准确、全面且高效的二级分析被整合到带有机载DRAGEN的NovaSeq X系列中。
NovaSeq X系列是唯一一款具有机载集成变异检出功能的超高通量仪器,可简化您的操作并缩短测序周转时间。自动启动数据分析,包括FASTQ文件生成、比对和变异检出。
重新思考机载DRAGEN带来的可能性
使用NovaSeq X系列大规模实施准确、高效的信息学工作流程
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准确、全面且高效的二级分析被整合到带有机载DRAGEN的NovaSeq X系列中。
NovaSeq X系列是唯一一款具有机载集成变异检出功能的超高通量仪器,可简化您的操作并缩短测序周转时间。自动启动数据分析,包括FASTQ文件生成、比对和变异检出。
机载DRAGEN二级分析兼具速度、灵活性和操作效率,能够缩短测序工作流程周转速时间。使用以下四个最常用的机载DRAGEN流程快速、无缝地分析数据。
与独立分析解决方案相比,手动接触点数量减少了4倍。1
通过简单易用的图形界面或导入样本表在本地或云端配置二级分析。在屏幕上查看QC指标、运行报告和分析进度。
DRAGEN机载运行时间a
DRAGEN流程 | 样本数量b | 运行时间c |
---|---|---|
BCL Convert(采用ORA压缩) | 24,576 | 约1小时30分钟 |
RNA(包含差异表达) | 1536个转录组(mRNA) | 约1小时30分钟 |
富集(生殖系) | 512个外显子组 | 约4小时30分钟至5小时30分钟 |
富集(体细胞) | 31 1,056× | 44分钟至53分钟 |
生殖系 | 48个30×全基因组 | 约3小时30分钟至约7小时30分钟 |
体细胞 | 8 344× | 约5小时40分钟至6小时40分钟 |
甲基化 | 40 64× | 5小时15分钟 |
a. 这些具有代表性的运行时间基于因美纳内部数据。客户运行时间可能会因样本质量、分析设置和样本配置而有所不同。
b. 双10B流动槽的推测样本数量基于因美纳内部数据。
c. 配置相同的双10B流动槽同时启动,或单10B流动槽。
d. 运行时间从3小时30分钟(定位和比对)到7小时30分钟(运行全部变异检出程序)不等。
通过硬件加速快速处理高通量数据。凭借四个机载现场可编程门阵列(FPGA),您可以实现更强大的DRAGEN分析,轻松处理NovaSeq X系统数据。在每次运行中,每个流动槽最多可同时执行四个应用程序。
减少数据占用空间,以更低的成本和能耗轻松管理和存储数据,内置压缩功能可将FASTQ文件的大小减少多达80%2。
将数据直接传输到位于云端的Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub,实现可扩展的数据管理、分析和整合。
进一步了解无损基因组数据压缩技术以及这种技术如何降低基因组数据存储和传输成本。
DRAGEN分析提供卓越的变异检出准确性。DRAGEN中的多基因组(图)参考和Illumina机器学习实现了出色的准确性,正如使用PrecisionFDA基准数据的F1评分所证明的那样。3
持续扩展产品创新,包括新流程、靶向检出程序,并提高难绘制区域的覆盖度。
通过Illumina Connected Analytics或BaseSpace Sequence Hub上的云端工作流程访问更广泛的应用菜单。
利用机载DRAGEN以及可压缩至原来1/5的无损ORA(Original Read Archive)基因组数据压缩功能降低数据存储成本。无损数据压缩功能可减少FASTQ文件的数据占用空间,从而将数据存储成本降低多达80%2。NovaSeq X系列附带DRAGEN硬件和软件许可证,其费用包含在仪器成本中。
通过整合DRAGEN机载二级分析与NovaSeq X系列,有助于您节省使用其他二级分析解决方案相关的成本。*
对于NovaSeq X基因测序仪,机载DRAGEN的综合节省成本(包括为期5年的软件许可证和云端存储)平均可达约100万美元;对于NovaSeq X Plus基因测序仪,综合节省成本可达约170万美元。4
了解更多: DRAGEN二级分析
*数据仅用于说明,具体结果可能有所不同,请联系您的因美纳代表了解更多详细信息。节省成本与通量呈正相关。此处的比较基于使用DRAGEN服务器和机载DRAGEN,并假设NovaSeq X系统需要两台服务器,NovaSeq X Plus系统需要四台服务器,再加上年度许可证和云端存储成本。
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