公共卫生监测是了解人口健康状况和为公共卫生决策提供信息的重要工具。它涉及对健康相关数据的系统收集和分析,可用于确定趋势和模式,评估干预措施的有效性,以及规划和评估公共卫生计划。
公共卫生的中心目标之一是在我们的社区内实现公平。公共卫生监测专注于社区范围内的疾病预防和整体健康,不仅改善了我们的生活质量,为我们的社区节省了资金,还能够帮助儿童茁壮成长,减少人们的身心痛苦。
基因组学可以通过检测和表征新的、新兴的和正在传播的病原体来维护公共卫生和福祉。 通过追踪和监测社区内的病原体传播和疾病传播,我们可以更好地了解病原体特性(传染性和致病性),并绘制变异的进化图。这最终将有助于诊断的发展以及治疗性疫苗和疗法的设计。
新一代测序(NGS)的鉴别能力正在以比以往更快的速度、准确性和信心推动公共卫生监测。了解有关公共卫生工作主题的更多信息以及Illumina提供的各种解决方案。
废水监测可用于社区范围内的新发传染病监测、变异追踪和变异趋势追踪。
NGS检测可以提供有关不同抗结核病药物耐药性的关键监测数据,这对指导结核病控制策略至关重要。
了解高度灵敏的NGS方法,以识别新型冠状病毒突变、追踪传播、研究病毒遗传学等。
医疗相关感染(HAI)是指在医疗环境中发生的感染,通常由耐多药生物引起。这些感染可导致较高的发病率和死亡率、医疗成本增加和监管不合规。
微生物可以通过改变基因组来适应抗菌化合物,从而产生耐药性。进一步了解NGS如何以更高的通量来检测低频变异和基因组重排。
了解NGS如何在及早发现、疫情应对和临床研究领域通过灵敏的检测和高通量能力大幅改善食品安全。
了解如何利用基于NGS的公共卫生监测来支持传染病大流行防范工作的三个关键方面:及早发现、疫情应对和临床研究。
利用NGS获得的基因组信息可通过以下方式及早发现传染病:
应对传染病爆发需要一个广泛的公共卫生专业人员网络。来自NGS的基因组数据可快速表征病原体,以便:
临床研究通过以下方式在识别和表征传染病方面发挥着重要作用:
据估计,多达75%的新型或新出现的传染性疾病具有人畜共患疾病传染源1,2。我们现在知道,人畜共患疾病宿主在病原体传播中起着重要作用。有了NGS,人们能够筛查蝙蝠等宿主动物,从而预测和预防病毒病原体的爆发。
利用基于NGS的方法进行传染性疾病监测可帮助我们了解跨物种传播、人畜共患传染性疾病出现方式、传播和对常见疗法产生耐受性,并使我们能够更好地控制、治疗和预防疾病爆发。
杂交捕获测序可放大至监测人畜共患疾病病原体,而宏基因组学基因组监测支持对多种病原体进行无偏差、无培养的检测和鉴定。宏基因组学还能帮助我们了解微生物组和病原体相互作用之间的关系,这对于控制传染性疾病措施的制定十分重要。
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基因组监测方法
了解两种新的文库制备解决方案如何帮助公共卫生专业人员利用COVIDSeq工作流程中经过验证的化学方法保障我们的安全。观看视频,了解因美纳微生物扩增子文库制备和llumina Microbial Amplicon Prep—Influenza A/B如何帮助建立、扩展和改进全球基因组监测工作。
观看James Wood博士和William Haseltine博士讨论传染病监测的现状、优势和不足。
了解基于NGS的方法如何彻底改变高通量测序以实现监测。
本手册可供下载,其中概述了基因组学如何在公共卫生监测中发挥作用,以及用于各种监测方法的工具。