简介
Beck's Hybrids公司成立于1937年,是美国最大的家族所有制种子零售公司,为中西部和周边地区的农民提供服务。Beck's在农业和杂交开发领域拥有100多年的历史,该公司致力于帮助农民控制某些与农业相关的未知因素,以提高作物的质量和产量。Beck's与育种人员合作,通过使用双单倍体技术和全基因组选择来整合所需的性状。与其他的种子公司不同,Beck's一直拒绝向缺乏“农民到农民”服务的大公司出售产品,这已经成为该公司的标志性特点。作为一个相对较小的团体,Beck's创造性地利用了自身的资源。该公司最近加强了研究业务,聘请了一名实验室经理,并开始使用BaseSpace Clarity实验室信息管理系统(LIMS)来优化实验室的工作流程。
Jenni Taller是Beck's Hybrids的实验室经理,该公司的总部位于印第安纳州亚特兰大。
了解当前的情况
新聘请的实验室经理Jenni Taller所在的部门只有她一个人,她必须快速有效地工作。她需要将实验室有序地组织起来,并为样本量的大幅增长做好准备。Taller建立了一个她认为很“美丽”的电子表格系统,但这个系统很快就无法进行搜索了。信息也在快速发展,电子表格式的工作流程完全跟不上它的增长速度。Taller回忆说,他们从育种人员那里会收到各种格式的样本信息,她必须调整数据的格式才能使其与电子表格的格式保持一致。一段时间后,她意识到她在电脑前花了太多时间,而要想把资源有限的实验室组织起来的最佳方法是购买LIMS。
为了指导LIMS的采购计划,Beck's实验室团队罗列一系列的需求。他们想要的LIMS必须能帮助他们全程追踪样本,并能保持良好的记录以便进行材料比较。由于Beck's精简的运营,它还必须易于管理、定制和维护。同时Taller还希望进行无纸化办公。"我不喜欢砍伐树木,破坏环境!”Taller强调道。除了这些重要的要求以外,Beck's想要购买的系统还必须经济实惠。最终,他们选择了BaseSpace Clarity LIMS。
BaseSpace Clarity LIMS能让Beck's的小型研究实验室以最佳的种子质量、实际性能和服务来造福农民。
播下成功的种子
在Beck's,时间是按照种植季节来计算的,主要是玉米、大豆、小麦、苜蓿和覆盖作物的种植季节。任何时候停产都有可能影响整个种植季节。因此,我们必须尽快启动并运行BaseSpace Clarity LIMS。
标准的BaseSpace Clarity LIMS实施方案会有一个专门的团队来负责部署该系统。现场应用专家(FAS)是该团队的重要成员。在部署BaseSpace Clarity LIMS之前,FAS就已经与Taller进行了会面,了解了团队的工作流程和需求。正式部署时,FAS帮助Taller建立了初始的工作流程,并立即进行了培训。根据Taller的说法,他们在两周内就可以正式操作了。
克服挑战
Beck's的旅程并非一帆风顺,但是BaseSpace Clarity LIMS可以帮助他们应对挑战。LIMS部署完成后不久,实验室主要使用的检测试剂盒就停产了。Beck's联系了他们的育种人员,并告知了这一消息。他们一致决定使用已停用的样本试剂盒,以期获得更多的样本信息以及更高的样本通量。几天之内,Beck's决定使用Illumina Infinium® Maize LD BeadChip。标准的BaseSpace Clarity LIMS预先配置了包括Infinium在内的40多种工作流程。新的样本很快就会送到Beck's,因此该团队迅速在BaseSpace Clarity LIMS中建立了一个新的工作流程,并在一周内投入使用。
开创美好未来
在接下来的一年里,Beck's计划将其样本通量提高至三倍,并期望能高效地处理更多样本,为农民客户生成宝贵的基因型数据。Beck's认为他们的顺利扩张要归功于BaseSpace Clarity LIMS以及Illumina提供的大力支持。
为了适应样本处理量的大幅增长,Beck's雇用了更多的实验工作人员。Beck's实验室团队表示BaseSpace Clarity LIMS的工作流程和样本管理让培训过程变得简单明了。
BaseSpace Clarity LIMS为Beck's Hybrids带来了哪些优势:
出色的样本追踪
据Taller所说,她“生活在操作界面中”。如果有人问她样本#12,003是否运行过,她可以在BaseSpace Clarity LIMS中快速查找样本,然后查看样本从采集到结果的历史记录,包括何时以及由谁进行了处理。追踪样本的能力还帮助Taller实现了无纸化办公。
经济实惠的LIMS解决方案
Beck's的主要诉求之一是获得经济实惠的LIMS解决方案,而BaseSpace Clarity LIMS满足了这一点。
易于设置、扩展和管理
Taller对“黑屏和学习编写代码”不感兴趣,而使用BaseSpace Clarity LIMS则没有这些问题。界面易于设置,经过授权的实验室人员即使不具备软件编程知识也可更改工作流程。Beck's还在Illumina支持团队的帮助下,使用应用程序接口(API)扩展了系统。
强有力的支持
从部署前期到日常使用,以及其间发生的所有情况,Illumina支持团队都能提供帮助。使用BaseSpace Clarity LIMS时,Taller感觉“只需要给Illumina打一个电话,我们面临的任何问题或挑战就迎刃而解了。”
了解更多关于本文所提及Illumina产品的信息:
MaizeLD BeadChip Kit, www.illumina.com/products/by-type/microarray-kits/maize-ld.html