蛋白质组学

蛋白质组学使人们能够理解细胞表型与功能，它代表了包括基因组、表观基因组和转录组在内所有其他细胞调控层面的输出。借助蛋白质组学，科学家能够获得关于生物标志物的可行见解，这些见解对于疾病机制和新药靶点开发等重要研究领域至关重要。

蛋白质组学可以为多组学应用增添巨大价值，它通过提供必要见解来验证其他组学数据，从而增进对生物学的理解。此外，蛋白质组学还可以识别生物标记，同时提供突变和蛋白表达变化作为潜在疾病驱动因素的重要数据。借助Illumina Protein Prep等产品，科学家可以利用现有的Illumina NGS测序仪在单个平台上全面研究生物学过程，包括数据分析。

质谱是蛋白质组学分析的重要工具，在特异性和定量分析多种样品类型方面具有优势。此外，该方法可提供关于单点突变和翻译后修饰的定性信息。然而，与基于NGS的蛋白质组学相比，其工作流程劳动强度大，通量低。Illumina Protein Prep具有特定的优势，包括可扩展性和高通量能力，单次运行即可分析96个样本中的9000多种蛋白质。此系统通过全自动工作流程支持发现和筛查研究，其中的结果可以使用质谱金标准方法进行验证和确认。总体而言，在进行生物标记发现研究时，基于NGS的蛋白质组学可以提高总体工作流程效率，同时节省成本。

lllumina Protein Prep使用SomaScan检测将蛋白质表位转化为基于特定SOMAmer Reagent的DNA信号。接下来，一系列磁珠捕获和清洗步骤会将相对蛋白浓度转化为SOMAmer Reagent丰度。然后，SOMAmer Reagents通过基于杂交的方法转化为用于条形码测序的文库。在捕获到磁珠上之前，成对的探针会先与SOMAmer Reagents进行杂交。每种SOMAmer试剂都有一对特有的探针，其中一个带有与特定SOMAmer试剂相对应的条码。洗去未结合的探针，将其转化为带有条码的探针的丰度。将标签PCR引物添加到用于测序的样本标签中，并进行扩增，以创建单标签条码文库。对这些带标签序列的条码文库进行测序，该分析的输出结果是样本中蛋白质丰度的相对定量测量。整个Illumina Protein Prep检测可在一个平台上实现自动化，即因美纳蛋白质制备建库自动化工作站。下载数据表，了解更多信息。

Illumina Protein Prep可兼容NovaSeq 6000, NovaSeq X和NovaSeq™ X Plus测序仪。