流动槽类型 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 约165 Gb | 约1 Tb | 约 2.6 Tb † |
2×100 bp | 约330 Gb | 约2 Tb | 约 5.3 Tb † |
2 × 150 bp | 约500 Gb | 约3 Tb | 约 8 Tb |
高通量测序的新标准
NovaSeq X和NovaSeq X Plus测序仪的技术规格、测序输出和样本通量
流动槽类型 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
2 × 50 bp | 约165 Gb | 约1 Tb | 约 2.6 Tb † |
2×100 bp | 约330 Gb | 约2 Tb | 约 5.3 Tb † |
2 × 150 bp | 约500 Gb | 约3 Tb | 约 8 Tb |
* 规格基于Illumina PhiX质控文库或使用NA12878在相应簇密度下创建的TruSeq DNA文库的测序表现。
NovaSeq X Plus测序仪能够进行单流动槽运行或双流动槽运行。双流动槽运行的输出量是上述列出的两倍。
NovaSeq X测序仪能够进行单流动槽运行。
† 该试剂盒需要系统软件版本1.3或更高版本。
流动槽类型 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
单端读数 | 1.6B | 10B | 26B |
双端读数 | 3.2B | 20B | 52B |
流动槽类型 |
1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
质量分值 | |||
2 × 50 bp | ≥ 90%的碱基分值高于Q30 | ||
2×100 bp | ≥ 85%的碱基分值高于Q30 | ||
2 × 150 bp | ≥ 85%的碱基分值高于Q30 | ||
运行时间 | |||
2 × 50 bp | 约17小时 | 约18小时 | 约25小时 †† |
2×100 bp | 约20小时 | 约22小时 | 约38小时 †† |
2 × 150 bp | 约23小时 | 约25小时 | 约48小时 |
*质量分值(Q值)是对碱基检出中错误发生几率的预测。整个运行中>Q30的碱基百分比取平均值。质量分值的计算基于使用Illumina PhiX质控文库和NovaSeq X系列10B试剂。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同,性能表现可能有所差异。
†运行时间包括自动簇生成、测序、自动运行后清洗和碱基检出时间。运行时间基于相应簇密度下Illumina PhiX对照文库的运行时间来计算的。根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同,性能表现可能有所差异。
††该试剂盒需要系统软件版本1.3或更高版本。
遵循本技术说明中概述的最佳实践,评估文库质量、优化加载浓度以及合并文库,从而在NovaSeq X系列上实现最佳性能。
流动槽类型 | 1.5B | 10B | 25B |
---|---|---|---|
每个流动槽的人类基因组数 | ~4 | ~24 | ~64 |
每个流动槽的外显子组数 | ~41 | ~250 | ~750 |
每个流动槽的转录组数 | ~30 | ~200 | ~520 |
*所有样本通量均为单流动槽运行的估算值。对于人类基因组,假设每个样本能够生成> 120 Gb的数据,从而实现30×的基因组覆盖度。外显子组假设每个样本需要约8 Gb或约4000万条读数以达到100×的覆盖度。转录组假设每个样本需要≥5000万条读数。通量可能会因多种因素而有所不同,包括外显子组panel的大小、所需的深度以及使用的文库制备试剂盒等。
NovaSeq X系列由XLEAP-SBS化学技术提供支持,该技术是速度快、质量优、可靠性高的边合成边测序(SBS)化学技术。XLEAP-SBS化学技术以成熟的标准Illumina SBS化学技术为基础,可提供更高的试剂稳定性,使核苷酸结合时间获得两倍加速。
NovaSeqX系列整合了阵列式流动槽技术,能够以超高通量来支持一系列广泛的测序应用。NovaSeq X阵列式流动槽在某些固定的位置包含数百亿个纳米井,这种设计确保了待测序簇之间均匀间隔。大幅增加了单个流动槽上可支持的序列读数以及测序仪数据总输出。
NovaSeq X系列测序仪集成了DRAGEN Bio-IT平台,实现超快速、准确的基因组数据分析。能够在机载或云端模式下同时运行多个二级分析流程。在单次运行中,每个流动槽最多可同时运行四个应用程序。
集成式DRAGEN ORA(original read archive,原始读取存档)能够执行无损压缩,最多可使FASTQ文件缩小五倍。这种经过优化的基因组学数据压缩可加快数据传输的速度,让数据管理变得更轻松。数据占用空间较小,可减少存储和能耗成本。
NovaSeq X系列专为提高可持续性而设计。该系列融合了多项创新,包括可在室温下运送的冻干试剂,并将试剂包装废弃物减少约90%。塑料用量减少了50%以上,缓冲液卡盒由植物性生物聚合物制成。
NovaSeq X系列通过更高的数值孔径、定制CMOS传感器和采用蓝绿光学元件的双通道SBS实现超高分辨率成像。更短的波长允许纳米井间距更紧密,在NovaSeq X系列25B流动槽上实现多达260亿单端读数的数据输出。