NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合，实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
这些预设计的即用型寡核苷酸是与癌症基因组学专家共同开发的，能让研究人员对与癌症易感性相关的各种基因和单核苷酸多态性（SNP）进行测序。
TruSight Cancer
这些专家定义的测序研究panel靶向与多种癌症易感性相关的94个基因和284个SNP。
1.5天
分析时间
5小时
手动操作时间
50 ng DNA
起始量
概述
TruSight Cancer包括与常见（如乳腺癌、直肠癌）和罕见癌症相关的基因。此外，该试剂盒还包括通过全基因组关联研究（GWAS）发现的与癌症相关的284个SNP。其内容根据业内专家对科学文献及其他高质量资源的筛选整理而选定。
TruSight Cancer测序panel提供靶向经过鉴定的目标区域的定制寡核苷酸。提供了足以进行四次富集反应的产品。TruSight Cancer与 TruSight Rapid Capture兼容。
TruSight Cancer样本数据集
使用TruSight Cancer测序panel制备了6个人类参考样本。将这些文库在MiniSeq系统上以2x100 bp读长、带双端标签的配置，使用高通量试剂盒进行测序。总产量为5.2 Gb，95.8%的碱基处于或高于Q30。
该产品是Illumina Advantage（TG）产品。Illumina Advantage大规模测序产品分批配送和测试，其保质期更长，且如有变动会预先通知，提高实验室的效率。
规格
| 分析时间 | 1.5天 |
|---|---|
| 癌症类型 | 泛癌种 |
| 内容说明 | 固定的探针集富集了与常见和罕见癌症相关的94个基因和284个SNP。 |
| 说明 | 常见和罕见癌症的生殖系突变检测研究。 |
| 手动操作时间 | 5小时 |
| 起始量 | 50 ng DNA |
| 系统 | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer |
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| 多重分析 | 多达96重 |
| 核酸类型 | DNA |
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE, 不兼容FFPE |
| 物种 | 人 |
| 技术 | Illumina测序 |
| 变异类别 | 生殖系变异 |
需要的产品
所需配件
您还需要以下一种或多种富集产品。
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结果
应用
工作流程示例
项目建议
| 仪器 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| MiniSeq System | Samples per run: mid output: 12, high output: 24 (based on > 20x coverage per target) |
长达2 × 150 bp |
| MiSeq System | Samples per run (by reagent kit version): v2: 12, v3: 24 (based on > 20x coverage per target) |
长达2 × 150 bp |
| NextSeq 550 System | Samples per run: mid output: 96, high output: 96 (based on > 20x coverage per target) |
长达2 × 150 bp |
相关应用和方法
利用新一代测序和芯片技术，鉴定在个体中导致癌症的生殖系突变。
通过定向重测序，可以将一个基因子集或基因组区域分离出来并进行测序，从而节省实验室资源。
我们的临床癌症研究解决方案能提供准确的基因组信息，让实验室能够在单次检测中分析多个基因。
其他人如何使用该产品
MGZ医学遗传中心的研究人员采用Infinium CytoSNP-850K BeadChip芯片和TruSight Cancer Panel分析染色体异常。
比较
| TruSight Cancer | TruSight Hereditary Cancer Panel | AmpliSeq for Illumina BRCA Panel | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 分析时间 | 1.5天 | 从DNA到数据约48小时 | 5小时（仅文库制备；不包括文库定量、归一化或混合时间） | ||
| 癌症类型 | 泛癌种 | 泛癌种, 实体瘤 | 实体瘤 | ||
| 内容说明 | 固定的探针集富集了与常见和罕见癌症相关的94个基因和284个SNP。 | 靶向113种癌症风险相关基因 | BRCA1和 BRCA2的外显子区域和侧翼内含子序列 | ||
| 说明 | 常见和罕见癌症的生殖系突变检测研究。 | TruSight Hereditary Cancer Panel是一种靶向测序panel，旨在评估113个基因和125个单核苷酸多态性（SNP）的生殖系突变，用于鉴定和多基因风险评分。 | BRCA BRCA1 BRCA2的生殖系和体细胞分析研究。 | ||
| 手动操作时间 | 5小时 | 约2小时 | <1.5小时 | ||
| 起始量 | 50 ng DNA | 50–1000 ng DNA | 1–100 ng（建议每个混池10 ng） | ||
| 系统 | MiSeq Desktop Sequencer, NextSeq 550 Desktop Sequencer, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq System, NextSeq 500 Desktop Sequencer | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100系统, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiniSeq System, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NextSeq 500 Desktop Sequencer | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100系统, 研究模式下的MiSeqDx, MiniSeq System | ||
| 方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 靶向富集 | 靶向DNA测序, 扩增子测序 | ||
| 多重分析 | 多达96重 | 96个双标签序列组合 | |||
| 核酸类型 | DNA | DNA | DNA | ||
| 特殊的样本类型 | 不兼容FFPE, 不兼容FFPE | 血液, 唾液 | 血液, FFPE组织 | ||
| 物种 | 人 | 人 | 人 | ||
| 技术 | Illumina测序 | Illumina测序 | Illumina测序 | ||
| 变异类别 | 生殖系变异 | 生殖系变异, 插入缺失（indel）, 拷贝数变异（CNV） | 单核苷酸多态性（SNP）, 体细胞变异, 生殖系变异, 插入缺失（indel） |
富集panel (12)
TruSight Cancer – Enrichment Oligos only (4 or 8 Enrichment Reactions)
FC-121-0202
TruSight Cancer能靶向与多种癌症易感性相关的94个基因和284个SNP，与Nextera Flex for Enrichment联合使用时，为单一杂交的工作流程，足够进行8次富集反应，与TruSight Rapid Capture联合使用时足够进行4次富集反应。文库制备、富集和标签接头试剂需单独订购。
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025524
包括用于制备和富集96个文库的试剂（8次12重富集反应）。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025523
包含用于制备和富集16个文库的试剂（16，1重富集反应）。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025520
包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂（Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation（96样本））一起订购。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025519
包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂（Illumina DNA Prep with Enrichment， （S） Tagmentation（16样本））一起订购。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
包含96、10 bp标签，足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
TruSight Rapid Capture (1 index, 8 samples, 8 enrichments)
FC-140-1101
含进行八次1重富集、制备8个文库所需的试剂。包含1个唯一标签组合。
TruSight Rapid Capture (2 indexes, 8 samples, 4 enrichments)
FC-140-1102
含进行四次2重富集、制备8个文库所需的试剂。包含2个唯一标签组合。
TruSight Rapid Capture (4 indexes, 16 samples, 4 enrichments)
FC-140-1103
包含通过四重4重富集制备多达16个文库的试剂。包含4种唯一标签组合。
TruSight Rapid Capture (24 indexes, 48 samples, 4 enrichments)
FC-140-1104
包含通过4次12重富集制备多达48个文库的试剂。包含24个唯一标签组合。
TruSight Rapid Capture (24 indexes, 96 samples, 8 enrichments)
FC-140-1105
包含通过8次12重富集制备多达96个文库的试剂。包含24个唯一标签组合。
TruSight Rapid Capture (96 indexes, 288 samples, 24 enrichments)
FC-140-1106
含进行二十四次12重富集、制备288个文库所需的试剂。包含96个唯一标签组合。
Illumina Advantage产品 (1)
TG TruSight™ Cancer Sequencing Panel
TG-141-1002
包含用于癌基因的寡核苷酸；主要适用于癌症易感性和相关疾病的关联基因。所含的试剂量可供4次富集反应使用。
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MiSeq Reagent Kit v3
与早期版本相比，优化的试剂盒可增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
TruSight Oncology 500
使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征（TMB、MSI和HRD）的大型泛癌panel实现CGP。
Illumina DNA Prep
快速、集成的文库制备工作流程，适用于各种测序应用。
TruSight Tumor 15
集中的新一代测序（NGS）panel，通过一个简单快速的工作流程评估实体瘤中的15个常见突变基因。
AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel
专为特异性靶点或感兴趣的基因组内容测序进行优化的靶向定制研究panel。
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
提供90分钟的工作流程，以较低的DNA起始量要求制备用于小型基因组、PCR扩增子、质粒和cDNA测序的DNA文库。
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
高性能、快速、可靠的人类全外显子组测序解决方案，包括全面、最新的外显子组富集panel。
NextSeq 1000/1000-CN和NextSeq 2000/2000-CN试剂
用于NextSeq 1000/2000系列基因测序仪的试剂，具有简便易用的卡盒和多种流动槽配置，可提供灵活的测序选项。
MiSeq Reagent Kits v2
与v1试剂盒相比，v2试剂盒可为MiSeq基因测序仪增加簇密度和读长，从而提高测序质量分值。
关于针对产品特定用途的生物标记专利及其他专利的说明：
某些基因组变异，包括某些核酸序列，当它们用于特定应用时可能得到专利保护。建议客户确定是否需要从拥有此类专利的第三方获得相应许可，以便在其特定应用中使用本产品。
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