NextSeq 550基因测序仪规格

高精度测序和芯片扫描

可调谐读长和多种输出配置

NextSeq550

不同读长下每个流动槽的输出a

读长 NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒
1x75 bp N/A 25–30 Gb
2 × 75 bp 16.25–19.5 Gb 50–60 Gb
2 × 150 bp 32.5–39 Gb 100–120 Gb

a. 基于在支持的簇密度(129-165 k/mm²通过过滤的簇)下的Illumina PhiX对照文库。由于样本类型、样本质量和通过过滤的簇的情况不同,实际性能参数可能略有变化。所有NextSeq 550基因测序仪试剂盒都具有双端测序的能力。

对关键应用估计的样本通量

NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒
3个外显子组 1个全人类基因组
12个富集panel 12个外显子组
96个扩增子panel 16个转录组

每个流动槽通过过滤的read

  NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒
单端read ≤ 130M ≤ 400M
双端read ≤ 260 M ≤ 800 M

质量分值a

读长 NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒
1x75 bp N/A 比Q30高>80%的碱基
2 × 75 bp 在2 × 75 bp下,碱基比Q30高>80% 比Q30高>80%的碱基
2 × 150 bp 在2 × 150 bp下,比Q30高>75%的碱基 比Q30高>75%的碱基

a. 质量分值是对碱基检出中错误发生几率的预测。整个运行中>Q30的碱基百分比取平均值。

运行时间

读长 NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒
1x75 bp N/A 11小时
2 × 75 bp 15小时 18小时
2 × 150 bp 26小时 29小时

芯片扫描参数

芯片 每个芯片的扫描时间 扫描时间/样本
Infinium MethylationEPIC BeadChip 40分钟 5分钟
Infinium CytoSNP-850K BeadChip 40分钟 5分钟

仪器规格

NextSeq 550 System specifications
  • 发光二极管(LED)
    波长

    (激光二极管780 nm,IIIb类)
    绿色510-525 nm,红色645-655 nm
  • 尺寸
    W×D×H
    53.3 cm × 63.5 cm × 58.4 cm
    (21.0 英寸 × 25.0 英寸 × 23.0 英寸)
  • 重量
    83 kg(183磅)
  • 毛重
    151.5 千克(334 磅)

关键技术