基因表达分析
通过基因表达分析揭示细胞活性机制
什么是基因表达分析？
基因表达分析是指对基因组编码区的转录基因表达进行分析。该方法通过分析mRNA、鉴定编码转录组中已知和新型亚型、检测基因融合以及测量等位基因特异性表达，可以灵敏、准确地定量基因表达水平。
新一代测序（NGS）等先进技术彻底改变了单次实验中基因表达水平分析的规模、速度和准确性。将基于NGS的RNA测序方法（RNA-Seq）与其他常见的基因表达图谱分析方法（例如基因表达芯片和qRT-PCR）进行比较，了解如何使用RNA-Seq分析基因表达并鉴定新的转录本。
常见基因表达分析方法
根据不同的研究目的，您可以使用多种方法来分析选定靶点的基因表达和/或分析编码转录组。了解几种主要的基因表达和转录组分析方法的优势和注意事项。
| 方法 | 优势 | 注意事项 |
|---|---|---|
RNA-Seq了解更多: |
可以在一次检测中检测已知和新型特征。动态范围更宽。适用于任何物种。可扩展且经济高效，适用于高通量应用。 |
对少量靶标（例如少于10个靶标）进行测序可能非常耗时。 |
基因表达芯片了解更多: |
样本通量高，可用于分析已知的基因和转录本广为科学家所知的工作流程。 |
无法检测新型转录本。基因表达测量的局限在于背景噪音（下限）和信号饱和（上限）1。 |
qRT-PCR了解更多: |
对于低靶标数量（例如，少于10个靶标）有效。采用大多数实验室已有的设备，实现快速、简单的工作流程。 |
只能检测已知序列。可扩展性低。 |
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参考文献
- Zhao S, Fung-Leung WP, Bittner A, and Ngo K, Liu X. Comparison of RNA-Seq and microarray in transcriptome profiling of activated T cells. PLoS One. 2014;16;9(1):e78644.