Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip

适用于大规模、靶向表观遗传应用的全定制化甲基化芯片。

每周最多可处理 5760 个样本(在 8 小时工作日内,配备 2 台 iScan 系统、1 台 AutoLoader 2x 和 2 台 Tecan 工作站)。

样本通量

每张芯片24个样本

样本数量

可额外增加 500-100,000 个用户自定义的 CpG 位点。

标志物数量

详情请参见规格表

概述

Infinium Custom Methylation Kit包含Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip plus试剂,使研究人员和商业用户能够为关键的表观遗传学研究应用开发突破性的检测方法。

高通量工作流程

Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip以24样本形式提供,具有更新的Infinium自动化方案和用于亚硫酸氢盐转化的自动化工作流程。这些功能可提高工作流程的效率,降低样本处理成本,支持用户扩大运营规模,每年处理的样本数可达到数十万个。

可定制内容

定制包含多达10万个额外标记的芯片,以创建独特的研究工具和商业产品。可以从现有的商业芯片或表观遗传数据库中选择内容。

可靠的Infinium化学技术

Infinium BeadChip设计实现了高度的甲基化探针复制,从而确保了较高的可重复性,相当于在甲基化测序实验中达到100倍覆盖的效果。1

Infinium Custom Methylation Kit主要特点

  • 可定制的内容支持多达100K个标志物

  • 在单个CpG水平上准确定量测量DNA甲基化

  • 快速的周转时间,可选择自动亚硫酸氢盐转化

规格

需要的产品

需要购买Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip-24试剂盒。每个试剂盒包含2个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测48个DNA样本的试剂。

需要iScan芯片扫描仪

可选的3天实践指导入门课程,涵盖Infinium实验方案中的所有基本步骤,包括样本和BeadChip制备、样本扫描以及使用芯片分析软件进行原始数据评估和分析。

/ 结果

应用

Infinium Custom Methylation Kit允许用户创建定制的高通量检测方法,以测量基因组目标区域的DNA甲基化,适用于商业和学术表观遗传学应用,包括常见疾病研究、癌症研究、表观遗传学衰老和营养基因组学。

工作流程示例

1
方法
2
扫描
3
分析

相关应用和方法

比较

Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip Infinium Methyl EX iSelect Custom BeadChips
自动化功能 自动化芯片装载器 自动化芯片装载器, ⾃动化⼯作站
说明 使用 DesignStudio 检测设计工具,本产品允许实验室创建高通量、定制化的 24 或 48 样本 BeadChip,以高效、准确地评估人类及部分非人类样本中多达 100,000 个 CpG 位点的甲基化状态。 本产品允许实验室创建高通量、可定制的24或48样本BeadChip,在人类及指定非人类样本中高效、准确地检测多达100,000个CpG位点的甲基化状态。
起始量 250 ng DNA 250 ng
系统 iScan iScan
方法 甲基化 芯片 甲基化 芯片
核酸类型 DNA DNA
标志物数量 可额外增加 500-100,000 个用户自定义的 CpG 位点。 可额外增加 500-100,000 个用户自定义的 CpG 位点。
样本数量 每张芯片24个样本 提供 48 样本和 24 样本 BeadChip 两种规格
样本通量 每周最多可处理 5760 个样本(在 8 小时工作日内,配备 2 台 iScan 系统、1 台 AutoLoader 2x 和 2 台 Tecan 工作站)。 16,128(48 样本 BeadChip 每周)
特殊的样本类型 血液, 游离DNA, 唾液 血液
物种 小鼠, 人 牛, 小鼠, 狗, 人, 马, Feline
物种详情 仅限在 DesignStudio 上提供的非人类物种。 仅限在 DesignStudio 上提供的非人类物种。
技术 Illumina芯片 Illumina芯片
变异类别 差异甲基化胞嘧啶

选择工具

图表

Infinium I和II检测可更广泛地覆盖CpG位点

Illumina甲基化BeadChip采用Infinium I和Infinium II检测,提高了整体覆盖度。(A) Infinium I探针设计使用每个CpG位点2种微珠类型,甲基化和非甲基化状态各1种。(B) Infinium II探针设计在两种状态下均使用1种微珠类型。

设计和制造过程

研究人员与Illumina技术设计和客户服务团队合作,完善BeadChip标记内容,协调订购和生产过程。

  1. Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI等。系统性评估用于高通量全基因组亚硫酸氢盐测序的文库制备方法和测序平台。 Sci Rep. 2019;9(1):10383. 发表于2019年7月17日。doi:10.1038/s41598-019- 46875-5

定制HTS试剂盒 (1)

Infinium Methyl Custom-24 Kit (48 Spl)

20042146

Infinium HTS iSelect Methyl Custom Beadchip,48个样本

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定制

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定制EX试剂盒 (5)

Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (48 Spl)

20139002

该试剂盒包含1张定制化的BeadChip芯片以及用于通过Infinium EX甲基化工作流程处理48个样本的试剂。

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定制

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Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (96 Spl).

20139003

该试剂盒包含2张定制化的BeadChip芯片以及用于通过Infinium EX甲基化工作流程处理96个样本的试剂。

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定制

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Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (1152 Spl).

20139004

该试剂盒包含24张定制化的BeadChip芯片以及用于通过Infinium EX甲基化工作流程处理1152个样本的试剂。

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定制

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Inf Methyl EX iSelect-24 Kit (48 Spl).

20139005

该试剂盒包含2张定制化的BeadChip芯片以及用于通过Infinium EX甲基化工作流程处理48个样本的试剂。

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定制

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Inf Methyl EX iSelect-24 Kit (96 Spl).

20139006

该试剂盒包含4张定制化的BeadChip芯片以及用于通过Infinium EX甲基化工作流程处理96个样本的试剂。

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服务 (1)

Infinium® Assay: 客户现场实践培训

20015273

在客户现场提供为期三天的实践指导,帮助用户熟悉Infinium实验方案的基本步骤。本课程提供了有关样本和BeadChip制备、使用iScan系统进行样本扫描以及使用芯片分析软件进行原始数据评估和分析的实践培训。

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选择汇总

产品

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常见问题解答

 Infinium HTS iSelect Custom BeadChip包含甲基化EPIC BeadChip上可用的标准SNP质控品。

GenomeStudio Methylation Module可提取β值,并为Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip数据提供样本簇生成分析。目前不支持BeadArray Controls Reporter软件工具。

值得注意的是, Bioconductor 中有许多免费软件应用程序,例如SeSAMe,它们提供了增强的归一化和可视化选项。Illumina不直接支持这些免费软件解决方案。

不可以,Illumina LIMS目前不支持Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip。

不可以,目前不支持FFPE样本。

支持手动和自动化格式的Zymo Research EZ-96 Methylation-Lightning MagPrep Kit用于Infinium Methylation检测的上游。查看本 技术说明 中的结果,了解更多详细信息。 

/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v3试剂盒

与早期版本相比,经过优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500 v2

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的关键生物标志物(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌种panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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