NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
TruSight One Sequencing Panel基于多个基因组数据库和行业专家的指导，为疾病相关基因提供广泛的内容和高覆盖度。
TruSight One Sequencing Panel
以高分析灵敏度和特异性靶向外显子中疾病相关区域的全面测序研究panel。
6.5小时
分析时间
约2小时
手动操作时间
50 ng DNA
起始量
TruSight One和TruSight One Expanded（富集寡核苷酸）目前可分别与Illumina DNA Prep with Enrichment配合使用。TruSight One的文库制备试剂盒（货号FC-141-1006和FC-141-1007）和TruSight One Expanded（货号FC-141-2007）已停产。
概述
有两种panel选项可用，为临床研究实验室提供了一种管理多种实验分析系列产品的经济的解决方案。
TruSight One Sequencing Panel
该panel提供了12 Mb基因组内容的全面覆盖，包括4800多个与特定临床表型相关的疾病相关基因，使研究人员能够专注于已知与疾病相关的基因。
TruSight One Expanded Sequencing Panel
该panel进一步优化了原有panel，以提高覆盖度。除了原有的4800多个基因外，拓展panel还靶向约1900个额外的基因，总计16.5 Mb的基因组含量。
规格
| 分析时间 | 6.5小时 |
|---|---|
| 内容说明 |
TruSight One：约12 Mb基因组内容（约4800个基因）。 TruSight One Expanded：约16.5 Mb基因组内容（约6700个基因）。 |
| 手动操作时间 | 约2小时 |
| 起始量 | 50 ng DNA |
| 系统 | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000基因测序仪 |
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达96重 |
| 核酸类型 | DNA |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 生殖系变异 |
需要的产品
需要：
购买TruSight One Sequencing Combo捆绑解决方案（支持15个样本，包含1个TruSight One – Enrichment Oligos试剂盒、1个Illumina DNA Prep with Enrichment、（S） Tagmentation 16个样本和5个MiSeq Reagent Kit v3，600个循环）， 或
为各个panel单独购买富集寡核苷酸，为16或96个样本单独购买带有或不带富集的Illumina DNA Prep，以及为您的系统购买测序试剂
无论您选择组合包解决方案还是单独购买富集和文库制备，IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes（A–D）都需要单独购买。
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结果
应用
TruSight One Sequencing Panel提供了广泛的内容，并高度覆盖了疾病相关靶区，使实验室能够扩展现有菜单，简化工作流程，并用单次检测代替反复检测。
工作流程示例
制备
TruSight One Sequencing Panel
分析
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiSeq System | TruSight One: 3 samples per run with v3 reagents |
长达2 × 150 bp |
| NextSeq 550 System | TruSight One (samples per run): mid output: 12, high output: 36 TruSight One Expanded: 24 samples per run (high output) |
高达2 × 150 bp 高达2 × 150 bp |
| NextSeq 2000 System | TruSight One: 96 samples per run (P3 flow cell) TruSight One Expanded: 66 samples per run (P3 flow cell) |
高达2 × 150 bp 长达2 × 150 bp |
| NovaSeq 6000 System | TruSight One Expanded: 96 samples per run (S1 flow cell) |
长达2 × 150 bp |
建议的样本数量基于目标内容的平均覆盖度为100倍。
相关应用和方法
其他人如何使用该产品
文档
产品资料
比较
| TruSight One Sequencing Panel | Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | ||||
|---|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | 6.5小时 | 6.5小时 | |||
| 内容说明 |
TruSight One：约12 Mb基因组内容（约4800个基因）。 TruSight One Expanded：约16.5 Mb基因组内容（约6700个基因）。 |
37.5 Mb编码内容（≥99%的RefSeq、CCDS、ClinVar和ACMG致病/可能致病变异，COSMIC癌症基因普查内容），OMIM | |||
| 手动操作时间 | 约2小时 | 约2小时 | |||
| 起始量 | 50 ng DNA | 50-1,000 ng高质量基因组DNA（如果直接使用血液和唾液样本，请参阅参考指南） | |||
| 系统 | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer, NovaSeq 6000基因测序仪 | NextSeq 550 Desktop Sequencer, NextSeq 2000基因测序仪, NextSeq 1000系统, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NovaSeq X基因测序仪, NovaSeq 6000基因测序仪, NovaSeq X Plus基因测序仪 | |||
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 外显子组测序, 靶向富集 | |||
| 多重分析 | 多达96重 | 对多达12重预富集文库混合池进行测试。试剂盒配置支持多达192个样本的多重分析。最多支持384个样本。 | |||
| 核酸类型 | DNA | DNA | |||
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE | 血液, 唾液 | |||
| 物种 | 人 | 人 | |||
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | |||
| 变异类别 | 单核苷酸多态性（SNP）, 生殖系变异 | 单核苷酸多态性（SNP）, 杂合性缺失（LOH）, 体细胞变异, 生殖系变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） |
选择工具：
寻找符合您需求的测序文库制备试剂盒或芯片。按方法、种类等筛选。比较、分享和订购试剂盒。
图
TruSight One Sequencing Panels全球基因内容贡献者
TruSight One panel专注于具有已知疾病相关变异的基因组外显子区域。结合来自多个公共来源的数据可确保panel覆盖临床研究环境中当前审查的所有基因。
TruSight One和Illumina酶切法片段化化学技术
TruSight One富集寡核苷酸与Illumina磁珠上酶切法片段化化学技术配合使用，提供了一种快速、简单的靶向基因富集方法。该工作流程结合了文库制备和目标富集步骤，可在1.5小时内完成。
相关资源
捆绑式解决方案 (1)
TruSight One Sequencing Combo (15 Samples)
20042621
足够用于15个样本，包括TruSight One – Enrichment Oligos（货号20029227）、Illumina DNA Prep with Enrichment、（S） Tagmentation（16个样本）（货号20025523）和5个MiSeq Reagent Kit v3（600个循环）（货号 MS-102-3003）。单独购买IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes。
富集panel (2)
TruSight One – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)
20029227
与Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation搭配使用时，足以进行六次富集反应。单独购买文库制备试剂、富集试剂和标签接头。
TruSight One Expanded – Enrichment Oligos only (6 Enrichment Reactions)
20029226
与Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation搭配使用时，足以进行六次富集反应。单独购买文库制备和富集试剂以及标签接头。
文库制备 (4)
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025523
包含用于制备和富集16个文库的试剂（16，1重富集反应）。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025519
包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂（Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation（16样本））一起订购。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025520
包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂（Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation（96样本））一起订购。
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025524
包括用于制备和富集96个文库的试剂（8次12重富集反应）。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
标签接头 (6)
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D， Tagmentation（96个标签，96个样本）包括96个10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
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常见问题解答
Illumina建议使用基于荧光的方法，该方法特异于双链DNA，例如QuantiFluor或PicoGreen。有关详细信息，请参阅TruSight One Library Prep Guide中的输入建议。
Illumina建议在酶切法片段化和富集清洗步骤中使用微加热系统。如果微加热系统不可用，您可以使用扩增仪。按照说明使用96孔硬壳板设置酶切法片段化反应。对于富集清洗步骤，大样本量需要对实验方案进行调整，以获得可靠的性能。请参阅TruSight One Sequencing Panel参考指南中的附录A，了解完整详细信息。
TruSight One Sequencing Panel仅靶向编码区域，不包括UTR或启动子区域。
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结果
MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
TruSight Tumor 15
集中的新一代测序（NGS）panel，通过一个简单快速的工作流程评估实体瘤中的15个常见突变基因。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容测序进行优化的靶向定制研究panel。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
MiSeq Reagent Kits v2
与v1试剂盒相比，v2试剂盒可为MiSeq基因测序仪增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
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