| 读长 | NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 | NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒 |
|---|---|---|
| 1ｘ75 bp | N/A | 25–30 Gb |
| 2 × 75 bp | 16.25–19.5 Gb | 50–60 Gb |
| 2 × 150 bp | 32.5–39 Gb | 100–120 Gb |
NextSeq 550基因测序仪规格
高精度测序和芯片扫描
可调谐读长和多种输出配置
不同读长下每个流动槽的输出a
a. 基于在支持的簇密度（129-165 k/mm²通过过滤的簇）下的Illumina PhiX对照文库。由于样本类型、样本质量和通过过滤的簇的情况不同，实际性能参数可能略有变化。所有NextSeq 550基因测序仪试剂盒都具有双端测序的能力。
对关键应用估计的样本通量
| NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 | NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒 |
|---|---|
| 3个外显子组 | 1个全人类基因组 |
| 12个富集panel | 12个外显子组 |
| 96个扩增子panel | 16个转录组 |
每个流动槽通过过滤的read
| NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 | NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒 | |
|---|---|---|
| 单端read | ≤ 130M | ≤ 400M |
| 双端read | ≤ 260 M | ≤ 800 M |
质量分值a
| 读长 | NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 | NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒 |
|---|---|---|
| 1ｘ75 bp | N/A | 比Q30高＞80%的碱基 |
| 2 × 75 bp | 在2 × 75 bp下，碱基比Q30高＞80% | 比Q30高＞80%的碱基 |
| 2 × 150 bp | 在2 × 150 bp下，比Q30高＞75%的碱基 | 比Q30高＞75%的碱基 |
a. 质量分值是对碱基检出中错误发生几率的预测。整个运行中＞Q30的碱基百分比取平均值。
运行时间
| 读长 | NextSeq 550基因测序仪中输出试剂盒 | NextSeq 550基因测序仪高输出试剂盒 |
|---|---|---|
| 1ｘ75 bp | N/A | 11小时 |
| 2 × 75 bp | 15小时 | 18小时 |
| 2 × 150 bp | 26小时 | 29小时 |
芯片扫描参数
| 芯片 | 每个芯片的扫描时间 | 扫描时间/样本 |
|---|---|---|
| Infinium MethylationEPIC BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
| Infinium CytoSNP-850K BeadChip | 40分钟 | 5分钟 |
仪器规格
-
发光二极管（LED）
波长
（激光二极管780 nm，IIIb类）绿色510-525 nm，红色645-655 nm
-
尺寸
W×D×H53.3 cm × 63.5 cm × 58.4 cm
（21.0 英寸 × 25.0 英寸 × 23.0 英寸） -
重量
83 kg（183磅）
-
毛重
151.5 千克（334 磅）
关键技术
NextSeq 550系统利用成熟的Illumina边合成边测序（SBS）技术，为多种应用提供高度准确的数据和可靠的性能。SBS利用一种可逆终止子方法，荧光标记的核苷酸可在单个碱基掺入不断延伸的DNA链时对其进行检测。
NextSeq 550基因测序仪利用双通道边合成边测序（SBS）化学技术比原始的因美纳四通道SBS技术能够实现更快的数据生成，且具有相同的高数据精度。