仪器

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN基因测序仪规格

可靠且成熟的桌面式测序

可扩展的产出，高效的运行时间以及高数据质量

NextSeq 2000 in lab setting

每个流动槽的测序输出a

采用XLEAP-SBS化学技术的NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

流动槽类型 P1b P2b P3b，c P4c
1×50 bp       90 Gb
2 × 50 bp 10 Gb 40 Gb 120 Gb 180 Gb
2×100 bp   80 Gb 240 Gb 360 Gb
2 × 150 bp 30 Gb 120 Gb 360 Gb 540 Gb
2 × 300 bp 60 Gb 240 Gb    

a. 输出规格基于支持的簇密度下的Illumina PhiX对照文库。
b. 点击查看标准SBS技术参数。
c. P3和P4试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。

有效期

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN基因测序仪

名称 储存温度 P1, P2, P3保质期a P4保质期b
卡盒 -25°C至-15°C 6个月 3个月
流动槽 2°C至8°C 6个月 3个月
RSB with Tween 20c 2°C至8°C 6个月 6个月

a. 在室温下运输。

每个流动槽通过过滤的read

采用XLEAP-SBS化学技术的NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

流动槽类型 P1a P2a P3a，b P4b
单端read 100 M 400M c 1.2B 1.8B
双端read 200M 800M d 2.4B 3.6B

a.  点击查看标准SBS技术参数。
b. P3和P4试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。

质量分值和运行时间

采用XLEAP-SBS化学技术的NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

流动槽类型 P1 a P2 a P3 a，b P4 b
质量分值c  
1×50 bp ≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 50 bp ≥ 90%的碱基分值高于Q30
2×100 bp ≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 150 bp ≥ 90%的碱基分值高于Q30
2 × 300 bp ≥ 85%的碱基分值高于Q30
运行时间  
1×50 bp       12小时
2 × 50 bp 8小时 12小时 18小时 20小时
2×100 bp   19小时 31小时 34小时
2 × 150 bp 17小时 22小时 40小时 44小时
2 × 300 bp 34小时 42小时    

a.  点击查看标准SBS技术参数。
b. P3和P4试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
c. 质量分值的计算基于Illumina PhiX对照文库；根据文库类型和质量、插入片段大小、上样浓度及其他实验因素的不同，性能可能有所差异。
d. 运行时间包括NextSeq 1000/1000-CN或NextSeq 2000/2000-CN系统上的簇生成、测序和碱基检出。

对关键应用估计的样本通量a

采用XLEAP-SBS化学技术的NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN

应用 P1b P2b P3b，c P4c
  样本数量 样本数量 样本数量 样本数量

小型全基因组测序（300个循环）

130 Mb基因组，30倍覆盖度

 7 30 92 138

全外显子组测序（200个循环）

每个外显子组约8 Gb，平均覆盖度90倍

 约2天 10 30 45

总RNA-Seq（200个循环）d

每个样本50M read对

 2天 8 24 36

mRNA-Seq（200个循环）d

每个样本25M read对

 4天 16 48 72

单细胞RNA-Seq（100个循环）e

5K细胞，每个细胞20K read

 1e 4 12 48

miRNA-Seq或小RNA分析（50个循环）

每个样本11M read

 9f 36f 108f 163
16S RNA测序（600个循环） 384g 384g N/A

a. 表中数值代表每次运行的预计样本数。建议的测序深度在很大程度上取决于样本类型和实验目标，需要针对每项研究进行优化。
b.  点击查看标准SBS技术参数。
c. P3和P4试剂仅适用于NextSeq 2000/2000-CN系统。
d. 使用P1 300循环数试剂盒。
e. P1试剂适用于单细胞质量控制实验。
f. 使用100循环数试剂盒。
g. Illumina最多提供384个唯一双标签序列。

仪器参数表

NextSeq 1k / 2k instrument specifications
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  • 仪器配置
    具有集成式DRAGEN Bio-IT FPGA二级分析的独立干燥仪器
  • 仪器控制计算机
    主机：仪器内置的2U微服务器
    内存：288 GB硬盘：3.8 TB SSD
    操作系统：Linux CentOS 7.6
  • 操作环境
    仅供室内使用
    温度：15°C-30°C
    湿度：相对湿度20%-80%，非冷凝
    海拔：0-2000米
  • 激光
    波长
    449 nm、523 nm、820 nm
  • 包装尺寸
    W×D×H
    92 厘米 × 120 厘米 × 118 厘米
    重量：232 千克
  • 尺寸
    W×D×H
    55 cm × 65 cm × 60 cm
    （21.7 英寸 × 25.6 英寸 × 23.6 英寸）
  • 重量
    141 千克（310.9 磅）
  • 板条箱重量
    232 千克（511.5 磅）
  • 电源要求
    仪器输入电压：100 V到240 V交流电
    仪器输入频率：50/60赫兹
  • 网络连接带宽
    内部网络上传速度：200 Mb/s/仪器
    BaseSpace Sequence Hub上传速度：200 Mb/s/仪器
    仪器操作数据上传速度：5 Mb/s/仪器
  • 产品安全与合规
    安全性：1级激光产品
    NRTL认证IEC
    61010-1 CE认证
    FCC/IC批准
查看详细规格表（PDF）

关键技术

XLEAP-SBS化学技术

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN系统由XLEAP-SBS化学技术提供支持，这是一种基于Illumina标准SBS化学技术的更快、更高质量、更可靠的SBS化学技术。* XLEAP-SBS化学技术使用更耐热的先进染料、新型连接键和阻断物，溶液中的水解反应降低了50 倍，阻断物切割的速度提升了2.5 倍，可减少测序过程中的phasing 和pre-phasing 情况的出现。XLEAP-SBS 聚合酶也经过改造，能够以前所未有的速度和保真度结合核苷酸。

无损基因组数据压缩技术

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN基因测序仪可安装并使用无损基因组压缩技术。该技术使用超快速定位方法将reads定位到参考基因组，然后只存储重新生成这些reads所需的数据：一个存储位置既可以生成一个基因组比对差异列表。

阵列式流动槽技术

NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN基因测序仪采用创新的阵列式流动槽技术，为不同的测序应用提供了出色的通量水平。阵列式流动槽包含数十亿个位置固定的纳米井，这种设计甚至为待测序的簇之间提供了间隔距离。大幅增加了reads数以及总输出数据。