TruSight Hereditary Cancer Panel

评估与遗传癌症风险倾向相关的113个基因和125个SNP的生殖系突变的靶向测序panel。

从DNA到数据约48小时

分析时间

约2小时

手动操作时间

50–1000 ng DNA 

起始量

详情请参见规格表

概述

TruSight Hereditary Cancer Panel为评估生殖系突变提供了专家定义的内容。

  • 广泛的panel包括113个与遗传性癌症易感性相关的基因

  • 简单的实验方案可实现快速灵活的文库制备和富集

  • 兼容所有Illumina台式测序系统,每次运行的样本通量范围为2至256个样本

  • 杂交捕获富集可实现良好的覆盖均一性,可准确检测SNV、插入缺失和CNV

专家定义的内容

该panel是根据关键意见领袖的意见开发的,包括10,341个探针,涵盖113个基因和125个SNP。

快速的文库制备和富集工作流程

该panel配合Illumina DNA Prep with Enrichment文库制备工作流程使用,该工作流程利用了基于酶的DNA片段化,降低了仪器成本和机械片段化的需求。Illumina DNA Prep with Enrichment已通过多个自动化系统的认证,可实现用户友好的工作流程。

可扩展

标签可用于多达384个样本,可在Illumina台式测序系统中实现灵活的批量大小和可扩展性。

性能参数

所需产品

TruSight Hereditary Cancer Panel工作流程需要TruSight Hereditary Cancer富集寡核苷酸、Illumina DNA Prep with Enrichment、Illumina DNA/RNA UD标签和测序试剂。

/ 结果

应用

TruSight Hereditary Cancer Panel是一款高效的靶向新一代测序(NGS)panel,能让研究人员访问专家定义的内容集,用于分析之前与癌症易感性相关的基因中的变异。

工作流程示例

1
制备

TruSight遗传性癌症——富集寡核苷酸

Illumina DNA Prep with Enrichment

Illumina DNA/RNA UD标签

项目建议

仪器 Recommended number of samples Read length
iSeq 100 System

Samples per run: 2 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(建议最大)

MiniSeq System

Samples per run: mid-output: 5, high-output: 16 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(建议最大)

MiSeq System

Samples per run: v2 Micro: 2, v2 Standard: 9, v3 Standard: 16 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(建议最大)

NextSeq 500 System

Samples per run: mid-output: 80, high-output: 256 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(建议最大)

NextSeq 550 System

Samples per run: mid-output: 80, high-output: 256 (based on 300× mean coverage)

2 × 150 bp(建议最大)

其他人如何使用该产品

TruSight Hereditary Cancer Panel基因内容

包括10,341个探针,靶向113个与癌症易感性相关的基因,在关键指南中推荐,并在病例与对照的群体研究中进行评估。

与降低风险相关的关键指南中包含的基因

TruSight Hereditary Cancer Panel包含大量通常与乳腺癌、结肠癌、卵巢癌和胃癌的遗传易感性相关的基因,并在关键指南中推荐。 

文库制备 (5)

TruSight Hereditary Cancer – Enrichment Oligos Only (8 Enrichment Reactions)

20029551

TruSight Hereditary Cancer——仅含富集寡核苷酸(8次富集反应)

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025524

包括用于制备和富集96个文库的试剂(8次12重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。

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Illumina® DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025523

包含用于制备和富集16个文库的试剂(16,1重富集反应)。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (96 Samples)

20025520

包含用于制备96个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(96样本))一起订购。

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Illumina® DNA Prep, (S) Tagmentation (16 Samples)

20025519

包含用于制备16个文库的试剂。不包含富集试剂。单独购买富集探针panel、Illumina纯化磁珠和标签接头。富集试剂只能与文库制备试剂(Illumina DNA Prep with Enrichment, (S) Tagmentation(16样本))一起订购。

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标签接头 (6)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation(96个标签,96个样本)包括96个10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备和富集试剂以及探针panel。

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

包含96、10 bp标签,足以标记96个样本。单独购买文库制备试剂、富集试剂和探针panel。

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试剂 (10)

iSeq 100 i1 Reagent v2 (300循环)

20031371

包含一个i1流动槽和一个预装试剂夹盒,内含簇生成试剂和测序试剂,支持在iSeq 100系统上进行300个循环的运行。

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iSeq 100 i1 Reagent v2 (300循环) 4个

20031374

包含四个i1流动槽和四个预装卡盒,内含簇生成试剂和测序试剂,支持在iSeq 100系统上进行4×300个循环的运行。

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iSeq 100 i1 Reagent v2 (300循环) 8个

20040760

包含八个i1流动槽和八个预装卡盒,其中包含簇生成试剂和测序试剂,支持在iSeq 100系统上进行8×300个循环的运行。

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MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300-cycles)

MS-103-1002

提供配套试剂,用于在MiSeq系统上使用MiSeq Micro流动槽进行多达325个测序循环(最多4M簇PF)。包括:双端试剂板(300个循环)、MiSeq Micro流动槽和清洗缓冲液。

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MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles)

MS-102-2002

MiSeq v2试剂盒,每个试剂盒300个循环。

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MiSeq Reagent Kit v3 (600-cycle)

MS-102-3003

提供配套试剂,可在MiSeq系统上进行多达625个测序循环。包括:双端试剂板(600 次循环)、MiSeq 流动槽和清洗缓冲液。

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MiniSeq Mid Output Kit (300-cycles)

FC-420-1004

提供用于300个测序循环的配套试剂,以及用于中通量运行(最多8M read)的双端标签。包括:中通量试剂卡盒(300个循环)、流动槽和杂交缓冲液。

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MiniSeq High Output Reagent Kit (300-cycles)

FC-420-1003

提供用于300个测序循环的配套试剂,以及在高通量运行(高达25M read)上支持双标签。包括:高通量试剂夹盒(300个循环)、流动槽和杂交缓冲液。

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Discounts:

NextSeq 500/550 Mid Output Kit v2.5 (300 Cycles)

20024905

提供用于300个测序循环的配套试剂,以及中通量运行(高达130M条read)的双标签支持。包括:中等输出试剂夹盒(300 次循环)、中等输出流动槽夹盒和缓冲液夹盒。

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NextSeq 500/550 High Output Kit v2.5 (300 Cycles)

20024908

提供用于300个测序循环的配套试剂,以及高通量运行(高达400M read)的双标签支持。包括:高通量试剂夹盒(300 次循环)、高通量流动槽夹盒和缓冲液夹盒。

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配套产品 (1)

Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)

20018706

包含使用Illumina DNA Prep和Illumina DNA Prep with Enrichment处理血液样本的试剂。单独购买文库制备、富集、富集探针panel和标签接头试剂。

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产品

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常见问题解答

TruSight Hereditary Cancer Panel包含大量通常与乳腺癌、结肠癌、卵巢癌和胃癌的遗传易感性相关的基因。

TruSight Hereditary Cancer Panel可在任何台式Illumina测序系统(iSeq 100、MiSeq、MiniSeq和NextSeq系统)上运行。

TruSight Hereditary Cancer Panel包含125个SNP。其中48个是ID SNP,77个是用于多基因风险评分(PRS)的SNP。

/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq Reagent Kit v3

与早期版本相比,优化的试剂盒可增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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