NTRK3)的疗法。
为什么NTRK融合在癌症中具有重要意义
随着新融合伴侣的频繁发现，NTRK生物学的多样性和复杂性不断增加。无论是何种融合伴侣，可靶向的激酶融合都会对酪氨酸激酶抑制剂产生反应2。由于市售的基于扩增子的NTRK检测产品可能会遗漏NTRK融合伴侣3-5，因此能够检测新型融合伴侣的综合性检测产品具有重要价值。
采用市售的基于扩增子的检测方法，可能会遗漏70%的NTRK融合伴侣。 3-5
采用基于NGS的方法检测新型NTRK融合
新一代测序（NGS）使用杂交捕获化学技术检测RNA，可以捕获新的NTRK融合。由于引物设计中不存在先验知识，可以捕获未知的融合伴侣并进行测序，从而发现新的生物标志物。
对临床医生来说，有越来越多的基因融合都具有重要意义——ALK、RET、RAS、NTRK、FGFR。使用NGS方法，您能够通过单次反应检测所有这些基因融合，不需要额外的组织。
CGP能够在单次检测中分析NTRK和更多基因的RNA融合
基于融合的生物标志物和癌症靶向疗法的数量在持续增加。如果时间和样本有限时，针对单个生物标志物的重复检测可能难以完成。CGP将相关生物标志物整合到单一检测中，并采用杂交捕获化学技术进行新型融合检测，可以显著节省样本、时间和成本。
NTRK工作流程示例
文库制备
测序
数据分析
Local Run Manager TruSight Oncology Comprehensive（EU）分析模块（机载软件）
*CE认证的IVD产品
NTRK融合相关新闻和访谈
为存在罕见基因突变的患者寻找靶向疗法
Illumina TruSight Oncology Comprehensive（EU）检测试剂盒支持携带NTRK基因融合的癌症患者使用拜耳的维泰凯®（拉罗替尼）进行靶向治疗
与医学博士Vivek Subbiah一起检测融合
医学博士Vivek Subbiah解释了罕见和常见肿瘤患者如何从基于新一代测序的NTRK基因融合检测中获益。
合作评估内部CGP对改善患者护理的影响
因美纳和Allegheny Health Network合作，评估组织和血液样本内部检测的有效性，并确定在哪些情况下血液检测更有优势。
参考文献
- Zehir, et al. Mutational Landscape of Metastatic Cancer Revealed from Prospective Clinical Sequencing of 10,000 Patients Nat Med. 2017;23(6):703-713.
- Vitravki [package insert]. Stamford, CT: Loxo Oncology, Inc; November 2018.
- Hsiao SJ, Zehir A, Sireci AN, Aisner DL. Detection of tumor NTRK gene fusions to identify patients who may benefit from TRK inhibitor therapy. J Mol Diagn. 2019. doi: 10.1016/j.jmoldx.2019.03.008.
- OncomineTM Focus Assay, AmpliSeqTM Library page. https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/A35957. Accessed February 14, 2019.
- St. James’s Hospital, Cancer Molecular Diagnostics Solid Tumour Service User Guide, http://www.stjames.ie/Departments/DepartmentsA-Z/C/CancerMolecularDiagnosticsLaboratory/DepartmentinDepth/User%20handbook%20v2.pdf. Accessed February 14, 2019.
- Cheng DT, Mitchell TN, Zehir A, et al. Memorial Sloan Kettering-Integrated Mutation Proling of Actionable Cancer Targets (MSK-IMPACT): A hybridization capture-based next-generation sequencing clinical assay for solid tumor molecular oncology. J Mol Diagn. 2015;17(3):251-264.