流动槽类型 | 15亿 | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 约165 Gb | 约1 Tb | N/A |
2×100 bp | 约330 Gb | 约2 Tb | N/A |
2 × 150 bp | 约500 Gb | 约3 Tb | 约8 Tb |
高通量测序的新标准
NovaSeq X基因测序仪和NovaSeq X Plus基因测序仪将测序输出、样本通量和技术参数再次提升了一个档次
流动槽类型 | 15亿 | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 约165 Gb | 约1 Tb | N/A |
2×100 bp | 约330 Gb | 约2 Tb | N/A |
2 × 150 bp | 约500 Gb | 约3 Tb | 约8 Tb |
* 规格基于Illumina PhiX质控文库或使用NA12878在相应簇密度下创建的TruSeq DNA文库的测序表现。
流动槽类型‡ | 15亿 | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 约165-330 Gb | 约1-2 Tb | N/A |
2×100 bp | 约330-660 Gb | 约2-4 Tb | N/A |
2 × 150 bp | 约500-1000 Gb | 约3-6 Tb | 约8-16 Tb |
流动槽类型‡ | 15亿 | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 约165 Gb | 约1 Tb | N/A |
2×100 bp | 约330 Gb | 约2 Tb | N/A |
2 × 150 bp | 约500 Gb | 约3 Tb | 约8 Tb |
* 规格基于Illumina PhiX质控文库或使用NA12878在相应簇密度下创建的TruSeq DNA文库的测序表现。
†NovaSeq X Plus基因测序仪支持单流动槽运行或双流动槽运行。NovaSeq X基因测序仪支持单流动槽运行。
流动槽类型 | 15亿 | 10B | 25B |
---|---|---|---|
每个流动槽的人类基因组 | ~4 | 约24个 | 约64个 |
每个流动槽的外显子组 | 约41 | 约250个 | 约750 |
每个流动槽的转录组 | 约30个 | 约200个 | 约520 |
*所有样本通量均为每次单流动槽运行的估计值。人类基因组假设每个样本的数据>120 Gb,以实现30倍的基因组覆盖度。外显子组假设每个样本约8 Gb或 约40 M read,以实现100倍覆盖度。对于转录组,假设能够生成≥ 50M reads。通量可能因多种因素而异,包括外显子组panel大小、所需深度和使用的文库制备试剂盒。
流动槽类型 | 15亿 | 10B | 25B |
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单端read | 16亿 | 100亿 | 260亿 |
双端read | 32亿 | 200亿 | 520亿 |
流动槽类型 |
15亿 | 10B | 25B |
---|---|---|---|
质量分值 | |||
2 × 50 bp | ≥ 90%的碱基分值高于Q30 | ||
2×100 bp | ≥ 85%的碱基分值高于Q30 | ||
2 × 150 bp | ≥ 85%的碱基分值高于Q30 | ||
运行时间 | |||
2 × 50 bp | 约17小时 | 约18小时 | N/A |
2×100 bp | 约20小时 | 约22小时 | N/A |
2 × 150 bp | 约23小时 | 约25小时 | 约48小时 |
*质量分值(Q值)是对碱基检出中错误发生几率的预测。整个运行中>Q30的碱基百分比取平均值。质量分值的计算基于使用Illumina PhiX质控文库和NovaSeq X系列10B试剂。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同,性能表现可能有所差异。
†运行时间包括自动簇生成、测序、自动运行后清洗和碱基检出时间。运行时间基于相应簇密度下Illumina PhiX对照文库的运行时间来计算的。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同,性能表现可能有所差异。
NovaSeq X系列由XLEAP-SBS化学技术提供支持,该技术是速度快、质量优、可靠性高的边合成边测序(SBS)化学技术。XLEAP-SBS化学技术以成熟的标准Illumina SBS化学技术为基础,可提供更高的试剂稳定性,使核苷酸结合时间获得两倍加速。
NovaSeqX系列整合了阵列式流动槽技术,能够以超高通量来支持一系列广泛的测序应用。NovaSeq X阵列式流动槽在某些固定的位置包含数百亿个纳米井,这种设计确保了待测序簇之间均匀间隔。大幅增加了单个流动槽上可支持的序列读数以及系统数据总输出。
NovaSeq X基因测序仪和NovaSeq X Plus基因测序仪集成了DRAGEN Bio-IT平台,实现超快速、准确的基因组数据分析。能够在机载或云端模式下同时运行多个二级分析流程。在单次运行中,每个流动槽最多可同时运行四个应用程序。
集成式DRAGEN ORA(original read archive,原始读取存档)能够执行无损压缩,最多可使FASTQ文件缩小五倍。这种经过优化的基因组学数据压缩可加快数据传输的速度,让数据管理变得更轻松。数据占用空间较小,可减少存储和能耗成本。
NovaSeq X系列专为提高可持续性而设计。该系列融合了多项创新,包括可在室温下运送的冻干试剂,并将试剂包装废弃物减少约90%。塑料用量减少了50%以上,缓冲液卡盒由植物性生物聚合物制成。
NovaSeq X系列通过更高的数值孔径、定制CMOS传感器和采用蓝绿光学元件的双通道SBS实现超高分辨率成像。更短的波长允许纳米井间距更紧密,在NovaSeq X系列25B流动槽上实现多达260亿单端读数的数据输出。