NovaSeq X系列
将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。
评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。
分析时间
手动操作时间
起始量
TruSight Hereditary Cancer Panel为评估生殖系突变提供了专家定义的内容。
该panel是根据关键意见领袖的意见开发的,包括10,341个探针,涵盖113个基因和125个SNP。
该panel配合Illumina DNA Prep with Enrichment文库制备工作流程使用,该工作流程利用了基于酶的DNA片段化,降低了仪器成本和机械片段化的需求。Illumina DNA Prep with Enrichment已通过多个自动化系统的认证,可实现用户友好的工作流程。
标签可用于多达384个样本,可在Illumina台式测序系统中实现灵活的批量大小和可扩展性。
分析时间 | 从DNA到数据约48小时 |
---|---|
自动化功能 | 液体处理机器人 |
癌症类型 | 泛癌种, 实体瘤 |
内容说明 | 靶向113种癌症风险相关基因 |
说明 | TruSight Hereditary Cancer Panel是一种靶向测序panel,旨在评估113个基因和125个单核苷酸多态性(SNP)的生殖系突变,用于鉴定和多基因风险评分。 |
手动操作时间 | 约2小时 |
起始量 | 50–1000 ng DNA |
系统 | MiSeq Desktop Sequencer, iSeq 100系统, NextSeq 550 Desktop Sequencer, MiniSeq System, 研究模式下的NextSeq 550Dx, NextSeq 500 Desktop Sequencer |
方法 | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
核酸类型 | DNA |
样本类型详情 | 基因组DNA |
特殊的样本类型 | 血液, 唾液 |
物种 | 人 |
技术 | Illumina测序 |
变异类别 | 生殖系变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) |
TruSight Hereditary Cancer Panel工作流程需要TruSight Hereditary Cancer富集寡核苷酸、Illumina DNA Prep with Enrichment、Illumina DNA/RNA UD标签和测序试剂。
TruSight Hereditary Cancer Panel是一款高效的靶向新一代测序(NGS)panel,能让研究人员访问专家定义的内容集,用于分析之前与癌症易感性相关的基因中的变异。
TruSight遗传性癌症——富集寡核苷酸
Illumina DNA Prep with Enrichment
Illumina DNA/RNA UD标签
仪器 | Recommended number of samples | Read length |
---|---|---|
iSeq 100 System | Samples per run: 2 (based on 300× mean coverage) |
2 × 150 bp(建议最大) |
MiniSeq System | Samples per run: mid-output: 5, high-output: 16 (based on 300× mean coverage) |
2 × 150 bp(建议最大) |
MiSeq System | Samples per run: v2 Micro: 2, v2 Standard: 9, v3 Standard: 16 (based on 300× mean coverage) |
2 × 150 bp(建议最大) |
NextSeq 500 System | Samples per run: mid-output: 80, high-output: 256 (based on 300× mean coverage) |
2 × 150 bp(建议最大) |
NextSeq 550 System | Samples per run: mid-output: 80, high-output: 256 (based on 300× mean coverage) |
2 × 150 bp(建议最大) |
包括10,341个探针,靶向113个与癌症易感性相关的基因,在关键指南中推荐,并在病例与对照的群体研究中进行评估。
TruSight Hereditary Cancer Panel包含大量通常与乳腺癌、结肠癌、卵巢癌和胃癌的遗传易感性相关的基因,并在关键指南中推荐。
TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)
20029551
TruSight Hereditary Cancer——仅含富集寡核苷酸(8次富集反应)
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025524
包括用于制备和富集96个文库的试剂(8次12重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025523
包含用于制备和富集16个文库的试剂(16,1重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)
20025520
包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(96样本))一起订购。
Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)
20025519
包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(16样本))一起订购。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027213
包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。
IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20027214
包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。
iSeq 100 i1 Reagent v2 (300循环)
20031371
包含一个i1流动槽和一个预装试剂夹盒,内含簇生成试剂和测序试剂,支持在iSeq 100系统上进行300个循环的运行。
iSeq 100 i1 Reagent v2 (300循环) 4个
20031374
包含四个i1流动槽和四个预装卡盒,内含簇生成试剂和测序试剂,支持在iSeq 100系统上进行4×300个循环的运行。
iSeq 100 i1 Reagent v2 (300循环) 8个
20040760
包含八个i1流动槽和八个预装卡盒,其中包含簇生成试剂和测序试剂,支持在iSeq 100系统上进行8×300个循环的运行。
MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300-cycles)
MS-103-1002
提供配套试剂,用于在MiSeq系统上使用MiSeq Micro流动槽进行多达325个测序循环(最多4M簇PF)。包括:双端试剂板(300个循环)、MiSeq Micro流动槽和清洗缓冲液。
MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles)
MS-102-2002
MiSeq v2试剂盒,每个试剂盒300个循环。
MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)
MS-102-3003
提供配套试剂,可在MiSeq系统上进行多达625个测序循环。包括:双端试剂板(600 次循环)、MiSeq 流动槽和清洗缓冲液。
MiniSeq Mid Output Kit (300-cycles)
FC-420-1004
提供用于300个测序循环的配套试剂,以及用于中通量运行(最多8M read)的双端标签。包括:中通量试剂卡盒(300个循环)、流动槽和杂交缓冲液。
MiniSeq High Output Reagent Kit (300-cycles)
FC-420-1003
提供用于300个测序循环的配套试剂,以及在高通量运行(高达25M read)上支持双标签。包括:高通量试剂夹盒(300个循环)、流动槽和杂交缓冲液。
NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (300 Cycles)
20024905
提供用于300个测序循环的配套试剂,以及中通量运行(高达130M条read)的双标签支持。包括:中等输出试剂夹盒(300 次循环)、中等输出流动槽夹盒和缓冲液夹盒。
NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (300 Cycles)
20024908
提供用于300个测序循环的配套试剂,以及高通量运行(高达400M read)的双标签支持。包括:高通量试剂夹盒(300 次循环)、高通量流动槽夹盒和缓冲液夹盒。
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
包含使用Illumina DNA Prep和Illumina DNA Prep with Enrichment处理血液样本的试剂。单独购买文库制备、富集、富集探针panel和标签接头试剂。
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TruSight Hereditary Cancer Panel包含大量通常与乳腺癌、结肠癌、卵巢癌和胃癌的遗传易感性相关的基因。
TruSight Hereditary Cancer Panel可在任何台式Illumina测序系统(iSeq 100、MiSeq、MiniSeq和NextSeq系统)上运行。
TruSight Hereditary Cancer Panel包含125个SNP。其中48个是ID SNP,77个是用于多基因风险评分(PRS)的SNP。
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