什么是读长?
序列读长是指每个测序的DNA片段的长度,以及它是从一端还是两端测序的。例如,2×150 bp运行为每个DNA片段生成两个150个碱基对的read(正向和反向)。与较短的读长相比,首选较长的读长,因为它们在DNA序列中跨越重复的概率更高。
小包装的巨大优势
在简单、紧凑的台式基因测序仪中实现高度准确的数据、快速的运行时间和1.2 Gb的输出
什么是读长?
序列读长是指每个测序的DNA片段的长度,以及它是从一端还是两端测序的。例如,2×150 bp运行为每个DNA片段生成两个150个碱基对的read(正向和反向)。与较短的读长相比,首选较长的读长,因为它们在DNA序列中跨越重复的概率更高。
读长 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
---|---|
1×36 bp | 144 Mb |
1×50 bp | 200 Mb |
1x75 bp | 300 Mb |
2 × 75 bp | 600 Mb |
2 × 150 bp | 1.2 Gb |
a. 规格基于支持簇密度(174–200 k/mm2簇通过过滤)下的Illumina PhiX对照文库。
应用 | iSeq 100 i1 Reagent v2b |
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每次运行的小型基因组测序 5–10 Mb基因组,30×覆盖度,2×150 bp |
1–8 |
每次运行的靶向基因表达图谱分析 多达500个靶标,1 × 50 bp |
1–48 |
每次运行的靶向扩增子测序 多达3000个扩增子,2 × 150 bp |
1–48 |
a. 所有样本通量均为估计值,基于单流动槽运行。
b. 每次使用iSeq 100 i1 Reagent v2运行的样本数。
iSeq 100 i1 Reagent v2 | |
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单端read | 4M |
双端read | 8M |
a. 规格基于支持簇密度(174–200 k/mm2簇通过过滤)下的Illumina PhiX对照文库。
读长 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
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1×36 bp | >85%的碱基高于Q30 |
1×50 bp | >85%的碱基高于Q30 |
1x75 bp | >80%的碱基高于Q30 |
2 × 75 bp | >80%的碱基高于Q30 |
2 × 150 bp | >80%的碱基高于Q30 |
a. 整个运行中>Q30的碱基百分比取平均值。
读长 | iSeq 100 i1 Reagent v2 |
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1×36 bp | 9.5小时 |
1×50 bp | 10小时 |
1x75 bp | 11小时 |
2 × 75 bp | 14小时 |
2 × 150 bp | 19小时 |
a. 总时间包括在iSeq 100基因测序仪上进行簇生成、测序和碱基检出。
iSeq 100仪器规格
iSeq 100基因测序仪利用成熟的因美纳边合成边测序(SBS)化学技术,为广泛的应用提供高度准确的数据和可靠的性能。SBS化学技术使用可逆终止子荧光标记的核苷酸来检测单个碱基,因为它们掺入不断增长的DNA链中,同时读取数十亿个序列。
iSeq 100基因测序仪结合了Illumina SBS化学技术和互补金属氧化物半导体(CMOS)技术,可提供单通道SBS化学技术。CMOS芯片上的单通道SBS化学技术有助于降低仪器成本,减少台式占地面积,同时提供准确的数据。