2025年5月30日
2015年，美国国家癌症研究所（National Cancer Institute，NCI）启动了一项名为“基于分子分析的治疗选择”（Molecular Analysis for Therapy Choice）的临床试验，简称NCI-MATCH，旨在评估一种新的治疗策略：不考虑癌症类型，仅依据患者肿瘤中的基因变异来选择治疗方案，从而判断这种精准治疗方式是否有效。
这项试验历时八年，共筛查了约6,000名转移性癌症患者，是NCI迄今为止支持的规模最大的精准肿瘤学临床试验之一。NCI-MATCH试验由NCI主导，并由其联邦资助的研发中心——弗雷德里克国家癌症研究实验室（Frederick National Laboratory for Cancer Research）提供资金支持和监督管理。
在第二阶段试验中，研究团队设立了38个“治疗组”或称子研究，每个治疗组均将特定的基因变异与一种靶向治疗药物进行匹配。研究人员通过分子检测分析每位参与者的肿瘤活检样本，以判断其肿瘤是否具备这些特定的变异。最终约有1,600名患者符合条件，进入了相应的治疗组。
自2019年起，因美纳与弗雷德里克国家癌症研究实验室的分子鉴定（Molecular Characterization, MoCha）实验室研究人员合作，对曾参与NCI-MATCH筛查的患者所存档的血液样本进行了回顾性研究。在本项目中，研究团队采用了全景变异分析（CGP）方法，这是一种新一代测序技术，可通过单次检测分析数百个基因，包括具有预后或预测价值的癌症生物标志物、在临床试验中具有相关性的标志物，或是在近期临床研究中被广泛引用的标志物。
仅需一份血浆样本，研究人员即可对脱落进入血液循环的肿瘤DNA片段进行测序与分析。这种DNA被称为循环肿瘤DNA或ctDNA（circulating tumor DNA），MoCha的研究人员长期致力于寻找分析与检测ctDNA的解决方案。在对现有方案进行认真评估后，研究团队选择了因美纳的Illumina TruSight Oncology 500 ctDNA v2研究试剂盒以来进行全景变异分析。他们的研究摘要《NCI-MATCH 亚组分析：ctDNA匹配组织样本的全景变异检测在不符合纳入治疗组的少见癌种中的应用》已被本周在芝加哥举行的美国临床肿瘤学会（ASCO）年会接收，并由来自MoCha实验室的第一作者Bishu Das进行口头报告。
令人惊讶的是，NCI-MATCH试验中有60%的参与者患有罕见或不常见的癌症——除乳腺癌、结肠癌、直肠癌、前列腺癌或非小细胞肺癌等常见类型以外的癌种。在这些罕见癌症患者中，有2,194人拥有可用于液体活检检测的血浆样本。研究人员希望了解，通过液体活检（即简单的血液采样）是否也可以让这些患者符合治疗条件。在这一患者样本队列中，他们发现，组织样本测序检测中观察到的致癌突变中，有85.5%也可通过基于ctDNA的全景变异分析检测到。
在各类罕见癌症中，研究人员发现组织样本与血浆样本中肿瘤变异的一致性非常高。总体而言，在致癌突变检测方面，小细胞肺癌样本中观察到的组织与血浆变异一致性为98.1%，食管癌患者为96%，而胆管癌为94.6%。此外，一些具有研究价值的生物标志物仅通过ctDNA才得以发现——例如，在胆管癌患者队列中，有7例样本被检测为微卫星不稳定性高（MSI-high），另有8例样本发现了FGFR2融合。这些生物标志物在最初的组织样本测序中并未被检测到。
“ctDNA检测取得了成功，在96%的样本中获得了可用于分析的测序结果，这一点尤为关键，因为本研究涵盖的癌症类型多种多样，不同样本中的ctDNA产量也存在差异。” 因美纳副总裁兼临床解决方案负责人、研究共同作者Traci Pawlowski表示，“这些患者血浆中具有足够的ctDNA含量和足够高的肿瘤DNA比例，可以通过液体活检参与临床试验评估。”
肿瘤组织活检往往非常困难且具有创伤性，而且病理学家通常也无法获得足够的组织样本。Pawlowski表示，液体活检是一种更加可及且可靠的选择：“所有肿瘤科医生都知道组织样本会是一个限制。尽管业内有句行话——‘组织样本才是关键问题（Tissue is the issue）’，他们对液体活检仍有顾虑，担心因为检测的并非真实肿瘤组织，会漏掉某些关键标志物。而本研究表明，通过微创采血进行的ctDNA检测能够提供足够的信息，让患者入组精准医学临床试验。”此外，她认为，这类研究将增强医生在使用ctDNA评估转移性癌症患者时的信心。“这类研究也有助于药物的发现与开发——我们的制药合作伙伴都会收集液体活检样本，因为组织样本稀缺，常常难以满足检测需求。”
MoCha的研究人员得出结论，基于ctDNA的全景基因组分析应被视为未来NCI主导临床试验中一种可行的筛查手段。
在NCI试验之外，Pawlowski表示，ctDNA代表了肿瘤患者未来的发展方向，而验证其临床价值是推动其在临床中被广泛应用和落地的关键。液体活检不仅有助于为转移性癌症患者匹配治疗方案，在分子残留病灶（MRD）检测中也发挥着核心作用，同时还能显著提升患者接受精准治疗的整体可及性。
本次ASCO年会共接收了9篇由因美纳专家撰写或参与撰写的研究摘要，涵盖的主题包括晚期肺癌患者的医疗资源使用和成本、以及子宫内膜癌中的免疫基因表达模式等。◆
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