传染性疾病的新一代测序

基因组学正在改变现代传染性疾病的监测，加强我们对病原体进化、宿主-病原体相互作用和抗生素耐药性的了解。反过来，公共卫生专业人员也在改变他们用于研究、监测和预防传染病和流行病的方法，这些疾病包括流感、结核病、埃博拉疫情以及最近的新冠疫情。

评估传染原的传统方法包括基于抗体的检测、实时定量PCR、脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型。这些方法通常仅对少数特定数量的生物有用，并且数据分析可能受主观影响。相比之下，新一代测序（NGS）提供了一种通用的无假设方法来进行传染性疾病检测，可用于病毒、细菌、真菌或寄生虫，并且无需多次测试。