罕见变异的分析和解读

助力罕见病研究的全方位变异分析与解读

赋能实验室高效拓展的遗传病检测流程优化方案

遗传变异高效分析方案

当前用于分析罕见遗传变异及其他胚系变异的工具较为分散,通常需要整合多个分析流程,并分别进行维护管理。这种碎片化的架构制约了实验室服务的有效扩展。

如今,高通量实验室需直观便捷的工具,实现变异检测、信息挖掘、解读辅助及报告生成的一体化无缝衔接。Illumina提供整合型解决方案,让上述功能触手可及,助力实验室高效运营。

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罕见变异分析,化繁为简

全面变异检测与解读,助您快速获取关键信息。

简化罕见变异分析与解读研究

通过一体化工作流,在单一软件界面中完成变异检测、优先级排序及报告生成。Emedgene软件与DRAGEN二级分析无缝整合,集上述功能于一体。该方案适用于采用全基因组、全外显子组及靶向或虚拟panel测序的中高通量实验室,用于变异评估及遗传病相关信息的挖掘。

了解更多:

  • DRAGEN二级分析——提供全面、准确、高效的变异检测支持
  • Emedgene 软件 与DRAGEN二级分析深度整合,通过研究报告生成助力变异解读流程优化
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DRAGEN 准确性图表

PrecisionFDA v2真相挑战基准数据中,与所有参与方案相比,DRAGEN在所有基准区域中F1分数表现优异。

准确全面的变异检测

DRAGEN二级分析提供高精度的罕见变异检测与分析,实现自动化处理与快速交付。依托DRAGEN多基因组(图)参考序列及机器学习技术,该方案可准确、全面、高效地识别关键变异类型及功能,包括:

  • 小片段变异
  • 拷贝数变异
  • 结构变异
  • 线粒体变异
  • 重复序列扩增
  • 纯合子运行区段
  • 旁系同源基因(如SMN1/SMN2)
  • 具有临床研究挑战性的相关基因
  • 多种药物基因组基因
  • 性染色体低等位基因频率变异
  • 单倍体物种及性染色体基因型推断

通过同时分析与可视化多种变异类型,可轻松查看跨变异类别的复合杂合性。DRAGEN v4.2功能现已上线Emedgene平台,实现罕见变异分析与解读的一体化。

罕见变异分析与解读技术进展

简化的三级分析流程

Emedgene由遗传学专家设计,旨在优化数据解读流程,减轻变异筛选工作负担。该平台采用自动化可解释人工智能(XAI)驱动的基因组分析技术,可将高通量解读效率提升2-5倍,单个临床研究对象的总工作流程时间缩短50-75%。

可解释人工智能(XAI)与自动化

Emedgene的XAI技术能够对推定致病变异进行优先级排序,并提供透明化的证据支持,从而提升工作效率与结果可信度。在与Baylor Genetics的合作研究中,Emedgene的XAI在相关发现优先级排序方面准确率达97%(三人核心家系为98%)。凭借高准确性与高透明度,XAI可针对通常需要数小时人工研究的复杂数据集,自动推荐需进一步审核的变异。

 

"Emedgene的机器学习技术简化了变异分析这一高度复杂的任务,使我们每天能够处理更多的检测样本。"

Ray Louie 博士
助理主任,Greenwood遗传中心

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一体化罕见变异分析流程

通过与DRAGEN二级分析方案、Illumina Connected Analytics数据存储平台及电子健康记录(EHR)平台等系统集成,Emedgene提供从测序到研究报告生成及后续环节的无缝安全解决方案。

查看Emedgene数据手册

赋能业务拓展

Emedgene可扩展支持全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)、靶向panel及虚拟panel的变异解读,涵盖多种应用场景及变异类型:单核苷酸变异(SNV)、插入缺失(indel)、拷贝数变异(CNV)、线粒体DNA变异(mtDNA)、结构变异(SV)和短串联重复序列(STR)。

阅读文献

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