医疗相关感染监测

Genomics for healthcare-associated infection surveillance

用于医疗相关感染监测的基因组学

医疗相关感染(HAI)是指发生在医疗环境中的感染,据估计,在急诊医院中,高收入国家约有7%的患者、中低收入国家约有15%的患者受到HAI的影响。这些感染通常是由耐多药生物引起的,可导致较高的发病率和死亡率、医疗成本增加和监管不合规。HAI监测是感染预防和控制计划的核心组成部分,有助于确定疫情爆发和传播途径,指导预防和控制感染的措施,并提供有关特定病原体的传播和分布以及耐药性模式的宝贵数据1

作为这些监测工作的一部分,基因组学正不断揭示病原体基因组成的关键信息,并能更精确地识别和追踪疫情爆发与传播途径。在新一代测序(NGS)技术的支持下,实验室和诊所可以利用大规模并行工作流程,以更快的速度和更高的可扩展性开展与HAI相关的基因组研究。

NGS在医疗相关感染监测中的应用

DNA测序是一种功能强大的工具,可用于识别导致HAI的特定微生物并确定其基因组成特征,包括是否存在对抗菌药物产生耐药性的基因。这些信息可用于追踪医疗机构内的感染传播情况,并采取有针对性的感染控制措施,防止进一步传播。

icon antibiotic resistant genes in hospital wastewater
医院废水中的抗菌药物耐药性基因

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icon tracking resistant strains
追踪耐药菌株

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icon wgs surveillance for outbreak detection
利用全基因组测序(WGS)监测加强疫情检测

在这份有可能改变研究领域格局的报告中,您将了解全基因组测序监测与电子健康记录(EHR)机器学习相结合,如何识别未被发现的疫情和传播途径。

bacterial genome sequencing
通过细菌基因组测序加强医疗相关感染监测

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bacterial genome sequencing
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参考文献
  1. World Health Organization. Global report on infection and prevention control. who.int/publications/i/item/9789240051164. Published 2022.